Critical revision of the myxomycete (Myxomycetes, Myxomycota) collection at the Mycological herbarium LEP. I. Yaroslavl Region
UDC 582.24:581.95(470.316)
Keywords:
Amoebozoa, history of mycology, Myxogastrea, rare species, slime molds, VIZR
Abstract
Scientific collections are the basis for studying biological diversity. The Mycological herbarium of the A. A. Jaczewski Laboratory of mycology and phytopathology (LEP), All-Russian Institute of Plant Protection (Saint Petersburg, Pushkin), was founded at the end of the 19th century and is one of the oldest mycological herbaria in Russia. In the period from 2018 to 2024, a critical revision of the collection of myxomycete fructifications numbering about 2000 herbarium specimens was carried out. The herbarium contains a series of 73 specimens collected in spring–summer 1916 in the Yaroslavl Governorate by I. P. Javoronkowa. Information about this collection has not been published yet. As a result of the revision, 42 species and 3 varieties belonging to 21 genera of myxomycetes were identified, of which 32 species and 3 varieties are new for the Yaroslavl Region, including the first record of Enteridium simulans for Russia. An additional analysis of literary sources allowed us to expand this list to 46 species from 22 genera. The present work is the first step for further study of myxomycetes in this part of Russia.
Downloads
Download data is not yet available.
Metrics
Metrics Loading ...
References
Барсукова Т. Н., Дунаев Е. А. Аннотированный список слизевиков (Myxomycota) Московской области // Микология и фитопатология, 1997. Т. 31, вып. 2. С. 1–8.
Берестецкая Л. И., Дмитриев А. П., Левитин М. М. Микологический гербарий всероссийского института защиты растений // Вестник защиты растений, 2012. Т. 3. С. 58–61.
Borg Dahl M., Brejnrod A. D., Unterseher M., Hoppe T., Feng Y., Novozhilov Y., Sørensen S. J., Schnittler M. 2018. Genetic barcoding of dark-spored myxomycetes (Amoebozoa) – Identification, evaluation and application of a sequence similarity threshold for species differentiation in NGS studies. Mol. Ecol. Resour. 18(2): 306–318. https://doi.org/10.1111/1755-0998.12725
Bortnikov F. M., Matveev A. V., Gmoshinskiy V. I., Novozhilov Yu. K., Zemlyanskaya I. V., Vlasenko A. V., Schnittler M., Shchepin O. N., Fedorova N. A. 2020. Myxomycetes of Russia: a history of research and a checklist of species. Karstenia 58, 2: 316–373. https://doi.org/10.29203/ka.2020.502
Bradshaw M., Tobin P. C. 2020. Sequencing herbarium specimens of a common detrimental plant disease (powdery mildew). Phytopathology 110(7): 1248–1254. https://doi.org/10.1094/PHYTO-04-20-0139-PER
Chapman A. D. 2005. Uses of primary species‐occurrence data, version 1.0. Report for the Global Biodiversity Information Facility. Copenhagen: Global Biodiversity Information Facility. 106 pp.
de Vere N., Rich T. C., Trinder S. A., Long C. 2015. DNA barcoding for plants. Methods Mol. Biol. 1245: 101 118. https://doi.org/10.1007/978-1-4939-1966-6_8
dela Cruz T. E. E., Kuhn R. V., Javier A. O. M., Parra C. M., Quimio T. H. 2009. Status of the Myxomycete Collection at the UPLB-Museum of Natural History (UPLB-MNH) Mycological Herbarium. Philipp. J. Syst. Biol. 3, 1: 97–111. https://doi.org/10.3860/pjsb.v3i1.1015
Елина О. Ю. Дамы на полях: образование и карьера первых женщин-агрономов, конец XIX – начало XX вв. // Историко-биологические Исследования, 2018. Т. 10, № 2. C. 67–99. https://doi.org/10.24411/2076-8176-2018-11957
Fiore-Donno A. M., Kamono A., Chao E. E., Fukui M., Cavalier-Smith T. 2010. Invalidation of Hyperamoeba by transferring its species to other genera of Myxogastria. J. Eukaryot. Microbiol. 57(2): 189–196. https://doi.org/10.1111/j.1550-7408.2009.00466.x
Gmoshinskiy V. I., Matveev A. V., Gubanov E. S., Bortnikov F. M., Dunayev E. A. 2020. Critical revision of the Myxomycetes collection of Young Naturalists Club of Zoological Museum of Moscow State University. Botanica Pacifica 9(2): 175–190. https://doi.org/10.17581/bp.2020.09211
Ing B. 1999. The myxomycetes of Britain and Ireland. London: The Richmond Publishing Co. Ltd. 374 pp.
