Вариабельность цитотипов комплекса Selaginella sanguinolenta s. l.
Аннотация
В работе представлены результаты измерения содержания ДНК методом проточной цитометрии видов S. sanguinolenta и S. borealis в 50 популяциях из природных местообитаний России и Монголии. Было выявлено два вероятных цитотипа для S. sanguinolenta, а также единичные образцы с кратными изменениями, и два цитотипа для S. borealis. Образцы с наименьшими цитотипами равны в среднем 0,32 и 0,38 пг для S. sanguinolenta и 0,36 пг для S. borealis. Исследованные образцы с крупными цитотипами распространены по большей части на территориях юго-западнее и южнее оз. Байкал и концентрируются по большей части на границах ареалов распространения S. sanguinolenta и S. borealis. Образцы с крупными цитотипами содержат ДНК в 1,5 раза больше (0,49 пг) и 2,2 раза больше (0,63 пг) для S. sanguinolenta и в 1,4 раза больше (0,49 пг) для S. borealis от наименьших цитотипов. Кроме того, в статье представлены результаты измерения содержания ДНК дополнительно для 7 видов группы sanguinolenta и 26 других видов рода Selaginella. Из исследованных таксонов данные для 27 видов приводятся впервые.
Скачивания
Metrics
Литература
Liverworts. Journal of Botany 2010(316356): 1–7. DOI:10.1155/2010/316356
Baniaga A. E, Arrigo N., Barker M. S. 2016. The small nuclear genomes of Selaginella are associated with a low rate of genome size evolution. Genome Biology and Evolution 8: 1516–1525.
Дмитриева С. А., Парфенов В. И. Кариология флоры как основа цитогенетического мониторинга (на примере Березинского биосферного заповедника). Минск: Наука и техника, 1991. 230 с.
Erst A. S., Sukhorukov A. P., Mitrenina E. Y., Skaptsov M. V., Kostikova V. A., Chernisheva O. A., Troshkina V., Kushunina M., Krivenko D. A., Ikeda H., Xiang K., Wang W. 2020. An integrative taxonomic approach reveals a new species of Eranthis (Ranunculaceae) in North Asia. PhytoKeys 140: 75–100. DOI: 10.3897/phytokeys.140.49048
Fraser-Jenkins C. R., Kandel D. R., Pariyar S. 2015. Ferns and fern-allies of Nepal. Vol. 1. National Herbarium and Plant Laboratories, Department of Plant Resources, Ministry of Forests and Soil Conservation, Kathmandu, 508 pp.
Grant V. 1981. Plant Speciation. New York. 346 pp.
Heitz E. 1926. Der Nachweis der Chromosomen. Zeitschrift für Botanik 18: 625–681.
Jermy A. C. 1990. Selaginellaceae. In: The families and genera of vascular plants. Pteridophytes and gymnosperms. Eds. K. U. Kramer, P. S. Green. Vol. 1. Berlin, Heidelberg et New York. Pp. 39–45. DOI: 10.1007/978-3-662-02604-5
Jermy A. C., Jones K., Colden C. 1967. Cytomorphological variation in Selaginella. Botanical Journal of the Linnean Society 60: 147–158. DOI: 10.1111/j.1095-8339.1967.tb00083.x
Хроленко Ю. А., Муратова
Е. Н. Кариология Senecio cannabifolius (Asteraceae) с полуострова Камчатка // Бот. журн., 2016. Т. 101, № 4. С. 416–427.
Korall P., Kenrick P. 2004. The phylogenetic history of Selaginellaceae based on DNA sequences from the plastid and nucleus: Extreme substitution rates and rate heterogeneity. Molecular Phylogenetics and Evolution 31: 852–864. DOI: 10.1016/j.ympev.2003.10.014
Kuriachan P. I. 1963. Cytology of the genus Selaginella. Cytologia 28: 376–380. DOI: 10.1508/cytologia.28.376
Little D., Moran R., Brenner E., Stevenson D. 2007. Nuclear genome size in Selaginella. Genome 50: 351–356. DOI: 10.1139/G06-138
Love A., Love D. 1976. In IOPB chromosome number reports LIII. Taxon 25: 483–500.
Loyal D. S., Kumar V. 1984. Cytotaxonomic observations on three Selaginella species from North-Western Himalayas. Indian Fern Journal 1: 59–62.
