Iris cryptoruthenica sp. nov. (Iridaceae): криптический вид морфотипа Iris ruthenica, выявленный баркодированием хлоропластной и рибосомальной ДНК и методами кариосистематики
УДК 582.579.2:581.961+577.21
Аннотация
Iris ruthenica – сибирский таёжно-степной вид, чья генетическая структура оставалась малоизученной. В ходе исследования I. ruthenica флоры Алтайской горной страны мы обнаружили криптический вид, морфологически неотличимый от I. ruthenica s. str., но отличающийся числом хромосом. Все изученные российские популяции I. ruthenica имеют 2n = 84, тогда как криптический вид обладает 2n = 42; данные проточной цитометрии показывают различие в размере генома (1C = 4,025 ± 0,110 pg против 1C = 2,135 ± 0,020 pg). Сравнительный анализ участков хлоропластной ДНК, охватывающих интервалы atpB–accD и rpl2–matK (включая гены atpB, accD, psbA, rbcL, rpl2, rps19, matK и ycf1) выявил, что генетическое расстояние между двумя линиями составляет около 0,5 %, что сопоставимо с расстоянием между некоторыми видами рода. Полиморфизм ядерной рДНК (18S–ITS1–5.8S–ITS2–28S) также подтверждает их генетическую обособленность. Внутри I. ruthenica на основании хлоропластной ДНК выявлено несколько гаплотипов, однако ни один из них не соотносится с разновидностями (var. nana, var. brevituba) или близкородственным видом I. uniflora. Несмотря на отсутствие диагностических морфологических различий, полученные молекулярные данные подтверждают эволюционную самостоятельность криптического вида, который мы описываем здесь как I. cryptoruthenica. Согласно имеющимся данным, его ареал включает Алтайскую горную страну и северные провинции Китая (Синьцзян).
Скачивания
Литература
Алексеева Н. Б. Род Iris L. (Iridaceae) в России // Turczaninowia, 2008. T. 11, № 2. С. 5–68.
APG (The Angiosperm Phylogeny Group). 2016. An update of the APG classification for the orders and families of flowering plants: APG IV. Bot. J. Linnean Soc. 181(1): 1–20. https://doi.org/10.1111/boj.12385
Belyakov E. A., Mikhaylova Y. V., Machs E. M., Zhurbenko P. M., Rodionov A. V. 2022. Hybridization and diversity of aquatic macrophyte Sparganium L. (Typhaceae) as revealed by high-throughput nrDNA sequencing. Sci. Rep. 12: 21610. https://doi.org/10.1038/s41598-022-25954-0
Bennett C., Aime M. C., Newcombe G. 2011. Molecular and pathogenic variation within Melampsora on Salix in western North America reveals numerous cryptic species. Mycologia 103: 1004–1018. https://doi.org/10.3852/10-289
Bickford D., Lohman D. J., Sodhi N. S., Ng P. K. L., Meier R., Winker K., Ingram K. K., Das I. 2007. Cryptic species as a window on diversity and conservation. Trends Ecol. Evol. 22: 148–155. https://doi.org/10.1016/j.tree.2006.11.004
Bravo G. A., Remsen J. V. Jr., Brumfield R. T. 2014. Adaptive processes drive ecomorphological convergent evolution in antwrens (Thamnophilidae). Evolution 68(10): 2757–2774. https://doi.org/10.1111/evo.12506
Brown E. M., McTaggart L. R., Zhang S. X., Low D. E., Stevens D. A., Richardson S. E. 2013. A cryptic species Blastomyces gilchristii sp. nov. within Blastomyces dermatitidis. PLOS ONE 8(3): e59237. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0059237
Burki F., Roger A. J., Brown M. W., Simpson A. G. B. 2020. The new tree of eukaryotes. Trends Ecol. Evol. 35(1): 43–55. https://doi.org/10.1016/j.tree.2019.08.008
Bustamante D. E., Oliva M., Leiva S., Mendoza J. E., Bobadilla L., Angulo G., Calderon M. S. 2019. Phylogeny and species delimitations in Beauveria, including B. peruviensis sp. nov. MycoKeys 58: 47–68. https://doi.org/10.3897/mycokeys.58.35764
Cerca J., Meyer C., Stateczny D., Siemon D., Wegbrod J., Purschke G., Dimitrov D., Struck T. H. 2020. Deceleration of morphological evolution in a cryptic species complex and its link to paleontological stasis. Evolution 74(1): 116–131. https://doi.org/10.1111/evo.13884
Chase M. W., Albert V. A. 1998. A perspective on the contribution of plastid rbcL to angiosperm phylogenetics. In: Molecular Systematics of Plants II. Boston: Springer. Pp. 488–507. https://doi.org/10.1007/978-1-4615-5419-6_17
Chepinoga V. V., Barkalov V. Yu., Ebel A. L., Knyazev M. S., Baikov K. S., Bobrov A. A., et al. 2024. Checklist of vascular plants of Asian Russia. Bot. Pacifica. 13, S3: 3–310. https://doi.org/10.17581/bp.2024.13S01