James S. A., Soltis P. S., Belbin L., Chapman A. D., Nelson G., Paul D. L., Collins M. 2018. Herbarium data: Global biodiversity and societal botanical needs for novel research. Appl. Plant Sci. 6, 2: e1024. https://doi.org/10.1002/aps3.1024
Javoronkowa J. [I. P.] 1914. Note préliminare concernant des observations sur la germination des spores de Didymium difforme Duby. Bulletin de la Société Mycologique de France 30: 402–405.
Жаворонкова И. П. Новый паразитъ въ спорахъ миксомицетовъ: Ramularia myxophaga n. sp. // Журналъ микробіологiи, 1915. Т. 2, № 1–2. С. 1–18.
Жаворонкова И. П. Практикум по бактериозам растений. М.: Сельхозгиз, 1931. 64 c.
Хохряков М. К., Потлайчук В. И. Микологический гербарий Всесоюзного научно-исследовательского института защиты растений // Труды всесоюзного научно-исследовательского института защиты растений, 1972. Вып. 33. С. 68–74.
Комплексная биоэкологическая оценка состояния памятника природы «Дубрава деревень Чашницы, Ям»: отчет о научно-исследовательской работе. Отв. ред. О. А. Маракаев. Ярославль: ЯрГУ, 2016. 151 с.
Комплексная биоэкологическая оценка состояния леса в местечке «Касарка» на территории Национального парка «Плещеево озеро»: отчет о научно-исследовательской работе. Отв. ред. О. А. Маракаев. Ярославль: ЯрГУ, 2017. 132 с.
Комплексная биоэкологическая оценка состояния северного побережья озера Плещеево: отчет о научно-исследовательской работе. Отв. ред. О. А. Маракаев. Ярославль: ЯрГУ, 2020. 226 с.
Кондакова Г. В. Аннотированный список грибов. Ярославль: Ярославский государственный университет им. П. Г. Демидова, 2024. URL: https://www.uniyar.ac.ru/faculties/biological/divisions/statsionarnaya-biologicheskaya-stantsiya/bioraznoobrazie/grib.php [дата обращения: 25.03.2024].
Leontyev D., Ishchenko Y., Schnittler M. 2023. Fifteen new species from the myxomycete genus Lycogala. Mycologia 115(4): 524–560. https://doi.org/10.1080/00275514.2023.2199109
Leontyev D. W., Schnittler M., Stephenson S. L., Novozhilov Yu. K. 2019. Systematic revision of the Tubifera casparyi – T. dictyoderma complex: Resurrection of the genus Siphoptychium and introduction of the new genus Thecotubifera. Mycologia 111(6): 981–997. https://doi.org/10.1080/00275514.2019.1660842
Липшиц С. Ю. Русские ботаники. Биографическо-библиографический словарь. Т. 3. М.: Изд-во Московского общества испытателей природы, 1950. 488 с.
Martin G. W., Alexopoulos C. J. 1969. The Myxomycetes. Iowa City: Iowa University Press. 560 pp.
Moreno G., Oltra M. 2010. Notas sobre los géneros Badhamia, Badhamiopsis y Craterium (Myxomycetes) en España. Bol. Soc. Micol. Madrid 34: 161–197.
Moreno G., Castillo A. 2013. A comparative study of the types of three species of Myxomycetes: Trichia crateriformis, T. fallax var. olivacea and T. fernbankensis. Bol. Soc. Micol. Madrid 37: 85–98.
Nannenga-Bremekamp N. E. 1973. Notes on Myxomycetes XIX. Proc. K. ned. Akad. Wet., Section, C 76: 476 488.
Poulain M., Meyer M., Bozonnet J. 2011. Les Myxomycétes. Tome 1, Guide de determination. Sévrier: Mycologique et botanique DauphinéSavoie. 568 pp.
Ronikier A., Janik P., de Haan M., Kuhnt A., Zankowicz M. 2022. Importance of type specimen study for understanding genus boundaries-taxonomic clarifications in Lepidoderma based on integrative taxonomy approach leading to resurrection of the old genus Polyschismium. Mycologia 114(6): 1008–1031. https://doi.org/10.1080/00275514.2022.2109914
Willis C. G., Ellwood E. R., Primack R. B., Davis C. C., Pearson K. D., Gallinat A. S., Yost J. M., Nelson G., Mazer S.J., Rossington N. L., Sparks T. H., Soltis P. S. 2017. Old plants, new tricks: phenological research using herbarium specimens. Trends Ecol. Evol. 32(7): 531–546. https://doi.org/10.1016/j.tree.2017.03.015
Ячевский А. А. Микологическая флора Европейской и Азиатской России. Слизевики. М.: Типо-Литография В. Рихтера. 1907. 410 с.
