Морфологический и филогенетический анализ сибирских видов рода Erythronium (Liliaceae)
УДК 582.572.226+577.21(571.1)
Аннотация
Статья посвящена сравнительному морфолого-генетическому анализу популяций сибирских видов рода Erythronium. Выявлены морфологические различия между видами E. sajanense, E. sibiricum, E. sulevii, заключающиеся в размерах и формах листьев, листочков околоцветника, тычиночных нитей. При проведении кластерного анализа отмечается четкое отделение популяций кандыка саянского по совокупности указанных признаков. ISSR-анализом установлено, что уровень генетического разнообразия в популяциях варьирует от 23 до 40 % и имеет максимальные показатели для популяций E. sajanense. Изученные популяции кандыков характеризуются высоким уровнем генетической дифференциации (Gst = 0,5788) и относятся к разным видам. На UPGMA-дендрограмме сходства отмечается достоверное отделение (индекс бутстрэпа 100 %) популяций E. sajanense, тогда как популяции E. sibiricum и E. sulevii демонстрируют большее генетическое сходство. Анализ генотипов особей в программе STRUCTURE показывает разделение на 3 кластера, соответствующих исследуемым видам. Филогенетический анализ с использованием ITS и хлоропластных молекулярных маркеров (rbcL, rpoB-trnC, trnL-trnF, trnT-trnL) выявил отсутствие различий в последовательностях E. sibiricum и E. sulevii. При сравнении участков ДНК E. sajanense с двумя другими видами обнаружены многочисленные однонуклеотидные замены, а также 1–24 нуклеотидные индели и дупликации, что четко обособляет данный вид на филогенетических деревьях. Проведенный комплексный морфолого-генетический анализ популяций сибирских видов кандыков доказывает самостоятельность вида E. sajanense. Erythronium sulevii отличается от E. sibiricum такими морфологическими параметрами, как цвет пыльников, размеры и форма листочков околоцветника, а также межмикросателлитными последовательностями, однако для уточнения его таксономического ранга требуются дальнейшие исследования.
Скачивания
Литература
Chepinoga V. V., Barkalov V. Yu., Ebel A. L., Knyazev M. S., Baikov K. S., Bobrov A. A. et al. 2024. Checklist of vascular plants of Asian Russia. Bot. Pacifica 13: 3–310. https://doi.org/10.17581/bp.2024.13S01
Черепнин Л. М. Флора южной части Красноярского края. Красноярск: Красноярское книжн. изд-во, 1959. 240 с.
Clennett C. 2014. The Genus Erythronium. London: Kew Publishing. 250 рp.
Edgar R. C. 2004. MUSCLE: multiple sequence alignment with high accuracy and high throughput. Nucleic. Acids. Res. 32(5): 1792–1797. https://doi.org/10.1093/nar/gkh340
Erythronium L. [2026]. World Flora Online. URL: https://www.worldfloraonline.org/taxon/wfo-4000013993#children (Accessed 12 February 2026).
Fay M. F., Swensen S. M., Chase M. W. 1997. Taxonomic affinities of Medusagyne oppositifolia (Medusagynaceae). Kew Bull. 52: 111–120.
Hubisz M. J. 2009. Inferring weak population structure with the assistance of sample group information. Mol. Ecol. Resour. 9 (5): 1322–1332.
Клещева Е. А. Кандык сибирский – Erythronium sibiricum (Fisch. et C. A. Mey.) Kryl. (1841) // Красная книга Республики Тыва (животные, растения и грибы). 2-е изд., перераб. Кызыл: Фаворит, 2018. С. 348.
Красников А. А. Кандык сибирский – Erythronium sibiricum (Fisch. et C. A. Mey.) Kryl. (1841) // Красная книга Новосибирской области. 3-е изд., перераб. и доп. Новосибирск: Типография А. Христолюбова, 2018. С. 390.
Kumar S., Stecher G., Li M., Knyaz C., Tamura K. 2018. MEGA X: Molecular Evolutionary Genetics Analysis across computing platforms. Mol. Biol. Evol. 35: 1547–1549. https://doi.org/10.1093/molbev/msy096
Куприянов О. А. Кандык сибирский – Erythronium sibiricum (Fisch. et C. A. Mey.) Kryl. // Красная книга Кузбасса. Т. I. 3-е изд., перераб. и доп. Кемерово: ВЕКТОР-ПРИНТ, 2021. С. 68.
Куцев М. Г., Уварова О. В., Синицына Т. А. Набор синтетических олигонуклеотидов для амплификации и секвенирования ITS1-5.8S-ITS2 сосудистых растений // Патент РФ № 2528063 от 30.06.2014.
