Критическая ревизия коллекции миксомицетов (Myxomycetes, Myxomycota) микологического гербария LEP. I. Ярославская область
УДК 582.24:581.95(470.316)
Аннотация
Научные коллекции являются основой для изучения биологического разнообразия. Микологический гербарий лаборатории микологии и фитопатологии имени А. А. Ячевского Всероссийского научно-исследовательского института защиты растений (Санкт-Петербург, г. Пушкин), был основан конце XIX в. и является одним из старейших микологических гербариев в России. В период с 2018 по 2024 гг. была проведена критическая ревизия коллекции плодовых тел миксомицетов, насчитывающей около 2000 гербарных образцов. В гербарии находится серия из 73 образцов, которые были собраны весной – летом 1916 г. в Ярославской губернии И. П. Жаворонковой. Информация об этих сборах ранее не была опубликована. В результате ревизии выявлено 42 вида и 3 разновидности, относящихся к 21 роду миксомицетов, из которых 32 вида и 3 разновидности являются новыми для Ярославской области, а Enteridium simulans впервые отмечен для России. Дополнительно проведенный анализ литературных источников позволил расширить этот список до 46 видов из 22 родов. Представленная работа является первым шагом для дальнейшего изучения миксомицетов этой части России.
Скачивания
Metrics
Литература
Берестецкая Л. И., Дмитриев А. П., Левитин М. М. Микологический гербарий всероссийского института защиты растений // Вестник защиты растений, 2012. Т. 3. С. 58–61.
Borg Dahl M., Brejnrod A. D., Unterseher M., Hoppe T., Feng Y., Novozhilov Y., Sørensen S. J., Schnittler M. 2018. Genetic barcoding of dark-spored myxomycetes (Amoebozoa) – Identification, evaluation and application of a sequence similarity threshold for species differentiation in NGS studies. Mol. Ecol. Resour. 18(2): 306–318. https://doi.org/10.1111/1755-0998.12725
Bortnikov F. M., Matveev A. V., Gmoshinskiy V. I., Novozhilov Yu. K., Zemlyanskaya I. V., Vlasenko A. V., Schnittler M., Shchepin O. N., Fedorova N. A. 2020. Myxomycetes of Russia: a history of research and a checklist of species. Karstenia 58, 2: 316–373. https://doi.org/10.29203/ka.2020.502
Bradshaw M., Tobin P. C. 2020. Sequencing herbarium specimens of a common detrimental plant disease (powdery mildew). Phytopathology 110(7): 1248–1254. https://doi.org/10.1094/PHYTO-04-20-0139-PER
Chapman A. D. 2005. Uses of primary species‐occurrence data, version 1.0. Report for the Global Biodiversity Information Facility. Copenhagen: Global Biodiversity Information Facility. 106 pp.
de Vere N., Rich T. C., Trinder S. A., Long C. 2015. DNA barcoding for plants. Methods Mol. Biol. 1245: 101 118. https://doi.org/10.1007/978-1-4939-1966-6_8
dela Cruz T. E. E., Kuhn R. V., Javier A. O. M., Parra C. M., Quimio T. H. 2009. Status of the Myxomycete Collection at the UPLB-Museum of Natural History (UPLB-MNH) Mycological Herbarium. Philipp. J. Syst. Biol. 3, 1: 97–111. https://doi.org/10.3860/pjsb.v3i1.1015
Елина О. Ю. Дамы на полях: образование и карьера первых женщин-агрономов, конец XIX – начало XX вв. // Историко-биологические Исследования, 2018. Т. 10, № 2. C. 67–99. https://doi.org/10.24411/2076-8176-2018-11957
Fiore-Donno A. M., Kamono A., Chao E. E., Fukui M., Cavalier-Smith T. 2010. Invalidation of Hyperamoeba by transferring its species to other genera of Myxogastria. J. Eukaryot. Microbiol. 57(2): 189–196. https://doi.org/10.1111/j.1550-7408.2009.00466.x
Gmoshinskiy V. I., Matveev A. V., Gubanov E. S., Bortnikov F. M., Dunayev E. A. 2020. Critical revision of the Myxomycetes collection of Young Naturalists Club of Zoological Museum of Moscow State University. Botanica Pacifica 9(2): 175–190. https://doi.org/10.17581/bp.2020.09211
Ing B. 1999. The myxomycetes of Britain and Ireland. London: The Richmond Publishing Co. Ltd. 374 pp.