Берестецкая Л. И., Дмитриев А. П., Левитин М. М. Микологический гербарий всероссийского института защиты растений // Вестник защиты растений, 2012. Т. 3. С. 58–61.
Borg Dahl M., Brejnrod A. D., Unterseher M., Hoppe T., Feng Y., Novozhilov Y., Sørensen S. J., Schnittler M. 2018. Genetic barcoding of dark-spored myxomycetes (Amoebozoa) – Identification, evaluation and application of a sequence similarity threshold for species differentiation in NGS studies. Mol. Ecol. Resour. 18(2): 306–318. https://doi.org/10.1111/1755-0998.12725
Bortnikov F. M., Matveev A. V., Gmoshinskiy V. I., Novozhilov Yu. K., Zemlyanskaya I. V., Vlasenko A. V., Schnittler M., Shchepin O. N., Fedorova N. A. 2020. Myxomycetes of Russia: a history of research and a checklist of species. Karstenia 58, 2: 316–373. https://doi.org/10.29203/ka.2020.502
Bradshaw M., Tobin P. C. 2020. Sequencing herbarium specimens of a common detrimental plant disease (powdery mildew). Phytopathology 110(7): 1248–1254. https://doi.org/10.1094/PHYTO-04-20-0139-PER
Chapman A. D. 2005. Uses of primary species‐occurrence data, version 1.0. Report for the Global Biodiversity Information Facility. Copenhagen: Global Biodiversity Information Facility. 106 pp.
de Vere N., Rich T. C., Trinder S. A., Long C. 2015. DNA barcoding for plants. Methods Mol. Biol. 1245: 101 118. https://doi.org/10.1007/978-1-4939-1966-6_8
dela Cruz T. E. E., Kuhn R. V., Javier A. O. M., Parra C. M., Quimio T. H. 2009. Status of the Myxomycete Collection at the UPLB-Museum of Natural History (UPLB-MNH) Mycological Herbarium. Philipp. J. Syst. Biol. 3, 1: 97–111. https://doi.org/10.3860/pjsb.v3i1.1015
Елина О. Ю. Дамы на полях: образование и карьера первых женщин-агрономов, конец XIX – начало XX вв. // Историко-биологические Исследования, 2018. Т. 10, № 2. C. 67–99. https://doi.org/10.24411/2076-8176-2018-11957
Fiore-Donno A. M., Kamono A., Chao E. E., Fukui M., Cavalier-Smith T. 2010. Invalidation of Hyperamoeba by transferring its species to other genera of Myxogastria. J. Eukaryot. Microbiol. 57(2): 189–196. https://doi.org/10.1111/j.1550-7408.2009.00466.x
Gmoshinskiy V. I., Matveev A. V., Gubanov E. S., Bortnikov F. M., Dunayev E. A. 2020. Critical revision of the Myxomycetes collection of Young Naturalists Club of Zoological Museum of Moscow State University. Botanica Pacifica 9(2): 175–190. https://doi.org/10.17581/bp.2020.09211
Ing B. 1999. The myxomycetes of Britain and Ireland. London: The Richmond Publishing Co. Ltd. 374 pp.
James S. A., Soltis P. S., Belbin L., Chapman A. D., Nelson G., Paul D. L., Collins M. 2018. Herbarium data: Global biodiversity and societal botanical needs for novel research. Appl. Plant Sci. 6, 2: e1024. https://doi.org/10.1002/aps3.1024
Javoronkowa J. [I. P.] 1914. Note préliminare concernant des observations sur la germination des spores de Didymium difforme Duby. Bulletin de la Société Mycologique de France 30: 402–405.
Жаворонкова И. П. Новый паразитъ въ спорахъ миксомицетовъ: Ramularia myxophaga n. sp. // Журналъ микробіологiи, 1915. Т. 2, № 1–2. С. 1–18.
Жаворонкова И. П. Практикум по бактериозам растений. М.: Сельхозгиз, 1931. 64 c.
Хохряков М. К., Потлайчук В. И. Микологический гербарий Всесоюзного научно-исследовательского института защиты растений // Труды всесоюзного научно-исследовательского института защиты растений, 1972. Вып. 33. С. 68–74.
Комплексная биоэкологическая оценка состояния памятника природы «Дубрава деревень Чашницы, Ям»: отчет о научно-исследовательской работе. Отв. ред. О. А. Маракаев. Ярославль: ЯрГУ, 2016. 151 с.