Chepinoga V. V., Gnutikov A. A., Enushchenko I. V. 2010. In: K. Marhold (ed.). IAPT/IOPB chromosome data 9. Taxon 59(4): 1298–1299. https://doi.org/10.1002/tax.594047
Choi B., Park I., So S., Myeong H. H., Ryu J., Ahn Y. E., Shim K. C., Song J. H., Jang T. S. 2022. Comparative analysis of two Korean irises (Iris ruthenica and I. uniflora, Iridaceae) based on plastome sequencing and micromorphology. Sci. Rep. 12: 9424. https://doi.org/10.1038/s41598-022-13528-z
Choi B., Weiss-Schneeweiss H., Temsch E. M., So S., Myeong H.-H., Jang T.-S. 2020. Genome size and chromosome number evolution in Korean Iris L. species (Iridaceae). Plants 9: 1284. https://doi.org/10.3390/plants9101284
Choi T. Y., Lee S. R. 2024. Complete plastid genome of Iris orchioides and comparative analysis with 19 Iris plastomes. PLOS ONE 19(4): e0301346. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0301346
Clouse R. M., Wheeler W. C. 2014. Two cryptic species of Metasiro from South Carolina, USA. Zootaxa 3814(2): 177–201. https://doi.org/10.11646/zootaxa.3814.2.2
Cook L. G., Edwards R. D., Crisp M. D., Hardy N. B. 2010. Need morphology always be required for new species descriptions? Invertebr. Syst. 24(3): 322–326. https://doi.org/10.1071/IS10011
Danecek P., Bonfield J. K., Liddle J., Marshall J., Ohan V., Pollard M. O., Whitwham A., Keane T., McCarthy S. A., Davies R. M., Li H. 2021. Twelve years of SAMtools and BCFtools. GigaScience 10(2): giab008. https://doi.org/10.1093/gigascience/giab008
Darlington C. D. 1940. Taxonomic species and genetic systems. In: J. S. Huxley (ed.). The New Systematics. Oxford: University Press. Pp. 137–160.
Dayrat B. 2005. Towards integrative taxonomy. Biol. J. Linn. Soc. 85(3): 407–417. https://doi.org/10.1111/j.1095-8312.2005.00503.x
Delić T., Trontelj P., Rendoš M., Fišer C. 2017. The importance of naming cryptic species and the conservation of endemic subterranean amphipods. Sci. Rep. 7: 3391. https://doi.org/10.1038/s41598-017-02938-z
de Queiroz K. 2007. Species concepts and species delimitation. Syst. Biol. 56(6): 879–886. https://doi.org/10.1080/10635150701701083
Dimitrov D., Xu X., Su X., Shrestha N., Liu Y., Kennedy J. D. et al. 2023. Diversification of flowering plants in space and time. Nat. Commun.14: 7609. https://doi.org/10.1038/s41467-023-43396-8
Dong W., Xu C., Li C., Sun J., Zuo Y., Shi S., Cheng T., Guo J., Zhou S. 2015. ycf1, the most promising plastid DNA barcode of land plants. Sci. Rep. 5: 8348. https://doi.org/10.1038/srep08348
Доронкин В. М., Красников А. А. Цитотаксономические исследования некоторых сибирских видов рода Iris (Iridaceae) // Бот. журн., 1984. Т. 65, № 5. С. 683–685.
Edgar R. C. 2010. Search and clustering orders of magnitude faster than BLAST. Bioinformatics 26(19): 2460 2461. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btq461 (USEARCH and UCLUST algorithms)
Edgecombe G. D., Giribet G. 2008. A New Zealand species of the centipede order Craterostigmomorpha corroborated by molecular evidence. Invertebr. Syst. 22(1): 1–15. https://doi.org/10.1071/IS07036
Efimov P., Domashkina V., Machs E., Zhurbenko P. 2024. Evaluation of intragenomic polymorphism of ribosomal DNA ITS1 region in Taraxacum by targeted NGS sequencing. Turczaninowia 27, 3: 97–109. https://doi.org/10.14258/turczaninowia.27.3.10
Egea E., David B., Choné T., Laurin B., Féral J. P., Chenuil A. 2016. Morphological and genetic analyses reveal a cryptic species complex in Echinocardium cordatum and rule out stabilizing selection. Mol. Phylogenet. Evol. 94(Part A): 207–220. https://doi.org/10.1016/j.ympev.2015.07.023
Ekrt L., Holubová R., Trávníček P., Suda J. 2010. Species boundaries and frequency of hybridization in the Dryopteris carthusiana complex: a taxonomic puzzle resolved using genome size data. Am. J. Bot. 97: 1208–1219. https://doi.org/10.3732/ajb.0900206
Eriksson J. S., Blanco-Pastor J. L., Sousa F. D., Bertrand Y. J. K., Pfeil B. E. 2017. A cryptic species produced by autopolyploidy and subsequent introgression involving Medicago prostrata (Fabaceae). Mol. Phylogenet. Evol. 107: 367–381. https://doi.org/10.1016/j.ympev.2016.11.020
Felsenstein J. 1985. Confidence limits on phylogenies: An approach using the bootstrap. Evolution 39: 783–791.
