Изменчивость и специфичность сибирских видов Elymus transbaicalensis, E. komarovii, E. sajanensis, E. kronokensis (Poaceae) и некоторых морфологически отклоняющихся формпогистону H1
Аннотация
В результате протекания интрогрессивных и рекомбинационных процессов между видами рода ElymusL. в составе многих смешанных популяций появляются разные по численности совокупности морфологически отклоняющихся форм. С целью выявления уровней микроэволюционной дифференциации среди группы сибирских видов Elymuskomarovii, E. transbaicalensis, E. sajanensisиE. kronokensis проведено исследование электрофоретической изменчивости гистона Н1. Показано, что изменчивость E. komarovii в пределах Республики Алтай выше, чем у E. transbaicalensis, и некоторые биотипы E. komarovii идентичны по этому признаку большинству биотипов E. transbaicalensis. Морфологически отклоняющиеся формы E. transbaicalensis с нетипичными для этого видагладкими нижними цветковыми чешуями и приближающиеся по этому признаку к E. kronokensis являются одним из морфотиповE. transbaicalensis. Биотипы E. komarovii из классического местообитания в Восточном Саяне оказались идентичными по гистону Н1 некоторым биотипам из Горного Алтая, где предположительно расположен центр разнообразия E. komarovii. Наиболее изменчивым по составу субтипов гистона Н1 в пределах Сибири является E. sajanensis. Это может быть связано с тем, что вид образован множеством изолированных высокогорных популяций, некоторые из которых имеют происхождение от местных формE. transbaicalensis. Некоторые сибирские биотипы, соответствующие E. sajanensis и E. kronokensis из близких местообитаний, имели идентичные профили гистона Н1. Это косвенно свидетельствует о том, что сибирские биотипы, морфологически близкие к дальневосточным биотипам E. kronokensis, филогенетически отдалены от последних и, возможно, заслуживают самостоятельного таксономического ранга.
Скачивания
Metrics
Литература
Agafonov A. V., Agafonova O. V. 1992. SDS-electrophoresis of endosperm protein in Elymus L. species with different genomic consitution.Sib. Biol. Zhurn. 3: 7–12 [InRussian]. (Агафонов А. В., Агафонова О. В.SDS-электрофорез белков эндосперма у представителей рода Пырейник (ElymusL.) с различной геномной структурой // Сиб. биол. журн., 1992.Вып. 3. С. 7–12).
Agafonov A. V., IlyushkoM. V., SalomonB., DiazO., vonBothmerR. 2002. Biosystematic study of Elymuskomarovii (Poaceae) and its relationships with morphologically close taxa E. transbaicalensisand E. alaskanuss. l.
In: Problemy botaniki Juzhnoy Sibiri i Mongolii [Problems of botany of Southern Siberia and Mongolia: Proceedings of the I international scientific and practical conference]. AzBuka, Barnaul,83–95 pp. [In Russian]. (АгафоновА. В., ИлюшкоМ. В., СаломонБ., ДиасО., вонБотмерР. БиосистематическоеисследованиеElymus komarovii (Poaceae) всравнениисморфологическиблизкимитаксонамиE. transbaicalensis иE. alaskanus s. l. // Проблемы ботаники Южной Сибири и Монголии: Материалы I междунар.науч.-практ.конф. Барнаул: Изд-во «АзБука», 2002. С. 83–95. URL: http://elibrary.asu.ru/xmlui/bitstream/handle/asu/408/read.7book?sequence=1&isAllowed=y
Agafonov A. V., Salomon B., Kostina E. V., Diaz O. 1998. Biosystematic relationships between Elymuskomarovii (Nevski) Tzvel.and related species. Triticeae III. Ed. A. A. Jaradat. Science Publishers, Enfield, New Hampshire, 77–84 pp.
Barkworth M. E., Cambell J. J. N., Salomon B. 2007. Elymus L. In: Flora of North America. Vol. 24.Oxford University Press, New York & Oxford, 288–343 pp.
