Структура популяции и генетическое разнообразие Ferula gummosa (Apiaceae) в Северном Хорасане, Иран: выводы с использованием морфологических и ISSR-маркеров
УДК 582.893:581.4+575.174(55)
Аннотация
В водоразделе Северного Хорасана (Иран) Ferula gummosa – многолетнее растение с глубокими корнями, присутствие которых стабилизирует текстуру почвы. Изучение молекулярных и морфологических характеристик вида имеет решающее значение для поиска эффективных методов его защиты и предотвращения его исчезновения. Ferula gummosa – вид, произрастающий в Иране, и важное лекарственное растение в иранской традиционной медицине. Морфологическое и генетическое разнообразие 6 популяций этого вида было изучено в Северном Хорасане. Многомерный статистический анализ был проведён по 15 количественным и качественным признакам, выбранным для биометрических и морфологических исследований. Для оценки генетического разнообразия использовали четыре праймера (ISSR13, ISSR826, ISSR810, ISSR7), что привело к получению 19 полос («бэндов»).
Согласно настоящему исследованию, морфологические признаки и молекулярные данные ISSR используются для дифференциации изучаемой популяции F. gummosa. Как количественные, так и качественные морфологические характеристики изучаемых видов могут быть использованы для дифференциации популяций. В настоящем исследовании была обнаружена высокая степень генетического разнообразия между популяциями. Используя морфологические и молекулярные данные, кластерный анализ WARD предоставил важную информацию о взаимоотношениях в сообществе. Основываясь на результатах настоящего исследования, существует высокая степень разнообразия между существующими экотипами F. gummosa. В связи с тем, что экотипы F. gummosa происходят из разных географических регионов, морфологическое разнообразие подтверждает, что морфологические различия между образцами обусловлены не только влиянием окружающей среды, но и генетическим влиянием.
Скачивания
Литература
Antonio A. F. G., Benchimol L. L., Barbosa A. M. M., Geraldi I. O., Souza C. L. 2004. Comparison of RAPD, RFLP, AFLP and SSR markers for diversity studies in tropical maize inbred lines. Gen. Mol. Bio. 27: 579– 588. https://doi.org/10.1590/S1415-47572004000400019
Elibol Z., Menemen Y., Sağiroğlu M., Duman H. 2012. A molecular phylogenetic study on some turkish Ferula l. (apiaceae) species using nrDNA ITS sequences. Pak. J. Bot. 44(2): 589–594.
Ellis R. P., Mcnicol J. W., Baird E., Booth A., Lawrence P. 1997. The use of AFLP to examine genetic relatedness in barley. Molecular Breeding 3: 359–369. https://doi.org/10.1023/A:1009602321815
Farsi M., Zolala J. 2003. Introduction to plant biotechnology. No. 392. Iran: Ferdowsi University of Mashhad publication. 495 pp.
Freeland J. R., Kirk H., Peterson S. D. 2011. Molecular Ecology. Second ed. UK: Wiley-Blackwell. 449 pp.
Ghahreman A. (1979–2003). Color flora of Iran. Tehran: Research Institute of Forests and Rangelands.
Hammer Q., Harper D. A. T., Ryan P. D. 2012. PAST: Paleontological Statistics software package for education and data analysis. Palaeontol. Electron. 4: 9.
Khounani Z., Naghavi M., Omidi M., Sabokdast M., Talebi Kohyakhi E. 2011. Assessment of Genetic Diversity in the Landraces of Ferula gummosa from Iran Using AFLP Marker. J. Med. Plants 10(38): 117–126.
Kurzyna-Młynik R., Oskolski A. A., Downie S. R., Kopacz R., Wojewódzka A., Spalik K. 2008. Phylogenetic position of the genus Ferula (Apiaceae) and its placement in tribe Scandiceae as inferred nrDNA ITS sequence variation. Plant Syst. Evol. 274: 47–66. https://doi.org/10.1007/s00606-008-0022-2
Melchinger A. E., Gumber R. K. 1999. Overview of heterosis and heterotic groups in agronomics crops. In: K. R. Lamkey, J. E. Stuber (eds.). Concepts and breeding of heterosis in crop plants. Madison, WI: CSSA. Pp. 29–43.