Fišer C., Robinson C. T., Malard F. 2018. Cryptic species as a window into the paradigm shift of the species concept. Mol. Ecol. 27: 613–635. https://doi.org/10.1111/mec.14486
Flatscher R., García P. E., Hülber K., Sonnleitner M., Winkler M., Saukel J., Schneeweiss G. M., Schönswetter P. 2015. Underestimated diversity in one of the world’s best studied mountain ranges: The polyploid complex of Senecio carniolicus (Asteraceae) contains four species in the European Alps. Phytotaxa 213(1): 1–21. https://doi.org/10.11646/phytotaxa.213.1.1
Goldblatt P., Rodriguez A., Powell M., Davies J., Manning J., Bank M., Vincent S. 2008. Iridaceae ‘Out of Australasia’? Phylogeny, biogeography, and divergence time based on plastid DNA Sequences. Syst. Bot. 33(3): 495–508. https://doi.org/10.1600/036364408785679806
Gnutikov A. A., Nosov N. N., Loskutov I. G., Rodionov A. V., Shneyer V. S. 2025. Participation of wild species genus Avena L. (Poaceae) of different ploidy in the origin of cultivated species according to data on intragenomic polymorphism of the ITS1-5.8S rRNA region. Plants (Basel) 14(10): 1550. https://doi.org/10.3390/plants14101550
Halt M. N., Kupriyanova E. K., Cooper S. J. B., Rouse G. W. 2009. Naming species with no morphological indicators: species status of Galeolaria caespitosa (Annelida: Serpulidae) inferred from nuclear and mitochondrial gene sequences and morphology. Invertebr. Syst. 23(3): 205–222. https://doi.org/10.1071/IS09003
Harvey M. S., Berry O., Edward K. L., Humphreys G. 2008. Molecular and morphological systematics of hypogean schizomids (Schizomida: Hubbardiidae) in semiarid Australia. Invertebr. Syst. 22(2): 167–194. https://doi.org/10.1071/IS07026
He M.Q., Cao B., Liu F., Boekhout T., Denchev T., Schoutteten N. et al. 2024. Phylogenomics, divergence times and notes of orders in Basidiomycota. Fungal Divers. 26: 127–406. https://doi.org/10.1007/s13225-024-00535-w
Hending D. 2025. Cryptic species conservation: a review. Biol. Rev. 100: 258–274. https://doi.org/10.1111/brv.13139
Heylen O. C. G., Debortoli N., Marescaux J., Olofsson J. K. 2021. A Revised phylogeny of the Mentha spicata clade reveals cryptic species. Plants 10: 819. https://doi.org/10.3390/plants10040819
Irisarri I., Darienko T., Pröschold T. Fürst-Jansen J. M. R., Jamy M., de Vries J. 2021. Unexpected cryptic species among streptophyte algae most distant to land plants. Proc. Biol. Sci. 288(1963): 20212168. https://doi.org/10.1098/rspb.2021.2168
Jörger K. M., Schrödl M. 2013. How to describe a cryptic species? Front. zool. 10(1): 59. https://doi.org/10.1186/1742-9994-10-59
Judd W. S, Soltis D. E., Soltis P. S, Iontas G. 2007. Tolmiea diplomenziesii: a new species from the Pacific Northwest and the diploid sister taxon of the autotetraploid T. menziesii (Saxifragaceae). Brittonia 59(3): 217–225. https://doi.org/10.1663/0007-196X(2007)59[217:TDANSF]2.0.CO;2
Katoh K., Standley D. M. 2013. MAFFT multiple sequence alignment software version 7: improvements in performance and usability. Mol. Biol. Evol. 30(4): 772–780. https://doi.org/10.1093/molbev/mst010
Kon T., Yoshino T., Mukai T., Nishida M. 2007. DNA sequences identify numerous cryptic species of the vertebrate: a lesson from the gobioid fish Schindleria. Mol. Phylogen. Evol. 44: 53–62. https://doi.org/10.1016/j.ympev.2006.12.007
Krivenko D. A., Kazanovsky S. G., Vinogradova Yu. K., Verkhozina A. V., Knyazev M. S., Murtazaliev R. A. 2017. In: K. Marhold, J. Kučera (eds.). IAPT/IOPB chromosome data 26. Taxon 66(6): 1491–1492. https://doi.org/10.12705/666.30
Krivenko D. A., Kotseruba V. V., Kazanovsky S. G., Verkhozina A. V., Chernova O. D. 2013. In: K. Marhold (ed.). IAPT/IOPB chromosome data 16. Taxon 62(6): 1355–1357. https://doi.org/10.12705/626.41
Laumer C. E., Fernández R., Lemer S., Combosch D., Kocot K. M., Riesgo A., Andrade S. C. S., Sterrer W., Sørensen M. V., Giribet G. 2019. Revisiting metazoan phylogeny with genomic sampling of all phyla. Proc. Biol. Sci. 286: 20190831. https://doi.org/10.1098/rspb.2019.0831
Lex A., Gehlenborg N., Strobelt H., Vuillemot R., Pfister H. 2014. UpSet: visualization of intersecting sets. IEEE Trans Vis Comput Graph 20(12): 1983–1992. https://doi.org/10.1109/TVCG.2014.2346248
Li H. 2013. Aligning sequence reads, clone sequences and assembly contigs with BWA-MEM. arXiv 1303.3997v2.