BeljaevA. I., BerdnikovV. A. 1985. Intraspecific polymorphism of a histone in wild-growing species of legumes. Russian journal of genetics 21(4): 605–613 [In Russian]. (БеляевА. И.,БердниковВ. А.Внутривидовойполиморфизмгистонадикорастущихвидовбобовых // Генетика, 1985. Т. 21, № 4. С. 605–613).
Berdnikov V. A., Bogdanova V. S., Gorel F. L., Kosterin O. E. Trusov Yu. A. 2003. Borovikov V. P. 1998. Populyarnoyevvedeniye v programmu STATISTICA [Popular introduction into the program STATISTICA].KompyuterPress, Moscow, 267 pp. [InRussian]. (БоровиковВ. П.ПопулярноевведениевпрограммуSTATISTICA.М.: Компьютер Пресс, 1998. 267 с.).
Berdnikov V. A., BogdanovaV. S., GorelF. L., RozovS. M. 1992. Territorial distribution of histone H1 alleles in a population of Viciaunijuga A. Br. formed after urbanization of natural habitat. Can. J. Bot. 70: 1591–1595.DiazO., SalomonB., BothmerR. von. 1999. Genetic variation and differentiation in Nordic populations of Elymusalaskanus (Scrib. ex Merr.) Lӧve (Poaceae). Theor. Appl. Genet. 99: 210–217.
Fyodorov D. V., Zhou B. R., Skoultchi A. I., Bai Y. 2018. Emerging roles of linker histones in regulating chromatin structure and function.Nat. Rev. Mol. Cell Biol.19(3): 192–206. DOI: 10.1038/nrm.2017.94
Gantt J. S., Lenvik T. R. 1991. Arabidopsis thaliana H1 histones.Analysis of two members of a small gene family.Eur. J. Biochem. 202: 1029–1039.
Gerus D. E., Agafonov A. V. 2007a. Evidence of interspecific introgression in compound populations of Elymuskomarovii, E. transbaicalensis (Triticeae: Poaceae) and some morphologically similar species in Altai Mountains. Sib. botan.vestnik[Siberian botanical reporter: electronical journal] 2(1): 17–25 [In Russian]. (Герус Д. Е., Агафонов А. В.Свидетельства межвидовой интрогрессии в смешанных популяциях Elymuskomarovii, E. transbaicalensis (Triticeae:Poaceae) и некоторых морфологически близких видов Горного Алтая // Сиб. ботан. вестник: электронный журнал, 2007а. Т. 2, вып. 1. С. 17–25).URL: http://www.csbg.nsc.ru/uploads/journal.csbg.ru/pdfs/i2.pdf
Gerus D. E., Agafonov A. V. 2007b. Endosperm proteins as markers of interspecific introgression in compound populations of Elymuskomarovii, E. transbaicalensis, E. sajanensisand E. «kronokensis» (Triticeae: Poaceae) in the Eastern Sayan. Sib. botan.vestnik [Siberian botanical reporter: electronical journal] 2(2): 33–42 [In Russian]. (ГерусД. Е.,АгафоновА. В.Белкиэндосперма – маркерымежвидовойинтрогрессиивсмешанныхпопуляцияхElymuskomarovii, E. transbaicalensis, E. sajanensisи E. «kronokensis» (Triticeae: Poaceae) ВосточногоСаяна // Сиб. ботан. вестник: электронныйжурнал, 2007б. Т. 2, вып. 2. С. 33–42).URL: http://www.csbg.nsc.ru/uploads/journal.csbg.ru/pdfs/i3.pdf
Hurley C. K., Stout J. T. 1980.Maize histone H1, a partial structural characterization.Biochemistry 19: 410–416.
Ivanchenko M., Georgieva E., Uschewa A., Avramova Z. 1987. A study on the heterogeneity of histone H1 from dry maize embryos.Eur. J. Biochem. 162: 339–344.