James S. A., Soltis P. S., Belbin L., Chapman A. D., Nelson G., Paul D. L., Collins M. 2018. Herbarium data: Global biodiversity and societal botanical needs for novel research. Appl. Plant Sci. 6, 2: e1024. https://doi.org/10.1002/aps3.1024
Javoronkowa J. [I. P.] 1914. Note préliminare concernant des observations sur la germination des spores de Didymium difforme Duby. Bulletin de la Société Mycologique de France 30: 402–405.
Жаворонкова И. П. Новый паразитъ въ спорахъ миксомицетовъ: Ramularia myxophaga n. sp. // Журналъ микробіологiи, 1915. Т. 2, № 1–2. С. 1–18.
Жаворонкова И. П. Практикум по бактериозам растений. М.: Сельхозгиз, 1931. 64 c.
Хохряков М. К., Потлайчук В. И. Микологический гербарий Всесоюзного научно-исследовательского института защиты растений // Труды всесоюзного научно-исследовательского института защиты растений, 1972. Вып. 33. С. 68–74.
Комплексная биоэкологическая оценка состояния памятника природы «Дубрава деревень Чашницы, Ям»: отчет о научно-исследовательской работе. Отв. ред. О. А. Маракаев. Ярославль: ЯрГУ, 2016. 151 с.
Комплексная биоэкологическая оценка состояния леса в местечке «Касарка» на территории Национального парка «Плещеево озеро»: отчет о научно-исследовательской работе. Отв. ред. О. А. Маракаев. Ярославль: ЯрГУ, 2017. 132 с.
Комплексная биоэкологическая оценка состояния северного побережья озера Плещеево: отчет о научно-исследовательской работе. Отв. ред. О. А. Маракаев. Ярославль: ЯрГУ, 2020. 226 с.
Кондакова Г. В. Аннотированный список грибов. Ярославль: Ярославский государственный университет им. П. Г. Демидова, 2024. URL: https://www.uniyar.ac.ru/faculties/biological/divisions/statsionarnaya-biologicheskaya-stantsiya/bioraznoobrazie/grib.php [дата обращения: 25.03.2024].
Leontyev D., Ishchenko Y., Schnittler M. 2023. Fifteen new species from the myxomycete genus Lycogala. Mycologia 115(4): 524–560. https://doi.org/10.1080/00275514.2023.2199109
Leontyev D. W., Schnittler M., Stephenson S. L., Novozhilov Yu. K. 2019. Systematic revision of the Tubifera casparyi – T. dictyoderma complex: Resurrection of the genus Siphoptychium and introduction of the new genus Thecotubifera. Mycologia 111(6): 981–997. https://doi.org/10.1080/00275514.2019.1660842
Липшиц С. Ю. Русские ботаники. Биографическо-библиографический словарь. Т. 3. М.: Изд-во Московского общества испытателей природы, 1950. 488 с.
Martin G. W., Alexopoulos C. J. 1969. The Myxomycetes. Iowa City: Iowa University Press. 560 pp.
Moreno G., Oltra M. 2010. Notas sobre los géneros Badhamia, Badhamiopsis y Craterium (Myxomycetes) en España. Bol. Soc. Micol. Madrid 34: 161–197.
Moreno G., Castillo A. 2013. A comparative study of the types of three species of Myxomycetes: Trichia crateriformis, T. fallax var. olivacea and T. fernbankensis. Bol. Soc. Micol. Madrid 37: 85–98.
Nannenga-Bremekamp N. E. 1973. Notes on Myxomycetes XIX. Proc. K. ned. Akad. Wet., Section, C 76: 476 488.
Poulain M., Meyer M., Bozonnet J. 2011. Les Myxomycétes. Tome 1, Guide de determination. Sévrier: Mycologique et botanique DauphinéSavoie. 568 pp.