Li H. T., Luo Y., Gan L., Ma P. F., Gao L. M., Yang J. B. et al. 2021. Plastid phylogenomic insights into relationships of all flowering plant families. BMC Biol. 19: 232. https://doi.org/10.1186/s12915-021-01166-2
Maia V. H., Gitzendanner M. A., Soltis P. S., Wong G. K., Soltis D. E. 2014. Angiosperm phylogeny based on 18S/26S rDNA sequence data. Int. J. Pl. Sci. 175(6): 613–650. https://doi.org/10.1086/676675
Martynenko N., Gusev E., Kapustin D., Kulikovskiy M. 2022. A new cryptic species of the genus Mychonastes. Plants 11: 3363. https://doi.org/10.3390/plants11233363
Mathew B. 1997. Subgenus Scorpiris. In: Species Group of the British Iris Society (ed.). A guide to species irises: their identification and cultivation. Cambridge: Cambridge University Press. Pp. 225–278.
Maurya S., Sukhramani G., Lee C. Jo S, Kim J., Jeong E. J., Zamora N. A., Garcia R., Zhang Z., Choi S., Choudhary R. K., Kim S. Y. 2025. Comparative plastome evaluation and phylogenomics in Malvaceae. Sci. Rep. 15: 24285. https://doi.org/10.1038/s41598-025-07744-6
Mavrodiev E. V., Martínez-Azorín M., Dranishnikov P., Crespo M. B. 2014. At least 23 genera instead of one: the case of Iris s. l. PLOS ONE 9(8): e106459. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0106459
Mayr E. 1942. Systematics and the Origin of Species. New York: Columbia Univ. Press. 334 pp.
McLeod D. S. 2010. Of least concern? Systematics of a cryptic species complex: Limnonectes kuhlii (Amphibia: Anura: Dicroglossidae). Mol. Phylogenet. Evol. 56: 991–1000. https://doi.org/10.1016/j.ympev.2010.04.004
McPherson V. J., Gillings M. R., Ghaly T. M. 2025. Diverse, cryptic, and undescribed: club and coral fungi in a temperate. Australian forest. J. Fungi. 11: 502. https://doi.org/10.3390/ jof11070502
Mose L. E., Wilkerson M. D., Hayes D. N., Perou C. M., Parker J. S. 2014. ABRA: improved coding indel detection via assembly-based realignment. Bioinformatics 30(19): 2813–2815. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btu376
Murphy N. P., King R. A., Delean S. 2015. Species, ESUs or populations? Invertebr. Syst. 29(5): 457–467. https://doi.org/10.1071/IS14036
Müntzing A. 1936. The evolutionary significance of autopolyploidy. Hereditas. 21(2–3): 363–378. https://doi.org/10.1111/j.1601-5223.1936.tb03204.x
Onut-Brännström I., Johannesson H., Tibell L. 2018. Thamnolia tundrae sp. nov., a cryptic species and putative glacial relict. The Lichenologist 50(1): 59–75. https://doi.org/10.1017/S0024282917000615
Pellicer J., Hidalgo O., Dodsworth S., Leitch I. J. 2018. Genome size diversity and its impact on the evolution of land plants. Genes (Basel) 9(2): 88. https://doi.org/10.3390/genes9020088
Pfosser M., Amon A., Lelley T., Heberle-Bors E. 1995. Evaluation of sensitivity of flow cytometry in detecting aneuploidy in wheat using disomic and ditelosomic wheat-rye addition lines. Cytometry A 21(4): 387–393. https://doi.org/10.1002/cyto.990210412
Prančl J., Kaplan Z., Trávníček P., Jarolímová V. 2014. Genome size as a key to evolutionary complex aquatic plants: polyploidy and hybridization in Callitriche (Plantaginaceae). PLOS ONE 9(9): e105997. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0105997
Probatova N. S. 2006. Chromosome numbers of plants of the Primorye Territory, the Amur River basin and Magadan Region. Bot. Zhurn. 91(3): 491–509. [In Russian] (Пробатова Н. С. Числа хромосом растений Приморского края, бассейна Амура и Магаданской области // Бот. журн., 2006. Т. 91, № 3. С. 491–509).