Marcon A. B. 2003. Karyology of some Pteridophytes species occurring in the north-east of Brazil. Acta Botanica Brasilica 17(1): 19–26. DOI: 10.1590/S0102-33062003000100002
Marcon A. B., Barros I. C., Guerra M. 2005. Variation in chromosome numbers, CMA bands and 45S rDNA sites in species of Selaginella (Pteridophyta). Annals of botany 95(2): 271–276. DOI: 10.1093/aob/mci022
Муратова Е. Н. Кариосистематика семейства Pinaceae Lindl. Сибири и Дальнего Востока: Автореф. дис. … докт. биол. наук. Новосибирск, 1995. 32 с.
Obermayer R., Leitch I. J., Hanson L., Bennett M. D. 2002. Nuclear DNA C-values in 30 species double the familial representation in pteridophytes. Annals of Botany 90: 209–217. DOI: 10.1093/aob/mcf167
Очиров Ч. С., Намзалов Б. Б. К вопросу об истории рода Selaginella (L.) Beauv, ареале и экологических особенностях S. sanguinolenta (L.) Spring в Центральной Азии // Вестник Бурятского государственного университета. Биология, география, 2014. № 4(2). С. 30–33.
Pfosser M., Heberle‐Bors E., Amon A., Lelley T. 1995. Evaluation of sensitivity of flow-cytometry in detecting aneuploidy in wheat using disomic and ditelosomic wheat-rye addition lines. Cytometry 21: 387–393. DOI: 10.1002/cyto.990210412
PPG I. 2016. A community derived classification for extant lycophytes and ferns. Journal of Systematics and Evolution 54(6): 563–603. DOI: 10.1111/jse.12229
Пробатова Н. С. Хромосомные числа в семействе Poaceae и их значение для систематики, филогении и фитогеографии (на примере злаков Дальнего Востока России) // Комаровские чтения, 2007. Вып. 55. С. 9–103.
Shalimov A. P., Wu Y.-D., Zhang X.-C. 2019. A taxonomic revision of the genus Selaginella (Selaginellaceae) from Nepal. PhytoKeys 133: 1–76. DOI: 10.3897/phytokeys.133.37773
Siljak-Yakovlev S., Pustahija F., Šolic E. M., Bogunic F., Muratovic E., Bašic N., Catrice O., Brown S.C. 2010. Towards a genome size and chromosome number database of Balkan flora: C-values in 343 taxa with novel values for 242. Advanced Science Letters 3: 190–213. DOI: 10.1166/asl.2010.1115
Skaptsov M. V., Lomonosova M. N., Kutsev M. G., Smirnov S. V., Shmakov A. I. 2017. The phenomenon of endopolyploidy in some species of the Chenopodioideae (Amaranthaceae). Botany Letters 164(1): 47–53. DOI: 10.1080/23818107.2016.1276475
Skaptsov M. V., Smirnov S. V., Kechaykin A. A., Kutsev M. G., Vaganov A. V., Zhang X.-C., Shmakov A. I. 2018. Polymorphism of the relative DNA content of the species Selaginella borealis and Selaginella sanguinolenta. Acta Biologica Sibirica 4, 4: 116–118. DOI: 10.14258/abs.v4.i4.4903
Smirnov S., Skaptsov M., Shmakov A., Fritsch R., Friesen N. 2017. Spontaneous hybridization among Allium tulipifolium and A. robustum (Allium subg. Melanocrommyum, Amaryllidaceae) under cultivation. Phytotaxa 303(2): 155–164. DOI: 11646/phytotaxa.303.2.5
Соколовская А. П. Труды Ленинградского общества естествоиспытателей. Отделение ботаники, 1982. Т. 75, № 3. С. 1–128.
Takamiya M. 1993. Comparative karyomorphology and interrelationships of Selaginella in Japan. Journal of Plant Research 106: 149–166. DOI: 10.1007/BF02344419
Tanaka R. 1967. A comparative karyotype analysis in Haplopappus gracilis (2n = 4) and Haplopappus ravenii (2n = 8). Cytologia 32: 542–554. DOI: 10.1508/cytologia.32.542
Tindale M. D., Roy S. K., 2002. A cytotaxonomic survey of the Pteridophyta of Australia. Australian Systematic Botany 15: 839–937. DOI: 10.1071/SB00034
Tsai J. L., Shieh W. C. 1988. Cytotaxonomic studies on the Selaginellaceae in Taiwan. Journal of Science and Engineering 25: 83–92.
Цвелев Н. Н. О pоде Selaginella P. Beauv. s. l. (Selaginellaceae) в России // Новости сист. высш. раст., 2004. Т. 36. С. 22–27.