Комплексная биоэкологическая оценка состояния леса в местечке «Касарка» на территории Национального парка «Плещеево озеро»: отчет о научно-исследовательской работе. Отв. ред. О. А. Маракаев. Ярославль: ЯрГУ, 2017. 132 с.
Комплексная биоэкологическая оценка состояния северного побережья озера Плещеево: отчет о научно-исследовательской работе. Отв. ред. О. А. Маракаев. Ярославль: ЯрГУ, 2020. 226 с.
Кондакова Г. В. Аннотированный список грибов. Ярославль: Ярославский государственный университет им. П. Г. Демидова, 2024. URL: https://www.uniyar.ac.ru/faculties/biological/divisions/statsionarnaya-biologicheskaya-stantsiya/bioraznoobrazie/grib.php [дата обращения: 25.03.2024].
Leontyev D., Ishchenko Y., Schnittler M. 2023. Fifteen new species from the myxomycete genus Lycogala. Mycologia 115(4): 524–560. https://doi.org/10.1080/00275514.2023.2199109
Leontyev D. W., Schnittler M., Stephenson S. L., Novozhilov Yu. K. 2019. Systematic revision of the Tubifera casparyi – T. dictyoderma complex: Resurrection of the genus Siphoptychium and introduction of the new genus Thecotubifera. Mycologia 111(6): 981–997. https://doi.org/10.1080/00275514.2019.1660842
Липшиц С. Ю. Русские ботаники. Биографическо-библиографический словарь. Т. 3. М.: Изд-во Московского общества испытателей природы, 1950. 488 с.
Martin G. W., Alexopoulos C. J. 1969. The Myxomycetes. Iowa City: Iowa University Press. 560 pp.
Moreno G., Oltra M. 2010. Notas sobre los géneros Badhamia, Badhamiopsis y Craterium (Myxomycetes) en España. Bol. Soc. Micol. Madrid 34: 161–197.
Moreno G., Castillo A. 2013. A comparative study of the types of three species of Myxomycetes: Trichia crateriformis, T. fallax var. olivacea and T. fernbankensis. Bol. Soc. Micol. Madrid 37: 85–98.
Nannenga-Bremekamp N. E. 1973. Notes on Myxomycetes XIX. Proc. K. ned. Akad. Wet., Section, C 76: 476 488.
Poulain M., Meyer M., Bozonnet J. 2011. Les Myxomycétes. Tome 1, Guide de determination. Sévrier: Mycologique et botanique DauphinéSavoie. 568 pp.
Ronikier A., Janik P., de Haan M., Kuhnt A., Zankowicz M. 2022. Importance of type specimen study for understanding genus boundaries-taxonomic clarifications in Lepidoderma based on integrative taxonomy approach leading to resurrection of the old genus Polyschismium. Mycologia 114(6): 1008–1031. https://doi.org/10.1080/00275514.2022.2109914
Willis C. G., Ellwood E. R., Primack R. B., Davis C. C., Pearson K. D., Gallinat A. S., Yost J. M., Nelson G., Mazer S.J., Rossington N. L., Sparks T. H., Soltis P. S. 2017. Old plants, new tricks: phenological research using herbarium specimens. Trends Ecol. Evol. 32(7): 531–546. https://doi.org/10.1016/j.tree.2017.03.015
Ячевский А. А. Микологическая флора Европейской и Азиатской России. Слизевики. М.: Типо-Литография В. Рихтера. 1907. 410 с.
Published
2025-06-30
How to Cite
Gmoshinskiy V. I., Kireeva N. I., Sakulin S. V., Matveev A. V., Novozhilov Y. K. Critical revision of the myxomycete (Myxomycetes, Myxomycota) collection at the Mycological herbarium LEP. I. Yaroslavl Region // Turczaninowia, 2025. Vol. 28, № 2. P. 36-50 DOI: 10.14258/turczaninowia.28.2.3. URL: https://turczaninowia.asu.ru/article/view/17506.
Section
Science articles
Turczaninowia is a golden publisher, as we allow self-archiving, but most importantly we are fully transparent about your rights.
Authors may present and discuss their findings ahead of publication: at biological or scientific conferences, on preprint servers, in public databases, and in blogs, wikis, tweets, and other informal communication channels.
Turczaninowia allows authors to deposit manuscripts (currently under review or those for intended submission to Turczaninowia) in non-commercial, pre-print servers such as ArXiv.
Authors who publish with this journal agree to the following terms:
- Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.
- Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.
- Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access).