Messmer M. M., Melchinger A. A., Boppenmair J., Hermann R. G., Brunklaus-Jung E. 1992. RFLP analysis of early-maturing European maize germplasm. I. Genetic diversity among flint and dent inbreds. Theor. Appl. Genet. 83: 1003–1012. https://doi.org/10.1007/BF00232964
Minaeifar A., Sheidai M., Attar F. 2015. Genetic and morphological diversity in Cousinia cylindracea (Asteraceae) populations: Identification of gene pools. Biodiversitas 16: 288–294. https://doi.org/10.13057/biodiv/d160225
Minaeifar A., Sheidai M., Attar F., Noormohammadi Z., Ghasemzadeh-Baraki S. 2016. Biosystematic study in the genus Cousinia Cass. (Asteraceae), section Cousinia. Biochem. Syst. Ecol. 69(1): 252–260. https://doi.org/10.1016/j.bse.2016.10.008
Mozaffarian V. 1984. Plant of family of Umbelliferae in Iran. Vol. 35. Tehran: Research Institute of Forest and Rangelands Press.
Mustafina F., Lee H., Sharipova V., Lee A., Kim D., Choi M., Jang J., Kim Y. 2021. Comparative fruit morphology and its systematic significance in Ferula (Apiaceae) species from different growth habitats. Flora 283: 151899. https://doi.org/10.1016/j.flora.2021.151899
Nasrollahi F., Kazempour-Osaloo S., Amini E., Mozaffarian V. 2020. Morphological character evolution of Onosma (boraginaceae) in iran, based on nuclear and plastid DNA sequences. Iran. J. Bot. 26(1): 35–48. https://doi.org/10.22092/ijb.2020.127762.1256
Omid Bakhsh Fard M. A., Naghavi M. R., Mardi M., Bihamta M. R., Kazemi M., Pirseyedi S.M. 2009. A study of genetic diversity in Durum Wheat (Triticum turgidum) using microsatellite markers. Iranian agriculture sci. 2: 75–83.
Peakall R., Smouse P.E. 2006. GENALEX 6: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research. Mol. Ecol. Notes 6(1): 288–295. https://doi.org/10.1111/j.1471-8286.2005.01155.x
Podani J. 2000. Introduction to the Exploration of Multivariate Data. Leiden: Backhuyes. 407 pp.
Powell W., Morgante M., Andre C., Hanafey M., Vogel J., Tingey S., Rafalsky A. 1996. The comparison of RFLP, RAPD, AFLP and SSR markers for germplasm analysis. Molecular Breeding. 2: 225–238. https://doi.org/10.1007/BF00564200
Schneller J., Liebst B. 2007. Patterns of variation of a common fern (Athyrium filix-femina; Woodsiaceae). population structure along and between altitudinal gradients. Am. J. Bot. 94(1): 965–971. https://doi.org/10.3732/ajb.94.6.965
Sheidai M., Seif E., Nouroozi M., Noormohammadi Z. 2012. Cytogenetic and molecular diversity of Cirsium arvense (Asteraceae) populations in Iran. J. Jap. Bot. 87(2): 193–205.