Куваев В. Б. Кандык сибирский – Erythronium sibiricum (Fisch. еt C. A. Mey.) Kryl. // Красная книга Российской Федерации. Растения и грибы. М.: Тов-во науч. изд. КМК, 2024. С. 319–320.
Леонова Т. В., Лавриненко С. В. Кандык сибирский – Erythronium sibiricum (Fisch. et C. A. Mey.) Kryl. (1841) // Красная книга Республики Хакасия: редкие и исчезающие виды растений и грибов. 2-е изд., перераб. и доп. Новосибирск: Наука, 2012. С. 100.
Li P., Lu R.-S., Xu W.-Q., Ohi-Toma T., Cai M.-Q., Qiu Y.-X., Cameron K. M., Fu C.-X. 2017. Comparative genomics and phylogenomics of East Asian tulips (Amana, Liliaceae). Front. Plant Sci. 8: 451. https://doi.org/10.3389/fpls.2017.00451
Miikeda O., Kita K., Handa T., Yukawa T. 2006. Phylogenetic relationships of Clematis (Ranunculaceae) based on chloroplast and nuclear DNA sequences. Bot. J. Linn. Soc. 152: 153–168. https://doi.org/10.1111/j.1095-8339.2006.00551.x
Nei M. 1972. Genetic distance between populations. Am. Nat. 106: 283–292. https://doi.org/10.1086/282771
Olmstead R. G., Michaels H. J., Scotts K. M., Palmer J. D. 1992. Monophyly of the Asteridae and identification of their major lineages inferred from DNA sequences of rbcL. Ann. Missouri Bot. Gard. 79: 249–265.
Папина О. Н. Лилейные – Liliaceae // Определитель растений Республики Алтай. Новосибирск: Изд-во СО РАН, 2012. C. 492–495.
Положий А. В. Erythronium sibiricum (Fisch. et C. A. Mey.) Kryl. // Красная книга Томской области. Томск: Изд-во Томск. ун-та, 2002. С. 258.
Pritchard J. K., Stephens M., Donnelly P. 2004. Inference of population structure using multilocus genotype data. Genetics 155: 945–959. https://doi.org/10.1093/genetics/155.2.945
R Core Team [2012]. R: A language and environment for statistical computing. Vienna, Austria; R Foundation for Statistical Computing. URL: http://www.R-project.org/
Ruksans J. 2007. Buried Treasures: Finding and Growing the World's Choicest Bulbs. Portland: Timber Press. 460 pp.
Шмидт В. М. Математические методы в ботанике. Л.: Изд-во Ленингр. ун-та, 1984. 288 с.
Степанов Н. В. Кандык сибирский – Erythronium sibiricum (Fisch. et C. A. Mey.) Kryl. (1929) // Красная книга Красноярского края. Редкие и находящиеся под угрозой исчезновения виды дикорастущих растений и грибов. Т. 2. Красноярск: Сибирский фед. ун-т, 2022. С. 269.
Степанов Н. В., Стасова В. В. О новом таксоне рода кандык (Erythronium – Liliaceae) из Западного Саяна // Вестник КрасГАУ, 2011. № 8. С. 58–63.
Taberlet P., Gielly L., Pautou G., Bouvet J. 1991. Universal primers for amplification of three non-coding regions of chloroplast DNA. Plant Mol. Biol. 17: 1105–1109. https://doi.org/10.1007/BF00037152
Терехина Т. А., Копытина Т. М. Erythronium sibiricum (Fisch. et C. A. Mey.) Kryl. – кандык сибирский // Красная книга Алтайского края. Редкие и находящиеся под угрозой исчезновения виды растений и грибов. Т. 1. Барнаул: Изд-во Алт. ун-та, 2016. С. 126–127.
Tukey J. W. 1949. Comparing individual means in the analysis of variance. Biometrics 5(2): 99–114. https://doi.org/10.2307/3001913
Уведомление об авторских правах
Turczaninowiа является "золотым издателем", так как мы позволяем самоархивирование, но самое главное, мы полностью прозрачны в своих правах.
Авторы могут представить и обсудить свои выводы перед публикацией: в биологических или научных конференций, на допечатной серверах, в общедоступных базах данных, а также в блогах, вики, твиттерах и другие неформальных каналах связи.
Turczaninowiа позволяет авторам внести рукописи (находящуюся в настоящее время на рассмотрении или тех, которые предполагается предоставить в Turczaninowia) для архивирования в некоммерческих, допечатных серверах, таких как ArXiv.
Авторы, публикующиеся в этом журнале согласны со следующими условиями: авторы сохраняют свои авторские права и предоставляют журналу право первой публикации в связи с работой, которая одновременно распространяется по лицензии Creative Commons Attribution и позволяют другим иметь доступ к работе с признанием авторства этой работы и первоначальной публикацией в этом журнале. Авторы могут заключать отдельные, дополнительные договорные соглашения по неисключительному распространению опубликованной версии (например, разместить ее в институтском репозитории или опубликовать в книге), с признанием ее первоначальной публикации в этом журнале.