Jenuwein T., Allis C. D. 2002. Translating the histone code.Science 293: 1074–1080.
Jerzmanowski A., Przewłoka M., Grasser K. D. 2000. Linker histones and HMG1 proteins of higher plants.Plant Biology 2: 586–597.
Kasinsky H. E., Lewis J. D., Dacks J. B., Austio J. 2001. Origin of H1 linker histones.FASEB J. 15: 34–41.
Kobozeva E. V., Agafonov A. V. 2016. Reproductive relations between taxa of an Asian part of Russia Elymuskronokensis and E. sajanensis close to the North American complex E. alaskanus s. l. (Poaceae: Triticeae). In: Sokhraneniyeraznoobraziyarastitelnogomira v botanicheskikhsadakh: traditsii, sovremennost, perspektivy[Conservation of plant diversity in botanical gardens: traditions, current situation and future: proceedings of international conference dedicated to the 70-th anniversary of Central Siberian Botanical Garden SB RAS]. Novosibirsk, 147–150 pp. [InRussian].(Кобозева Е. В., Агафонов А. В. Репродуктивные отношения между таксонами азиатской части РоссииElymus kronokensis иE. sajanensis, близкими к северо-американскому комплексуE. alaskanuss. l.(Poaceae:Triticeae) // Сохранение разнообразия растительного мира в ботанических садах: традиции, современность, перспективы: Материалы междунар. конф., посвящ. 70-летию Центрального сибирского ботанического сада (1–8 августа 2016 г., Новосибирск). Новосибирск: ЦСБС СО РАН, 2016. С. 147–150).
Kornberg R. D., Lorch Y. 1999. Twenty-fiveyearsofthenucleosome, fundamentalparticle of the eukaryote chromosome. Cell 98: 285–294.
Kosterin O. E., Bogdanova V. S., Gorel F. L., Rozov S. M., Trusov Yu. A., Berdnikov V. A. 1994. Histone H1 of the garten pea (Pisumsativum L.): composition, developmental changes, allelic polymorphism and inheritance. Plant Science 101: 189–202.
Kostina E. V., Agafonov A. V. 2002. Electrophoretic study of polymorphism of grain storage proteins and histone H1 in Elytrigiarepens (Poaceae). Bot. Zhurn. (Moscow & St. Petersburg) 87(3): 106–115 [In Russian]. (КостинаЕ. В.,АгафоновА. В.ИзменчивостьзапасныхбелковигистонаH1 уElytrigiarepensподаннымэлектрофореза // Бот. журн., 2002. Т. 87, № 3. С. 106–115).
Krech A. B., Wulff D., Grasser K. D., Feix D. 1999. Plant chromosomal HMGI/Y proteins and histone H1 exhibit a protein domain of common origin. Gene 230(1): 1–5.
Lӧve A. 1984. Conspectus of the Triticeae.FeddesRepert. 95: 425–521.
Over R. S., Michaels S. D. 2014. Open and closed: the roles of linker histones in plants and animals. Mol. plant. 7(3): 481–491. DOI: 10.1093/mp/sst164
Peshkova G. A. 1990. Elymus L. In: Flora Sibiri [Flora of Siberia]. Vol. 2. 17–32 pp. [In Russian]. (ПешковаГ. А.Elymus L. – Пырейник // ФлораСибири. Т. 2. Новосибирск, 1990. С. 17–32).
Rosa S., Shaw P. 2013. Insights into chromatin structure and dynamics in plants. Biology 2(4): 1378–1410. DOI: 10.3390/biology2041378
Rozov S. M., Bogdanova V. S., Berdnikov V. A. 1986. Differences in chromosomal localization of genes encoding pea H1 histone fractions. Russian journal of genetics 22(8): 2159–2167 [In Russian]. (РозовС. М., БогдановаВ. С., БердниковВ. А. Различиявхромосомнойлокализациигенов, кодирующихфракциигистона H1 гороха // Генетика, 1986. Т. 22,№ 8. C. 2159–2167).