Sheidai M., Zanganeh S., Haji-Ramezanali R., Nouroozi M., Noormohammadi Z., Ghasemzadeh-Baraki S. 2013. Genetic diversity and population structure in four Cirsium (Asteraceae) species. Biologia 68(1): 384−397. https://doi.org/10.2478/s11756-013-0162-x
Sheidai M., Ziaee S., Farahani F., Talebi S. M., Noormohammadi Z., Hasheminejad Ahangari Farahani Y. 2014. Infra-specific genetic and morphological diversity in Linumalbum (Linaceae). Biologia 69(2): 32–39. https://doi.org/10.2478/s11756-013-0281-4
Tahmasebi A., Nasrollahi F. 2021. Morphologic and genetic study of Halocnemum strobilaceum in rangeland ecosystems of Golestan province (north of Iran). Rostaniha 22: 134–146. https://doi.org/10.22092/botany.2021.355344.1260
Tahmasebi A., Nasrollahi F., Esmaeili M. M. 2023. Evaluation of molecular and morphological diversity of the rangeland species of Atriplex canescens (Amaranthaceae) in Iran. Acta Biologica Szeged. 67(1): 63–74. https://doi.org/10.14232/abs.2023.1.63-74
Talebi Kohyakhy E., Mohammad Aliha M., Naghavi M. R. 2008. Genetic diversity in Ferula gummosa Bioss. Populations of Iran using RAPD molecular markers. IJMAPR 23(4): 514–522.
Williams J. G. K., Kubelik A. R., Livak K. J., Rafalskiand J.A., Tingey S. V. 1990. DNA polymorphism mplified by arbitrary Primers are useful as genetic markers. Nucleic Acids Res.18(1): 6531–6535. https://doi.org/10.1093/nar/18.22.6531
Weising K., Nybom H., Wolf K., Kahl G. 2005. DNA fingerprinting in plants. Principles, methods and applications. 2nd ed. Boca Rayton, Florida, USA: CRC Press, Taylor & Francis Group. 444 pp. https://doi.org/10.1201/9781420040043
Уведомление об авторских правах
Turczaninowiа является "золотым издателем", так как мы позволяем самоархивирование, но самое главное, мы полностью прозрачны в своих правах.
Авторы могут представить и обсудить свои выводы перед публикацией: в биологических или научных конференций, на допечатной серверах, в общедоступных базах данных, а также в блогах, вики, твиттерах и другие неформальных каналах связи.
Turczaninowiа позволяет авторам внести рукописи (находящуюся в настоящее время на рассмотрении или тех, которые предполагается предоставить в Turczaninowia) для архивирования в некоммерческих, допечатных серверах, таких как ArXiv.
Авторы, публикующиеся в этом журнале согласны со следующими условиями: авторы сохраняют свои авторские права и предоставляют журналу право первой публикации в связи с работой, которая одновременно распространяется по лицензии Creative Commons Attribution и позволяют другим иметь доступ к работе с признанием авторства этой работы и первоначальной публикацией в этом журнале. Авторы могут заключать отдельные, дополнительные договорные соглашения по неисключительному распространению опубликованной версии (например, разместить ее в институтском репозитории или опубликовать в книге), с признанием ее первоначальной публикации в этом журнале.
Авторам разрешается и рекомендуется размещать их работу в Интернете (например, в институциональных хранилищах или на их сайте) до и во время процесса подачи, так как это может привести к продуктивным обменам, а также увеличению цитирования опубликованных работ (см. Политика открытого доступа)
Политика открытого доступа.
Заявление о конфиденциальности
Имена и адреса электронной почты, поданные при публикации в этом журнале, сайт будет использоваться исключительно для заявленных целей данного журнала, и они не будут доступны для любых других целей или какой-либо другой стороне.
Наша публикационная этика журнала основана, в значительной степени, на руководящих принципах и стандартах, разработанных Комитетом по этике публикации (COPE). Соответствующие обязанности и права авторов, рецензентов и редакторов журнала изложены ниже.
ОБЯЗАННОСТИ АВТОРОВ
Отправляя рукопись "Turczaninowia", автор (ы) гарантирует, что они отправляют рукопись как свою собственную, оригинальную работу, и что она не имеет ни были опубликованы ранее, и в настоящее время не рассматривается для публикации в других изданиях. Они также гарантируют, что источники каких-либо идей и / или слов в рукописи, которые не являются их собственными, были должным образом приписаны с помощью соответствующего цитирования.