Probatova N. S., Barkalov V. Yu., Rudyka E. G., Tzyrenova D. Yu., Seledets V. P. 2012a. In: K. Marhold (ed.). IAPT/IOPB chromosome data 14. Taxon 61(6): 1341–1342. https://doi.org/10.1002/tax.616027
Probatova N. S., Kazanovsky S. G., Barkalov V. Yu., Rudyka E. G., Shatokhina A. V. 2015. In: K. Marhold (ed.). IAPT/IOPB chromosome data 20. Taxon 64(6): E30–E32. https://doi.org/10.12705/646.42
Probatova N. S., Kazanovsky S. G., Rudyka E. G., Seledets V. P., Nechaev V. A. 2012b. In: K. Marhold (ed.). IAPT/IOPB chromosome data 14. Taxon 61(6): 1342–1344. https://doi.org/10.1002/tax.616027
Probatova N. S., Rudyka E. G., Seledets V. P., NechaevV. A. 2008. In: K. Marhold (ed.). IAPT/IOPB chromosome data 6. Taxon 57(4): 1268–1271. https://doi.org/10.1002/tax.574017
Punina E. O., Nosov N. N., Myakoshina Y. A., Rodionov A. V., Gnutikov A. A., Shmakov A. I., Olonova M. V. 2016. New octoploid Catabrosa (Poaceae) species from Altai. Kew Bull. 71(3): 35. https://doi.org/10.1007/s12225-016-9646-5
Renner S. S. 2016. The use of DNA characters in the formal naming of species. Syst. Biol. 65(6): 1086–1095. https://doi.org/10.1093/sysbio/syw032
Rideout J. R., Bolyen E., McDonald D., Baeza Y., V, Alastuey J. C., Pitman A. et al. 2025. Scikit-bio 0.7.1.post1. Zenodo. https://doi.org/10.5281/zenodo.17487690
Robinson J., Thorvaldsdóttir H., Winckler W., Guttman M., Lander E. S., Getz G., Mesirov J. P. 2011. Integrative genomics viewer. Nat. Biotechnol. 29: 24–26. https://doi.org/10.1038/nbt.1754
Rodionov A. V., Amosova A., Belyakov E., Zhurbenko P., Mikhaylova Y., Punina E., Shneyer V., Loskutov I., Muravenko O. 2019. Genetic consequences of interspecific hybridization, its role in speciation and phenotypic diversity of plants. Russ. J. Genet. 55(3): 278–294. https://doi.org/10.1134/S1022795419030141
Ronquist F., Teslenko M., Mark P., Ayres D., Darling A., Höhna S., Larget B., Liu L., Suchard M., Huelsenbeck J. 2012. MrBayes 3.2: Efficient Bayesian phylogenetic inference and model choice across a large model space. Systematic Biology 61: 539–542. https://doi.org/10.1093/sysbio/sys029
Schüßler D., Blanco M. B., Guthrie N. K., Sgarlata G. M., Dammhahn M., Ernest R. et al. 2024. Morphological variability or inter-observer bias? Am. J. Biol. Anthrop. 183(1): 60–78. https://doi.org/10.1002/ajpa.24836
Shatokhina T. A. 2006. Chromosome numbers of some plants of the Amur Region flora. Bot. Zhurn. 91(3): 487–490. [In Russian] (Шатохина Т. А. Числа хромосом некоторых растений флоры Амурской области // Бот. журн., 2006. Т. 91, № 3. С. 487–490).
Shen J., Zhang X., Landis J. B., Zhang H., Deng T., Sun H., Wang H. 2020. Plastome evolution in Dolomiaea using phylogenomic and comparative analyses. Front. Plant Sci. 11: 376. https://doi.org/10.3389/fpls.2020.00376
Shen Y., Wang Z., Guan K. 2007. Karyotypical studies on thirteen Iris plants from China. J. Syst. Evol. 45(5): 601 618. https://doi.org/10.1360/aps06064
Shneyer V. S., Kotseruba V. V. 2015. Cryptic species in plants and their detection by genetic differentiation between populations. Russ. J. Genet. 5(5): 528–541. https://doi.org/10.1134/S2079059715050111
Шнеер В. С., Пунина Е. О., Родионов А. В. Внутривидовые различия в плоидности у покрытосеменных и их таксономическая интерпретация // Бот. журн., 2018. Т. 103, № 5. С. 555–585.
Simpson G. G. 1951. The species concept. Evolution 5: 285–298.
Skaptsov M. V., Kutsev M. G., Smirnov S. V., Vaganov A. V., Uvarova O. V., Shmakov A. I. 2024. Standards in plant flow cytometry: an overview, polymorphism and linearity issues. Turczaninowia 27, 2: 86–104. https://doi.org/10.14258/turczaninowia.27.2.10
Sokoloff D. D., Marques I., Macfarlane T. D., Remizowa M. V., Lam V. K. Y., Pellicer J., Hidalgo O., Rudall P. J., Graham S. W. 2019. Cryptic species in an ancient flowering-plant lineage (Hydatellaceae, Nymphaeales) revealed by molecular and micromorphological data. Taxon 68(1): 1–19. https://doi.org/10.1002/tax.12026
Soltis P. S., Soltis D. E., Wolf P. G., Nickrent D. L., Chaw S. M., Chapman R. L. 1999. The phylogeny of land plants inferred from 18S rDNA sequences. Mol. Biol. Evol. 16(12): 1774–1784. https://doi.org/10.1093/oxfordjournals.molbev.a026089
Stamatakis A. 2014. RAxML version 8: A tool for phylogenetic analysis and post-analysis of large phylogenies. Bioinformatics 30: 1312–1313.
Stayton C. T. 2006. Testing hypotheses of convergence with multivariate data. Evolution 60(4): 824–841.