Авторам разрешается и рекомендуется размещать их работу в Интернете (например, в институциональных хранилищах или на их сайте) до и во время процесса подачи, так как это может привести к продуктивным обменам, а также увеличению цитирования опубликованных работ (см. Политика открытого доступа)
Политика открытого доступа.
Заявление о конфиденциальности
Имена и адреса электронной почты, поданные при публикации в этом журнале, сайт будет использоваться исключительно для заявленных целей данного журнала, и они не будут доступны для любых других целей или какой-либо другой стороне.
Наша публикационная этика журнала основана, в значительной степени, на руководящих принципах и стандартах, разработанных Комитетом по этике публикации (COPE). Соответствующие обязанности и права авторов, рецензентов и редакторов журнала изложены ниже.
ОБЯЗАННОСТИ АВТОРОВ
Отправляя рукопись "Turczaninowia", автор (ы) гарантирует, что они отправляют рукопись как свою собственную, оригинальную работу, и что она не имеет ни были опубликованы ранее, и в настоящее время не рассматривается для публикации в других изданиях. Они также гарантируют, что источники каких-либо идей и / или слов в рукописи, которые не являются их собственными, были должным образом приписаны с помощью соответствующего цитирования.
Автор обычно не должен издавать рукописи, описывающие по существу те же исследования, в нескольких журналах или прочих публикациях. Такая избыточная публикация обычно считается неэтичным поведением, и в случае обнаружения, может привести к отклонению рассматриваемой рукописи рассматриваемого отвергаются, или опубликованная статья будет изъята.
Авторы рукописей, освещающих оригинальные исследования должны представить точный отчет о выполненной работе, в сопровождении объективного обсуждения его значения. Основополагающие данные должны быть представлены точно и полно в рукописи. Рукопись должна содержать достаточно подробные данные и ссылки, чтобы позволять другим дублировать работу. Подтасовка результатов и изготовление поддельных или заведомо неточных утверждений является неэтичным поведением и может быть причиной для отклонения или изъятия рукописи или опубликованной статьи.
Там, где в статьях есть отчеты о использовании коммерческого программного обеспечения, аппаратных средств или других продуктов, авторы должны подать декларацию в начале рукописи, в которой они должны заявить, что никакого конфликта интересов не существует или описать характер любого потенциального конфликта. Все источники финансовой поддержки для исследования также должны быть раскрыты в рукописи.
Автор (ы) рукописи соглашаются, что, если рукопись принята к публикации в "Turczaninowia", опубликованная статья будет характьеризоваться авторскими правами с использованием "Attribution-Unported" лицензии Creative Commons. Эта лицензия позволяет автору (ам) сохранить авторские права, но и позволяет другим свободно копировать, распространять и отображать произведение и производные работы, основанные на ней, при определенных заданных условиях.
Имена авторов должны быть перечислены на статье в порядке их вклада в статью, и все авторы берут на себя ответственность за свои собственные результаты. Только те люди, которые внесли существенный вклад, должны быть перечислены в качестве авторов; те, чьи вклады являются косвенными или маргинальными (например, коллег или руководителей, которые рассмотрели проекты работы или оказывали помощь в корректуре, и руководители научно-исследовательских институтов / центров / лабораторий) должны быть названы в разделе «Выражение признательности» в конце статьи, непосредственно предшествующему Списку литературы.
Автор, подающий статью, должен обеспечить, чтобы все соавторы былм включены в статью, и что все соавторы видели и одобрили окончательный вариант статьи и согласились на его публикацию.
Там, где автор обнаруживает существенную ошибку или неточность в статье, которая была уже опубликована в "Turczaninowia", он / она обязана незамедлительно уведомить редакцию и сотрудничать с ними, чтобы исправить статью или отозвать ее в случае необходимости.
ОБЯЗАННОСТИ РЕЦЕНЗЕНТОВ
В журнале "Turczaninowia" рецензенты выполняют работу для журнала на добровольной основе. Учитывая, что большинство из этих людей находятся в полной занятости, их рецензирование для "Turczaninowia" должна выолняться по мере необходимости, а не быть их главным приоритетом. Рецензенты могут свободно отклонять приглашения для рассмотрения конкретных рукописей по своему усмотрению, например, если их текущая нагрузка, занятость и / или другие обязательства могут сделать ее непомерно высокой для того, чтобы завершить обзор своевременно и уделить должное время рецензированию. Они также не должны принимать рукописи на рецензию, в тематике которых они не чувствуют себя подходящим специалистом.