Автор обычно не должен издавать рукописи, описывающие по существу те же исследования, в нескольких журналах или прочих публикациях. Такая избыточная публикация обычно считается неэтичным поведением, и в случае обнаружения, может привести к отклонению рассматриваемой рукописи рассматриваемого отвергаются, или опубликованная статья будет изъята.
Авторы рукописей, освещающих оригинальные исследования должны представить точный отчет о выполненной работе, в сопровождении объективного обсуждения его значения. Основополагающие данные должны быть представлены точно и полно в рукописи. Рукопись должна содержать достаточно подробные данные и ссылки, чтобы позволять другим дублировать работу. Подтасовка результатов и изготовление поддельных или заведомо неточных утверждений является неэтичным поведением и может быть причиной для отклонения или изъятия рукописи или опубликованной статьи.
Там, где в статьях есть отчеты о использовании коммерческого программного обеспечения, аппаратных средств или других продуктов, авторы должны подать декларацию в начале рукописи, в которой они должны заявить, что никакого конфликта интересов не существует или описать характер любого потенциального конфликта. Все источники финансовой поддержки для исследования также должны быть раскрыты в рукописи.
Автор (ы) рукописи соглашаются, что, если рукопись принята к публикации в "Turczaninowia", опубликованная статья будет характьеризоваться авторскими правами с использованием "Attribution-Unported" лицензии Creative Commons. Эта лицензия позволяет автору (ам) сохранить авторские права, но и позволяет другим свободно копировать, распространять и отображать произведение и производные работы, основанные на ней, при определенных заданных условиях.
Имена авторов должны быть перечислены на статье в порядке их вклада в статью, и все авторы берут на себя ответственность за свои собственные результаты. Только те люди, которые внесли существенный вклад, должны быть перечислены в качестве авторов; те, чьи вклады являются косвенными или маргинальными (например, коллег или руководителей, которые рассмотрели проекты работы или оказывали помощь в корректуре, и руководители научно-исследовательских институтов / центров / лабораторий) должны быть названы в разделе «Выражение признательности» в конце статьи, непосредственно предшествующему Списку литературы.
Автор, подающий статью, должен обеспечить, чтобы все соавторы былм включены в статью, и что все соавторы видели и одобрили окончательный вариант статьи и согласились на его публикацию.
Там, где автор обнаруживает существенную ошибку или неточность в статье, которая была уже опубликована в "Turczaninowia", он / она обязана незамедлительно уведомить редакцию и сотрудничать с ними, чтобы исправить статью или отозвать ее в случае необходимости.
ОБЯЗАННОСТИ РЕЦЕНЗЕНТОВ
В журнале "Turczaninowia" рецензенты выполняют работу для журнала на добровольной основе. Учитывая, что большинство из этих людей находятся в полной занятости, их рецензирование для "Turczaninowia" должна выолняться по мере необходимости, а не быть их главным приоритетом. Рецензенты могут свободно отклонять приглашения для рассмотрения конкретных рукописей по своему усмотрению, например, если их текущая нагрузка, занятость и / или другие обязательства могут сделать ее непомерно высокой для того, чтобы завершить обзор своевременно и уделить должное время рецензированию. Они также не должны принимать рукописи на рецензию, в тематике которых они не чувствуют себя подходящим специалистом.
Рецензенты, которые приняли рукописи, как правило, должны предоставить свои рецензии в течение трех недель. Они должны отказаться от рецензии, если становится очевидным для них на любой стадии, что они не обладают необходимыми знаниями для выполнения рецензии, или что они могут иметь потенциальный конфликт интересов при проведении рецензии (например, в результате конкурентных исследований, совместных или других отношений или связей с кем-либо из авторов, учреждений или компаний, связанных с рукописью).
Информация или идеи, полученные рецензентами в процессе рецензирования должны храниться в тайне и не используются для личной выгоды. Любые рукописи, полученные для рассмотрения, должны рассматриваться как конфиденциальные документы, и не должны быть показаны или обсуждены с другими, если только это не санкционировано редакторами "Turczaninowia".