ShkutinaF. M., Jakubov L. A., BerdnikovV. A. 1977. Subfractional composition of lysine-rich histone H1 under conditions of gene interaction in the tribe Triticinae.Russian journal of genetics13(9): 1517–1523 [In Russian]. (ШкутинаФ. М., ЯкубовЛ. А., БердниковВ. А.Субфракционный состав лизин-богатогогистона Н1 в условия хгенного взаимодействия в трибеTriticinae // Генетика, 1977. Т. 13, № 9. С. 1517–1523).
Spiker S. 1975. An evolution comparison of plant histones. Biochem. and Biophys. Acta 400: 461.
Spiker S. 1982.Histone variants in plants.J. Biol. Chem. 257(23): 14250–14255.
Sun G. L., Salomon B., Bothmer R. von. 1998. Characterization of microsatellite loci from Elymusalaskanus and length polymorphism in several Elymus species (Triticeae: Poaceae). Genome 41: 455–463.
Wierzbicki A. T., Jerzmanowski A. 2005. Suppression of Histone H1 Genes in Arabidopsis Results in Heritable Developmental Defects and Stochastic Changes in DNA Methylation.Genetics 169: 997–1008.
Уведомление об авторских правах
Turczaninowiа является "золотым издателем", так как мы позволяем самоархивирование, но самое главное, мы полностью прозрачны в своих правах.
Авторы могут представить и обсудить свои выводы перед публикацией: в биологических или научных конференций, на допечатной серверах, в общедоступных базах данных, а также в блогах, вики, твиттерах и другие неформальных каналах связи.
Turczaninowiа позволяет авторам внести рукописи (находящуюся в настоящее время на рассмотрении или тех, которые предполагается предоставить в Turczaninowia) для архивирования в некоммерческих, допечатных серверах, таких как ArXiv.
Авторы, публикующиеся в этом журнале согласны со следующими условиями: авторы сохраняют свои авторские права и предоставляют журналу право первой публикации в связи с работой, которая одновременно распространяется по лицензии Creative Commons Attribution и позволяют другим иметь доступ к работе с признанием авторства этой работы и первоначальной публикацией в этом журнале. Авторы могут заключать отдельные, дополнительные договорные соглашения по неисключительному распространению опубликованной версии (например, разместить ее в институтском репозитории или опубликовать в книге), с признанием ее первоначальной публикации в этом журнале.
Авторам разрешается и рекомендуется размещать их работу в Интернете (например, в институциональных хранилищах или на их сайте) до и во время процесса подачи, так как это может привести к продуктивным обменам, а также увеличению цитирования опубликованных работ (см. Политика открытого доступа)
Политика открытого доступа.
Заявление о конфиденциальности
Имена и адреса электронной почты, поданные при публикации в этом журнале, сайт будет использоваться исключительно для заявленных целей данного журнала, и они не будут доступны для любых других целей или какой-либо другой стороне.
Наша публикационная этика журнала основана, в значительной степени, на руководящих принципах и стандартах, разработанных Комитетом по этике публикации (COPE). Соответствующие обязанности и права авторов, рецензентов и редакторов журнала изложены ниже.
ОБЯЗАННОСТИ АВТОРОВ
Отправляя рукопись "Turczaninowia", автор (ы) гарантирует, что они отправляют рукопись как свою собственную, оригинальную работу, и что она не имеет ни были опубликованы ранее, и в настоящее время не рассматривается для публикации в других изданиях. Они также гарантируют, что источники каких-либо идей и / или слов в рукописи, которые не являются их собственными, были должным образом приписаны с помощью соответствующего цитирования.
Автор обычно не должен издавать рукописи, описывающие по существу те же исследования, в нескольких журналах или прочих публикациях. Такая избыточная публикация обычно считается неэтичным поведением, и в случае обнаружения, может привести к отклонению рассматриваемой рукописи рассматриваемого отвергаются, или опубликованная статья будет изъята.