Vaganov A. V., Shalimov A. P., Kechaykin A. A., Skaptsov M. V., Smirnov S. V., Sinitsyna T. A., Kutsev M. G., Zhang X.-C., Shmakov A. I. 2019. Spore morphology of Selaginella borealis, S. sanguinolenta and S. helvetica (Selaginellaceae, Lycopodiophyta). Turczaninowia 22, 2: 142–150. DOI: 10.14258/turczaninowia.22.2.10
Van de Peer Y., Mizrachi E., Marchal K. 2017. The evolutionary significance of polyploidy. Nature Reviews Genetics 18: 411–424. DOI: 10.1038/nrg.2017.26
Vasudeva S. M., Bir S. S. 1983. Chromosome numbers and evolutionary status of ferns and fern allies of Pachmarhi Hills (Central India). Aspects of Plant Science 6: 119–181.
Wang W., Tanurdzic M., Luo M., Sisneros N., Kim H. R., Weng J. K., Kudrna D., Mueller C., Arumuganathan K., Carlson J., Chapple C., de Pamphilis C., Mandoli D., Tomkins J., Wing R. A., Banks J. A. 2005. Construction of a bacterial artificial chromosome library from the spikemoss Selaginella moellendorffii: a new resource for plant comparative genomics. BMC plant biology 5: 10. DOI: 10.1186/1471-2229-5-10
Wang Z., Xia Q. 1984. Cytological observations on some species of Dryopteris and Polystichum from China. Acta Botanica Sinica 26: 1–10.
Warburg O. 1900. Selaginellaceae. Monsunia 1: 100–136.
Weng R. F., Qiu S. P. 1988. Chromosome counts of some ferns from Zhejiang. Invest. Stud. Nat. 8: 43–52.
Weststrand S., Korall P. 2016. Phylogeny of Selaginellaceae: There is value in morphology after all! American Journal of Botany 103: 2136–2159. DOI:10.3732/ajb.1600156
Zhang H.-R., Xiang Q.-P., Zhang X.-C. 2019. The unique evolutionary trajectory and dynamic conformations of DR and IR/DR-Coexisting plastomes of the early vascular plant Selaginellaceae (Lycophyte). Genome Biology and Evolution 11(4): 1258–1274. DOI: 10.1093/gbe/evz073
Zhang X.-C., Kato M., Nooteboom H. P. 2013. Selaginellaceae. In: Flora of China. Eds. Z. Y. Wu, P. H. Raven, D. Y. Hong. Vol. 2–3. Beijing, St. Louis. Pp. 37–66.
Zhou X.-M., Rothfels C. J., Zhang L., He Z.-R., Le Péchon T., He H., Lu N. T., Knapp R., Lorence D., He X.‐J., Gao X.-F., Zhang L.-B. 2015.A large‐scale phylogeny of the lycophyte genus Selaginella (Selaginellaceae: Lycopodiopsida) based on plastid and nuclear loci. Cladistics 32: 360–389. DOI: 10.1111/cla.12136
Zhou X.-M., Zhang L.-B. 2015. A classification of Selaginella (Selaginellaceae) based on molecular (chloroplast and nuclear), macromorphological, and spore features. Taxon 64: 1117–1140. DOI: 10.12705/646.2
Жукова П. Г., Петровский В. В. Хромосомные числа некоторых видов растений Западной Чукотки. II // Бот. журн., 1976. Т. 61, № 7. С. 963–969).
Уведомление об авторских правах
Turczaninowiа является "золотым издателем", так как мы позволяем самоархивирование, но самое главное, мы полностью прозрачны в своих правах.
Авторы могут представить и обсудить свои выводы перед публикацией: в биологических или научных конференций, на допечатной серверах, в общедоступных базах данных, а также в блогах, вики, твиттерах и другие неформальных каналах связи.
Turczaninowiа позволяет авторам внести рукописи (находящуюся в настоящее время на рассмотрении или тех, которые предполагается предоставить в Turczaninowia) для архивирования в некоммерческих, допечатных серверах, таких как ArXiv.
Авторы, публикующиеся в этом журнале согласны со следующими условиями: авторы сохраняют свои авторские права и предоставляют журналу право первой публикации в связи с работой, которая одновременно распространяется по лицензии Creative Commons Attribution и позволяют другим иметь доступ к работе с признанием авторства этой работы и первоначальной публикацией в этом журнале. Авторы могут заключать отдельные, дополнительные договорные соглашения по неисключительному распространению опубликованной версии (например, разместить ее в институтском репозитории или опубликовать в книге), с признанием ее первоначальной публикации в этом журнале.