Степанов Н. В., Муратова Е. Н. Хромосомные числа некоторых таксонов высших растений Красноярского края // Бот. журн., 1995. Т. 80, № 6. С. 114–116.
Strand M., Sundberg P. 2011. A DNA-based description of a new Nemertean species. Marine Biology Research 7(1): 63–70. https://doi.org/10.1080/17451001003713563
Struck T. H., Feder J. L., Bendiksby M., Birkeland S., Cerca J., Gusarov V. I. et al. 2018. Finding evolutionary processes hidden in cryptic species. Trends Ecol. Evol. 33(3): 153–163. https://doi.org/10.1016/j.tree.2017.11.007
Swift H. F., Gómez Daglio L., Dawson M. N. 2016. Three routes to crypsis: stasis, convergence, and parallelism in the Mastigias species complex. Mol. Phyl. Evol. 99: 103–115. https://doi.org/10.1016/j.ympev.2016.02.013
Tayier G., Hasimu D., Aishan T., Yimingniyazi A. 2024. Impact of a heterogeneous environment on the population expansion of Iris ruthenica in high mountain grasslands. Front. Plant Sc. 15: 1363496. https://doi.org/10.3389/fpls.2024.1363496
Techaprasan J., Klinbunga S., Kanlayanapaphon C., Jenjittikul T. 2010. Genetic variation of Kaempferia in Thailand based on chloroplast DNA sequences (psbA-trnH, petA-psbJ). Genet. Mol. Res: GMR 9: 1957–1973. https://doi.org/10.4238/vol9-4gmr873
Tillie N., Chase M. W., Hall T. 2000. Molecular studies in the genus Iris L.: a preliminary study. Ann. Bot. (Roma) 58: 105–112. https://doi.org/10.4462/annbotrm-9068
Van der Auwera G. A., O'Connor B. D. 2020. Genomics in the Cloud: Using Docker, GATK, and WDL in Terra. Sebastopol, CA: O'Reilly Media. 467 pp.
Wang Y., Zhou Q. S., Qiao H. J., Zhang A. B., Yu F., Wang X. B., Zhu C. D., Zhang Y. Z. 2016. Formal nomenclature and description of cryptic species of the Encyrtus sasakii complex. Sci. Rep. 6: 34372. https://doi.org/10.1038/srep34372
Wheeler A. S., Wilson C. A. 2014. Exploring phylogenetic relationships in a Northern Hemisphere group of semi-aquatic Iris. Syst. Bot. 39(3): 759–766. https://doi.org/10.1600/036364414X681482
Wiens J. J., Ackerly D. D., Allen A. P., Anacker B. L., Buckley L. B., Cornell H. V. et al. 2010. Niche conservatism as an emerging principle in ecology and conservation biology. Ecol. Lett. 13(10): 1310–1324. https://doi.org/10.1111/j.1461-0248.2010.01515.x
Wiley E. O. 1981. Remarks on Willis' species concept. Syst. Zool. 30: 86–87.
Wilson C. A. 2004. Phylogeny of Iris based on chloroplast matK and trnK intron. Mol. Phyl. Evol. 33: 402–412. https://doi.org/10.1016/j.ympev.2004.06.013
Wilson C. A. 2011. Subgeneric classification in Iris re-examined using chloroplast sequence data. Taxon 60: 27–35. https://doi.org/10.1002/tax.601004
Wilson C. A., Guo J. 2013. Molecular phylogenetic study of the crested Iris based on five plastid markers. Syst. Bot. 38: 987–995.
Wilson C. A., Padiernos J., Sapir Y. 2016. The royal irises: plastid and low-copy nuclear data. Taxon 65: 35–46. https://doi.org/10.12705/651.3
Zhao Y., Noltie H. J., Mathew B. 2002. Iridaceae A. L. Jussieu. In: Flora of China (eFloras). St. Louis: Missouri Botanical Garden, Cambridge: Harvard University Herbaria. URL: http://www.efloras.org (Accessed November 2025).
Zheng Y., Meng T., Bi X., Lei J. 2017. Investigation and evaluation of wild Iris resources in Liaoning Province, China. Genet. Res. Crop Evol. 64: 967–978. https://doi.org/10.1007/s10722-016-0418-8
Zhurbenko P. M., Badaeva E. D., Alexeeva N. B., Kotseruba V. V. 2023. In: K. Marhold, J. Kučera (eds.). IAPT chromosome data 41. Taxon 72(6): 1396. https://doi.org/10.1002/tax.13104
Ziegler A., Li X., Wiens J. 2025. The evidence for new species across the Tree of Life: Morphology still rules the largest kingdoms. BSSB 4(1). https://doi.org/10.18061/bssb.v4i1.10466
Zuntini A. R., Carruthers T., Maurin O., Bailey P. C., Leempoel K., Brewer G. E., et al. 2024. Phylogenomics and the rise of the angiosperms. Nature 629: 843–850. https://doi.org/10.1038/s41586-024-07324-0
Уведомление об авторских правах
Turczaninowiа является "золотым издателем", так как мы позволяем самоархивирование, но самое главное, мы полностью прозрачны в своих правах.