Авторы рукописей, освещающих оригинальные исследования должны представить точный отчет о выполненной работе, в сопровождении объективного обсуждения его значения. Основополагающие данные должны быть представлены точно и полно в рукописи. Рукопись должна содержать достаточно подробные данные и ссылки, чтобы позволять другим дублировать работу. Подтасовка результатов и изготовление поддельных или заведомо неточных утверждений является неэтичным поведением и может быть причиной для отклонения или изъятия рукописи или опубликованной статьи.
Там, где в статьях есть отчеты о использовании коммерческого программного обеспечения, аппаратных средств или других продуктов, авторы должны подать декларацию в начале рукописи, в которой они должны заявить, что никакого конфликта интересов не существует или описать характер любого потенциального конфликта. Все источники финансовой поддержки для исследования также должны быть раскрыты в рукописи.
Автор (ы) рукописи соглашаются, что, если рукопись принята к публикации в "Turczaninowia", опубликованная статья будет характьеризоваться авторскими правами с использованием "Attribution-Unported" лицензии Creative Commons. Эта лицензия позволяет автору (ам) сохранить авторские права, но и позволяет другим свободно копировать, распространять и отображать произведение и производные работы, основанные на ней, при определенных заданных условиях.
Имена авторов должны быть перечислены на статье в порядке их вклада в статью, и все авторы берут на себя ответственность за свои собственные результаты. Только те люди, которые внесли существенный вклад, должны быть перечислены в качестве авторов; те, чьи вклады являются косвенными или маргинальными (например, коллег или руководителей, которые рассмотрели проекты работы или оказывали помощь в корректуре, и руководители научно-исследовательских институтов / центров / лабораторий) должны быть названы в разделе «Выражение признательности» в конце статьи, непосредственно предшествующему Списку литературы.
Автор, подающий статью, должен обеспечить, чтобы все соавторы былм включены в статью, и что все соавторы видели и одобрили окончательный вариант статьи и согласились на его публикацию.
Там, где автор обнаруживает существенную ошибку или неточность в статье, которая была уже опубликована в "Turczaninowia", он / она обязана незамедлительно уведомить редакцию и сотрудничать с ними, чтобы исправить статью или отозвать ее в случае необходимости.
ОБЯЗАННОСТИ РЕЦЕНЗЕНТОВ
В журнале "Turczaninowia" рецензенты выполняют работу для журнала на добровольной основе. Учитывая, что большинство из этих людей находятся в полной занятости, их рецензирование для "Turczaninowia" должна выолняться по мере необходимости, а не быть их главным приоритетом. Рецензенты могут свободно отклонять приглашения для рассмотрения конкретных рукописей по своему усмотрению, например, если их текущая нагрузка, занятость и / или другие обязательства могут сделать ее непомерно высокой для того, чтобы завершить обзор своевременно и уделить должное время рецензированию. Они также не должны принимать рукописи на рецензию, в тематике которых они не чувствуют себя подходящим специалистом.
Рецензенты, которые приняли рукописи, как правило, должны предоставить свои рецензии в течение трех недель. Они должны отказаться от рецензии, если становится очевидным для них на любой стадии, что они не обладают необходимыми знаниями для выполнения рецензии, или что они могут иметь потенциальный конфликт интересов при проведении рецензии (например, в результате конкурентных исследований, совместных или других отношений или связей с кем-либо из авторов, учреждений или компаний, связанных с рукописью).
Информация или идеи, полученные рецензентами в процессе рецензирования должны храниться в тайне и не используются для личной выгоды. Любые рукописи, полученные для рассмотрения, должны рассматриваться как конфиденциальные документы, и не должны быть показаны или обсуждены с другими, если только это не санкционировано редакторами "Turczaninowia".