При проведении своих рецензий, рецензентам необходимо сделать это как можно более объективно, воздерживаться от участия в личной критики автора (ов). Им предлагается высказать свое мнение четко, объясняя и оправдывая все рекомендации. Они всегда должны пытаться представить подробную и конструктивную обратную связь, чтобы помочь автору (ам) в повышении эффективности их работы, даже если рукопись, по их мнению, не подлежит опубликованию.
Рецензенты должны определить в своих рецензиях соответствующие опубликованные работы, которые не были названы автором (ами), вместе с любыми примерами, где не было сделано надлежащее цитирование источников. Они должны привлечь внимание ответственного редактора в отношении каких-либо серьезных сходств между рукописью, поданной на рассмотрение и других опубликованных статей, или статей, о которых им известно, а также предотвратить любые проблемы, которые могут иметь место по отношению к этической приемлемости исследований, представленных в рукописи.
ОБЯЗАННОСТИ РЕДАКЦИИ
Редактор журнала "Turczaninowia" несет полную ответственность за решение о публикации рукописи, которая представляется в "Turczaninowia", и при этом руководствуется политикой журнала, и в соответствии с определенными редакцией "Turczaninowia" юридическими требованиями в отношении клеветы, нарушения авторских прав и плагиата. Редактор может проконсультироваться с заместителями Редактора и другими членами редакционной коллегии, а также с рецензентами, для принятии решений о публикации.
Редакция будет оценивать рукописи с точки зрения ее интеллектуального содержания без учета расы, цвета кожи, пола, сексуальной ориентации, религиозных убеждений, этнического происхождения, гражданства или политической философии автора (ов). Они не будут никому разглашать какую-либо информацию о рукописи, кроме автора (ов), рецензентов и потенциальных рецензентов, а в некоторых случаях членов редакционной коллегии "Turczaninowia" и членов команды управления журналом, в зависимости от обстоятельств. Кроме того, редакция будет прилагать все усилия, чтобы обеспечить целостность процесса слепого рецензирования, не раскрывая личности автора (ов) рукописи для рецензентам этой рукописи, и наоборот.
При оценке рукописи для публикации, в дополнение к рассмотрению стандартных критериев, относящихся к строгости рукописи, качеству ее предоставления, а также ее вклад в область научных знаний, редакторы также будут руководствоваться тем, насколько этические нормы были соблюдены, и вред был сведен к минимуму при проведении исследования. Они также оценивают насколько полученные научные и практические выгоды перевешивают вред в случае конкретного исследования.
Так как "Turczaninowia" приветствует предоставление рукописей из любой страны, необходимо признать, что законы и нормативные акты, касающиеся этики научных исследований и этического утверждения, различаются во всем мире. Таким образом, редакторам, возможно, придется обратиться за разъяснениями в связи с этим к автору (ам) с просьбой о том, чтобы они представили письмо от соответствующего институционального комитета по этике или совета, который одобрил исследование.
Редакция будет руководствоваться Руководством CORE для изъятия статей при рассмотрении любых спорных вопросов, которые были опубликованы в AASRJ. Редакторы готовы работать в тесном сотрудничестве с научно-исследовательскими организациями и учреждениями в соответствии с рекомендациями CORE о сотрудничестве между научно-исследовательскими институтами и журналами в области публикационной этики и этики проведения исследований.
"Turczaninowia" является журналом открытого доступа, что означает, что все его содержимое свободно и доступно бесплатно для пользователя или его / ее учреждения. Пользователи могут читать, загружать, копировать, распространять, печатать, выполнять поиск, делать ссылки на полные тексты статей в этом журнале, не спрашивая предварительного разрешения от издателя или автора. Это легитимно в соответствии с определением BOAI об открытом доступе.
Наш сайт демонстрирует знак Creative Commons, и это исключительное право автора, если он / она хочет, чтобы его / ее статьи были в свободном доступе или нет. Но мы должны опубликовать Резюме и метаданные статьи в полном доступе в любом случае.