Авторы могут представить и обсудить свои выводы перед публикацией: в биологических или научных конференций, на допечатной серверах, в общедоступных базах данных, а также в блогах, вики, твиттерах и другие неформальных каналах связи.
Turczaninowiа позволяет авторам внести рукописи (находящуюся в настоящее время на рассмотрении или тех, которые предполагается предоставить в Turczaninowia) для архивирования в некоммерческих, допечатных серверах, таких как ArXiv.
Авторы, публикующиеся в этом журнале согласны со следующими условиями: авторы сохраняют свои авторские права и предоставляют журналу право первой публикации в связи с работой, которая одновременно распространяется по лицензии Creative Commons Attribution и позволяют другим иметь доступ к работе с признанием авторства этой работы и первоначальной публикацией в этом журнале. Авторы могут заключать отдельные, дополнительные договорные соглашения по неисключительному распространению опубликованной версии (например, разместить ее в институтском репозитории или опубликовать в книге), с признанием ее первоначальной публикации в этом журнале.
Авторам разрешается и рекомендуется размещать их работу в Интернете (например, в институциональных хранилищах или на их сайте) до и во время процесса подачи, так как это может привести к продуктивным обменам, а также увеличению цитирования опубликованных работ (см. Политика открытого доступа)
Политика открытого доступа.
Заявление о конфиденциальности
Имена и адреса электронной почты, поданные при публикации в этом журнале, сайт будет использоваться исключительно для заявленных целей данного журнала, и они не будут доступны для любых других целей или какой-либо другой стороне.
Наша публикационная этика журнала основана, в значительной степени, на руководящих принципах и стандартах, разработанных Комитетом по этике публикации (COPE). Соответствующие обязанности и права авторов, рецензентов и редакторов журнала изложены ниже.
ОБЯЗАННОСТИ АВТОРОВ
Отправляя рукопись "Turczaninowia", автор (ы) гарантирует, что они отправляют рукопись как свою собственную, оригинальную работу, и что она не имеет ни были опубликованы ранее, и в настоящее время не рассматривается для публикации в других изданиях. Они также гарантируют, что источники каких-либо идей и / или слов в рукописи, которые не являются их собственными, были должным образом приписаны с помощью соответствующего цитирования.
Автор обычно не должен издавать рукописи, описывающие по существу те же исследования, в нескольких журналах или прочих публикациях. Такая избыточная публикация обычно считается неэтичным поведением, и в случае обнаружения, может привести к отклонению рассматриваемой рукописи рассматриваемого отвергаются, или опубликованная статья будет изъята.
Авторы рукописей, освещающих оригинальные исследования должны представить точный отчет о выполненной работе, в сопровождении объективного обсуждения его значения. Основополагающие данные должны быть представлены точно и полно в рукописи. Рукопись должна содержать достаточно подробные данные и ссылки, чтобы позволять другим дублировать работу. Подтасовка результатов и изготовление поддельных или заведомо неточных утверждений является неэтичным поведением и может быть причиной для отклонения или изъятия рукописи или опубликованной статьи.
Там, где в статьях есть отчеты о использовании коммерческого программного обеспечения, аппаратных средств или других продуктов, авторы должны подать декларацию в начале рукописи, в которой они должны заявить, что никакого конфликта интересов не существует или описать характер любого потенциального конфликта. Все источники финансовой поддержки для исследования также должны быть раскрыты в рукописи.
Автор (ы) рукописи соглашаются, что, если рукопись принята к публикации в "Turczaninowia", опубликованная статья будет характьеризоваться авторскими правами с использованием "Attribution-Unported" лицензии Creative Commons. Эта лицензия позволяет автору (ам) сохранить авторские права, но и позволяет другим свободно копировать, распространять и отображать произведение и производные работы, основанные на ней, при определенных заданных условиях.
Имена авторов должны быть перечислены на статье в порядке их вклада в статью, и все авторы берут на себя ответственность за свои собственные результаты. Только те люди, которые внесли существенный вклад, должны быть перечислены в качестве авторов; те, чьи вклады являются косвенными или маргинальными (например, коллег или руководителей, которые рассмотрели проекты работы или оказывали помощь в корректуре, и руководители научно-исследовательских институтов / центров / лабораторий) должны быть названы в разделе «Выражение признательности» в конце статьи, непосредственно предшествующему Списку литературы.
Автор, подающий статью, должен обеспечить, чтобы все соавторы былм включены в статью, и что все соавторы видели и одобрили окончательный вариант статьи и согласились на его публикацию.
Там, где автор обнаруживает существенную ошибку или неточность в статье, которая была уже опубликована в "Turczaninowia", он / она обязана незамедлительно уведомить редакцию и сотрудничать с ними, чтобы исправить статью или отозвать ее в случае необходимости.