Авторам разрешается и рекомендуется размещать их работу в Интернете (например, в институциональных хранилищах или на их сайте) до и во время процесса подачи, так как это может привести к продуктивным обменам, а также увеличению цитирования опубликованных работ (см. Политика открытого доступа)
Политика открытого доступа.
Заявление о конфиденциальности
Имена и адреса электронной почты, поданные при публикации в этом журнале, сайт будет использоваться исключительно для заявленных целей данного журнала, и они не будут доступны для любых других целей или какой-либо другой стороне.
Наша публикационная этика журнала основана, в значительной степени, на руководящих принципах и стандартах, разработанных Комитетом по этике публикации (COPE). Соответствующие обязанности и права авторов, рецензентов и редакторов журнала изложены ниже.
ОБЯЗАННОСТИ АВТОРОВ
Отправляя рукопись "Turczaninowia", автор (ы) гарантирует, что они отправляют рукопись как свою собственную, оригинальную работу, и что она не имеет ни были опубликованы ранее, и в настоящее время не рассматривается для публикации в других изданиях. Они также гарантируют, что источники каких-либо идей и / или слов в рукописи, которые не являются их собственными, были должным образом приписаны с помощью соответствующего цитирования.
Автор обычно не должен издавать рукописи, описывающие по существу те же исследования, в нескольких журналах или прочих публикациях. Такая избыточная публикация обычно считается неэтичным поведением, и в случае обнаружения, может привести к отклонению рассматриваемой рукописи рассматриваемого отвергаются, или опубликованная статья будет изъята.
Авторы рукописей, освещающих оригинальные исследования должны представить точный отчет о выполненной работе, в сопровождении объективного обсуждения его значения. Основополагающие данные должны быть представлены точно и полно в рукописи. Рукопись должна содержать достаточно подробные данные и ссылки, чтобы позволять другим дублировать работу. Подтасовка результатов и изготовление поддельных или заведомо неточных утверждений является неэтичным поведением и может быть причиной для отклонения или изъятия рукописи или опубликованной статьи.
Там, где в статьях есть отчеты о использовании коммерческого программного обеспечения, аппаратных средств или других продуктов, авторы должны подать декларацию в начале рукописи, в которой они должны заявить, что никакого конфликта интересов не существует или описать характер любого потенциального конфликта. Все источники финансовой поддержки для исследования также должны быть раскрыты в рукописи.
Автор (ы) рукописи соглашаются, что, если рукопись принята к публикации в "Turczaninowia", опубликованная статья будет характьеризоваться авторскими правами с использованием "Attribution-Unported" лицензии Creative Commons. Эта лицензия позволяет автору (ам) сохранить авторские права, но и позволяет другим свободно копировать, распространять и отображать произведение и производные работы, основанные на ней, при определенных заданных условиях.
Имена авторов должны быть перечислены на статье в порядке их вклада в статью, и все авторы берут на себя ответственность за свои собственные результаты. Только те люди, которые внесли существенный вклад, должны быть перечислены в качестве авторов; те, чьи вклады являются косвенными или маргинальными (например, коллег или руководителей, которые рассмотрели проекты работы или оказывали помощь в корректуре, и руководители научно-исследовательских институтов / центров / лабораторий) должны быть названы в разделе «Выражение признательности» в конце статьи, непосредственно предшествующему Списку литературы.
Автор, подающий статью, должен обеспечить, чтобы все соавторы былм включены в статью, и что все соавторы видели и одобрили окончательный вариант статьи и согласились на его публикацию.
Там, где автор обнаруживает существенную ошибку или неточность в статье, которая была уже опубликована в "Turczaninowia", он / она обязана незамедлительно уведомить редакцию и сотрудничать с ними, чтобы исправить статью или отозвать ее в случае необходимости.
ОБЯЗАННОСТИ РЕЦЕНЗЕНТОВ
В журнале "Turczaninowia" рецензенты выполняют работу для журнала на добровольной основе. Учитывая, что большинство из этих людей находятся в полной занятости, их рецензирование для "Turczaninowia" должна выолняться по мере необходимости, а не быть их главным приоритетом. Рецензенты могут свободно отклонять приглашения для рассмотрения конкретных рукописей по своему усмотрению, например, если их текущая нагрузка, занятость и / или другие обязательства могут сделать ее непомерно высокой для того, чтобы завершить обзор своевременно и уделить должное время рецензированию. Они также не должны принимать рукописи на рецензию, в тематике которых они не чувствуют себя подходящим специалистом.