При проведении своих рецензий, рецензентам необходимо сделать это как можно более объективно, воздерживаться от участия в личной критики автора (ов). Им предлагается высказать свое мнение четко, объясняя и оправдывая все рекомендации. Они всегда должны пытаться представить подробную и конструктивную обратную связь, чтобы помочь автору (ам) в повышении эффективности их работы, даже если рукопись, по их мнению, не подлежит опубликованию.
Рецензенты должны определить в своих рецензиях соответствующие опубликованные работы, которые не были названы автором (ами), вместе с любыми примерами, где не было сделано надлежащее цитирование источников. Они должны привлечь внимание ответственного редактора в отношении каких-либо серьезных сходств между рукописью, поданной на рассмотрение и других опубликованных статей, или статей, о которых им известно, а также предотвратить любые проблемы, которые могут иметь место по отношению к этической приемлемости исследований, представленных в рукописи.
ОБЯЗАННОСТИ РЕДАКЦИИ
Редактор журнала "Turczaninowia" несет полную ответственность за решение о публикации рукописи, которая представляется в "Turczaninowia", и при этом руководствуется политикой журнала, и в соответствии с определенными редакцией "Turczaninowia" юридическими требованиями в отношении клеветы, нарушения авторских прав и плагиата. Редактор может проконсультироваться с заместителями Редактора и другими членами редакционной коллегии, а также с рецензентами, для принятии решений о публикации.
Редакция будет оценивать рукописи с точки зрения ее интеллектуального содержания без учета расы, цвета кожи, пола, сексуальной ориентации, религиозных убеждений, этнического происхождения, гражданства или политической философии автора (ов). Они не будут никому разглашать какую-либо информацию о рукописи, кроме автора (ов), рецензентов и потенциальных рецензентов, а в некоторых случаях членов редакционной коллегии "Turczaninowia" и членов команды управления журналом, в зависимости от обстоятельств. Кроме того, редакция будет прилагать все усилия, чтобы обеспечить целостность процесса слепого рецензирования, не раскрывая личности автора (ов) рукописи для рецензентам этой рукописи, и наоборот.
При оценке рукописи для публикации, в дополнение к рассмотрению стандартных критериев, относящихся к строгости рукописи, качеству ее предоставления, а также ее вклад в область научных знаний, редакторы также будут руководствоваться тем, насколько этические нормы были соблюдены, и вред был сведен к минимуму при проведении исследования. Они также оценивают насколько полученные научные и практические выгоды перевешивают вред в случае конкретного исследования.
Так как "Turczaninowia" приветствует предоставление рукописей из любой страны, необходимо признать, что законы и нормативные акты, касающиеся этики научных исследований и этического утверждения, различаются во всем мире. Таким образом, редакторам, возможно, придется обратиться за разъяснениями в связи с этим к автору (ам) с просьбой о том, чтобы они представили письмо от соответствующего институционального комитета по этике или совета, который одобрил исследование.
Редакция будет руководствоваться Руководством CORE для изъятия статей при рассмотрении любых спорных вопросов, которые были опубликованы в AASRJ. Редакторы готовы работать в тесном сотрудничестве с научно-исследовательскими организациями и учреждениями в соответствии с рекомендациями CORE о сотрудничестве между научно-исследовательскими институтами и журналами в области публикационной этики и этики проведения исследований.
"Turczaninowia" является журналом открытого доступа, что означает, что все его содержимое свободно и доступно бесплатно для пользователя или его / ее учреждения. Пользователи могут читать, загружать, копировать, распространять, печатать, выполнять поиск, делать ссылки на полные тексты статей в этом журнале, не спрашивая предварительного разрешения от издателя или автора. Это легитимно в соответствии с определением BOAI об открытом доступе.
Наш сайт демонстрирует знак Creative Commons, и это исключительное право автора, если он / она хочет, чтобы его / ее статьи были в свободном доступе или нет. Но мы должны опубликовать Резюме и метаданные статьи в полном доступе в любом случае.