ОБЯЗАННОСТИ РЕЦЕНЗЕНТОВ
В журнале "Turczaninowia" рецензенты выполняют работу для журнала на добровольной основе. Учитывая, что большинство из этих людей находятся в полной занятости, их рецензирование для "Turczaninowia" должна выолняться по мере необходимости, а не быть их главным приоритетом. Рецензенты могут свободно отклонять приглашения для рассмотрения конкретных рукописей по своему усмотрению, например, если их текущая нагрузка, занятость и / или другие обязательства могут сделать ее непомерно высокой для того, чтобы завершить обзор своевременно и уделить должное время рецензированию. Они также не должны принимать рукописи на рецензию, в тематике которых они не чувствуют себя подходящим специалистом.
Рецензенты, которые приняли рукописи, как правило, должны предоставить свои рецензии в течение трех недель. Они должны отказаться от рецензии, если становится очевидным для них на любой стадии, что они не обладают необходимыми знаниями для выполнения рецензии, или что они могут иметь потенциальный конфликт интересов при проведении рецензии (например, в результате конкурентных исследований, совместных или других отношений или связей с кем-либо из авторов, учреждений или компаний, связанных с рукописью).
Информация или идеи, полученные рецензентами в процессе рецензирования должны храниться в тайне и не используются для личной выгоды. Любые рукописи, полученные для рассмотрения, должны рассматриваться как конфиденциальные документы, и не должны быть показаны или обсуждены с другими, если только это не санкционировано редакторами "Turczaninowia".
При проведении своих рецензий, рецензентам необходимо сделать это как можно более объективно, воздерживаться от участия в личной критики автора (ов). Им предлагается высказать свое мнение четко, объясняя и оправдывая все рекомендации. Они всегда должны пытаться представить подробную и конструктивную обратную связь, чтобы помочь автору (ам) в повышении эффективности их работы, даже если рукопись, по их мнению, не подлежит опубликованию.
Рецензенты должны определить в своих рецензиях соответствующие опубликованные работы, которые не были названы автором (ами), вместе с любыми примерами, где не было сделано надлежащее цитирование источников. Они должны привлечь внимание ответственного редактора в отношении каких-либо серьезных сходств между рукописью, поданной на рассмотрение и других опубликованных статей, или статей, о которых им известно, а также предотвратить любые проблемы, которые могут иметь место по отношению к этической приемлемости исследований, представленных в рукописи.
ОБЯЗАННОСТИ РЕДАКЦИИ
Редактор журнала "Turczaninowia" несет полную ответственность за решение о публикации рукописи, которая представляется в "Turczaninowia", и при этом руководствуется политикой журнала, и в соответствии с определенными редакцией "Turczaninowia" юридическими требованиями в отношении клеветы, нарушения авторских прав и плагиата. Редактор может проконсультироваться с заместителями Редактора и другими членами редакционной коллегии, а также с рецензентами, для принятии решений о публикации.
Редакция будет оценивать рукописи с точки зрения ее интеллектуального содержания без учета расы, цвета кожи, пола, сексуальной ориентации, религиозных убеждений, этнического происхождения, гражданства или политической философии автора (ов). Они не будут никому разглашать какую-либо информацию о рукописи, кроме автора (ов), рецензентов и потенциальных рецензентов, а в некоторых случаях членов редакционной коллегии "Turczaninowia" и членов команды управления журналом, в зависимости от обстоятельств. Кроме того, редакция будет прилагать все усилия, чтобы обеспечить целостность процесса слепого рецензирования, не раскрывая личности автора (ов) рукописи для рецензентам этой рукописи, и наоборот.
При оценке рукописи для публикации, в дополнение к рассмотрению стандартных критериев, относящихся к строгости рукописи, качеству ее предоставления, а также ее вклад в область научных знаний, редакторы также будут руководствоваться тем, насколько этические нормы были соблюдены, и вред был сведен к минимуму при проведении исследования. Они также оценивают насколько полученные научные и практические выгоды перевешивают вред в случае конкретного исследования.
Так как "Turczaninowia" приветствует предоставление рукописей из любой страны, необходимо признать, что законы и нормативные акты, касающиеся этики научных исследований и этического утверждения, различаются во всем мире. Таким образом, редакторам, возможно, придется обратиться за разъяснениями в связи с этим к автору (ам) с просьбой о том, чтобы они представили письмо от соответствующего институционального комитета по этике или совета, который одобрил исследование.
Редакция будет руководствоваться Руководством CORE для изъятия статей при рассмотрении любых спорных вопросов, которые были опубликованы в AASRJ. Редакторы готовы работать в тесном сотрудничестве с научно-исследовательскими организациями и учреждениями в соответствии с рекомендациями CORE о сотрудничестве между научно-исследовательскими институтами и журналами в области публикационной этики и этики проведения исследований.
"Turczaninowia" является журналом открытого доступа, что означает, что все его содержимое свободно и доступно бесплатно для пользователя или его / ее учреждения. Пользователи могут читать, загружать, копировать, распространять, печатать, выполнять поиск, делать ссылки на полные тексты статей в этом журнале, не спрашивая предварительного разрешения от издателя или автора. Это легитимно в соответствии с определением BOAI об открытом доступе.
Наш сайт демонстрирует знак Creative Commons, и это исключительное право автора, если он / она хочет, чтобы его / ее статьи были в свободном доступе или нет. Но мы должны опубликовать Резюме и метаданные статьи в полном доступе в любом случае.