Рецензенты, которые приняли рукописи, как правило, должны предоставить свои рецензии в течение трех недель. Они должны отказаться от рецензии, если становится очевидным для них на любой стадии, что они не обладают необходимыми знаниями для выполнения рецензии, или что они могут иметь потенциальный конфликт интересов при проведении рецензии (например, в результате конкурентных исследований, совместных или других отношений или связей с кем-либо из авторов, учреждений или компаний, связанных с рукописью).
Информация или идеи, полученные рецензентами в процессе рецензирования должны храниться в тайне и не используются для личной выгоды. Любые рукописи, полученные для рассмотрения, должны рассматриваться как конфиденциальные документы, и не должны быть показаны или обсуждены с другими, если только это не санкционировано редакторами "Turczaninowia".
При проведении своих рецензий, рецензентам необходимо сделать это как можно более объективно, воздерживаться от участия в личной критики автора (ов). Им предлагается высказать свое мнение четко, объясняя и оправдывая все рекомендации. Они всегда должны пытаться представить подробную и конструктивную обратную связь, чтобы помочь автору (ам) в повышении эффективности их работы, даже если рукопись, по их мнению, не подлежит опубликованию.
Рецензенты должны определить в своих рецензиях соответствующие опубликованные работы, которые не были названы автором (ами), вместе с любыми примерами, где не было сделано надлежащее цитирование источников. Они должны привлечь внимание ответственного редактора в отношении каких-либо серьезных сходств между рукописью, поданной на рассмотрение и других опубликованных статей, или статей, о которых им известно, а также предотвратить любые проблемы, которые могут иметь место по отношению к этической приемлемости исследований, представленных в рукописи.
ОБЯЗАННОСТИ РЕДАКЦИИ
Редактор журнала "Turczaninowia" несет полную ответственность за решение о публикации рукописи, которая представляется в "Turczaninowia", и при этом руководствуется политикой журнала, и в соответствии с определенными редакцией "Turczaninowia" юридическими требованиями в отношении клеветы, нарушения авторских прав и плагиата. Редактор может проконсультироваться с заместителями Редактора и другими членами редакционной коллегии, а также с рецензентами, для принятии решений о публикации.
Редакция будет оценивать рукописи с точки зрения ее интеллектуального содержания без учета расы, цвета кожи, пола, сексуальной ориентации, религиозных убеждений, этнического происхождения, гражданства или политической философии автора (ов). Они не будут никому разглашать какую-либо информацию о рукописи, кроме автора (ов), рецензентов и потенциальных рецензентов, а в некоторых случаях членов редакционной коллегии "Turczaninowia" и членов команды управления журналом, в зависимости от обстоятельств. Кроме того, редакция будет прилагать все усилия, чтобы обеспечить целостность процесса слепого рецензирования, не раскрывая личности автора (ов) рукописи для рецензентам этой рукописи, и наоборот.
При оценке рукописи для публикации, в дополнение к рассмотрению стандартных критериев, относящихся к строгости рукописи, качеству ее предоставления, а также ее вклад в область научных знаний, редакторы также будут руководствоваться тем, насколько этические нормы были соблюдены, и вред был сведен к минимуму при проведении исследования. Они также оценивают насколько полученные научные и практические выгоды перевешивают вред в случае конкретного исследования.
Так как "Turczaninowia" приветствует предоставление рукописей из любой страны, необходимо признать, что законы и нормативные акты, касающиеся этики научных исследований и этического утверждения, различаются во всем мире. Таким образом, редакторам, возможно, придется обратиться за разъяснениями в связи с этим к автору (ам) с просьбой о том, чтобы они представили письмо от соответствующего институционального комитета по этике или совета, который одобрил исследование.
Редакция будет руководствоваться Руководством CORE для изъятия статей при рассмотрении любых спорных вопросов, которые были опубликованы в AASRJ. Редакторы готовы работать в тесном сотрудничестве с научно-исследовательскими организациями и учреждениями в соответствии с рекомендациями CORE о сотрудничестве между научно-исследовательскими институтами и журналами в области публикационной этики и этики проведения исследований.
"Turczaninowia" является журналом открытого доступа, что означает, что все его содержимое свободно и доступно бесплатно для пользователя или его / ее учреждения. Пользователи могут читать, загружать, копировать, распространять, печатать, выполнять поиск, делать ссылки на полные тексты статей в этом журнале, не спрашивая предварительного разрешения от издателя или автора. Это легитимно в соответствии с определением BOAI об открытом доступе.
Наш сайт демонстрирует знак Creative Commons, и это исключительное право автора, если он / она хочет, чтобы его / ее статьи были в свободном доступе или нет. Но мы должны опубликовать Резюме и метаданные статьи в полном доступе в любом случае.