Рецензенты, которые приняли рукописи, как правило, должны предоставить свои рецензии в течение трех недель. Они должны отказаться от рецензии, если становится очевидным для них на любой стадии, что они не обладают необходимыми знаниями для выполнения рецензии, или что они могут иметь потенциальный конфликт интересов при проведении рецензии (например, в результате конкурентных исследований, совместных или других отношений или связей с кем-либо из авторов, учреждений или компаний, связанных с рукописью).
Информация или идеи, полученные рецензентами в процессе рецензирования должны храниться в тайне и не используются для личной выгоды. Любые рукописи, полученные для рассмотрения, должны рассматриваться как конфиденциальные документы, и не должны быть показаны или обсуждены с другими, если только это не санкционировано редакторами "Turczaninowia".
При проведении своих рецензий, рецензентам необходимо сделать это как можно более объективно, воздерживаться от участия в личной критики автора (ов). Им предлагается высказать свое мнение четко, объясняя и оправдывая все рекомендации. Они всегда должны пытаться представить подробную и конструктивную обратную связь, чтобы помочь автору (ам) в повышении эффективности их работы, даже если рукопись, по их мнению, не подлежит опубликованию.
Рецензенты должны определить в своих рецензиях соответствующие опубликованные работы, которые не были названы автором (ами), вместе с любыми примерами, где не было сделано надлежащее цитирование источников. Они должны привлечь внимание ответственного редактора в отношении каких-либо серьезных сходств между рукописью, поданной на рассмотрение и других опубликованных статей, или статей, о которых им известно, а также предотвратить любые проблемы, которые могут иметь место по отношению к этической приемлемости исследований, представленных в рукописи.
ОБЯЗАННОСТИ РЕДАКЦИИ
Редактор журнала "Turczaninowia" несет полную ответственность за решение о публикации рукописи, которая представляется в "Turczaninowia", и при этом руководствуется политикой журнала, и в соответствии с определенными редакцией "Turczaninowia" юридическими требованиями в отношении клеветы, нарушения авторских прав и плагиата. Редактор может проконсультироваться с заместителями Редактора и другими членами редакционной коллегии, а также с рецензентами, для принятии решений о публикации.
Редакция будет оценивать рукописи с точки зрения ее интеллектуального содержания без учета расы, цвета кожи, пола, сексуальной ориентации, религиозных убеждений, этнического происхождения, гражданства или политической философии автора (ов). Они не будут никому разглашать какую-либо информацию о рукописи, кроме автора (ов), рецензентов и потенциальных рецензентов, а в некоторых случаях членов редакционной коллегии "Turczaninowia" и членов команды управления журналом, в зависимости от обстоятельств. Кроме того, редакция будет прилагать все усилия, чтобы обеспечить целостность процесса слепого рецензирования, не раскрывая личности автора (ов) рукописи для рецензентам этой рукописи, и наоборот.
При оценке рукописи для публикации, в дополнение к рассмотрению стандартных критериев, относящихся к строгости рукописи, качеству ее предоставления, а также ее вклад в область научных знаний, редакторы также будут руководствоваться тем, насколько этические нормы были соблюдены, и вред был сведен к минимуму при проведении исследования. Они также оценивают насколько полученные научные и практические выгоды перевешивают вред в случае конкретного исследования.
Так как "Turczaninowia" приветствует предоставление рукописей из любой страны, необходимо признать, что законы и нормативные акты, касающиеся этики научных исследований и этического утверждения, различаются во всем мире. Таким образом, редакторам, возможно, придется обратиться за разъяснениями в связи с этим к автору (ам) с просьбой о том, чтобы они представили письмо от соответствующего институционального комитета по этике или совета, который одобрил исследование.
Редакция будет руководствоваться Руководством CORE для изъятия статей при рассмотрении любых спорных вопросов, которые были опубликованы в AASRJ. Редакторы готовы работать в тесном сотрудничестве с научно-исследовательскими организациями и учреждениями в соответствии с рекомендациями CORE о сотрудничестве между научно-исследовательскими институтами и журналами в области публикационной этики и этики проведения исследований.
"Turczaninowia" является журналом открытого доступа, что означает, что все его содержимое свободно и доступно бесплатно для пользователя или его / ее учреждения. Пользователи могут читать, загружать, копировать, распространять, печатать, выполнять поиск, делать ссылки на полные тексты статей в этом журнале, не спрашивая предварительного разрешения от издателя или автора. Это легитимно в соответствии с определением BOAI об открытом доступе.
Наш сайт демонстрирует знак Creative Commons, и это исключительное право автора, если он / она хочет, чтобы его / ее статьи были в свободном доступе или нет. Но мы должны опубликовать Резюме и метаданные статьи в полном доступе в любом случае.