Ronikier A., Janik P., de Haan M., Kuhnt A., Zankowicz M. 2022. Importance of type specimen study for understanding genus boundaries-taxonomic clarifications in Lepidoderma based on integrative taxonomy approach leading to resurrection of the old genus Polyschismium. Mycologia 114(6): 1008–1031. https://doi.org/10.1080/00275514.2022.2109914
Willis C. G., Ellwood E. R., Primack R. B., Davis C. C., Pearson K. D., Gallinat A. S., Yost J. M., Nelson G., Mazer S.J., Rossington N. L., Sparks T. H., Soltis P. S. 2017. Old plants, new tricks: phenological research using herbarium specimens. Trends Ecol. Evol. 32(7): 531–546. https://doi.org/10.1016/j.tree.2017.03.015
Ячевский А. А. Микологическая флора Европейской и Азиатской России. Слизевики. М.: Типо-Литография В. Рихтера. 1907. 410 с.
Уведомление об авторских правах
Turczaninowiа является "золотым издателем", так как мы позволяем самоархивирование, но самое главное, мы полностью прозрачны в своих правах.
Авторы могут представить и обсудить свои выводы перед публикацией: в биологических или научных конференций, на допечатной серверах, в общедоступных базах данных, а также в блогах, вики, твиттерах и другие неформальных каналах связи.
Turczaninowiа позволяет авторам внести рукописи (находящуюся в настоящее время на рассмотрении или тех, которые предполагается предоставить в Turczaninowia) для архивирования в некоммерческих, допечатных серверах, таких как ArXiv.
Авторы, публикующиеся в этом журнале согласны со следующими условиями: авторы сохраняют свои авторские права и предоставляют журналу право первой публикации в связи с работой, которая одновременно распространяется по лицензии Creative Commons Attribution и позволяют другим иметь доступ к работе с признанием авторства этой работы и первоначальной публикацией в этом журнале. Авторы могут заключать отдельные, дополнительные договорные соглашения по неисключительному распространению опубликованной версии (например, разместить ее в институтском репозитории или опубликовать в книге), с признанием ее первоначальной публикации в этом журнале.
Авторам разрешается и рекомендуется размещать их работу в Интернете (например, в институциональных хранилищах или на их сайте) до и во время процесса подачи, так как это может привести к продуктивным обменам, а также увеличению цитирования опубликованных работ (см. Политика открытого доступа)
Политика открытого доступа.
Заявление о конфиденциальности
Имена и адреса электронной почты, поданные при публикации в этом журнале, сайт будет использоваться исключительно для заявленных целей данного журнала, и они не будут доступны для любых других целей или какой-либо другой стороне.
Наша публикационная этика журнала основана, в значительной степени, на руководящих принципах и стандартах, разработанных Комитетом по этике публикации (COPE). Соответствующие обязанности и права авторов, рецензентов и редакторов журнала изложены ниже.
ОБЯЗАННОСТИ АВТОРОВ
Отправляя рукопись "Turczaninowia", автор (ы) гарантирует, что они отправляют рукопись как свою собственную, оригинальную работу, и что она не имеет ни были опубликованы ранее, и в настоящее время не рассматривается для публикации в других изданиях. Они также гарантируют, что источники каких-либо идей и / или слов в рукописи, которые не являются их собственными, были должным образом приписаны с помощью соответствующего цитирования.
Автор обычно не должен издавать рукописи, описывающие по существу те же исследования, в нескольких журналах или прочих публикациях. Такая избыточная публикация обычно считается неэтичным поведением, и в случае обнаружения, может привести к отклонению рассматриваемой рукописи рассматриваемого отвергаются, или опубликованная статья будет изъята.
Авторы рукописей, освещающих оригинальные исследования должны представить точный отчет о выполненной работе, в сопровождении объективного обсуждения его значения. Основополагающие данные должны быть представлены точно и полно в рукописи. Рукопись должна содержать достаточно подробные данные и ссылки, чтобы позволять другим дублировать работу. Подтасовка результатов и изготовление поддельных или заведомо неточных утверждений является неэтичным поведением и может быть причиной для отклонения или изъятия рукописи или опубликованной статьи.
Там, где в статьях есть отчеты о использовании коммерческого программного обеспечения, аппаратных средств или других продуктов, авторы должны подать декларацию в начале рукописи, в которой они должны заявить, что никакого конфликта интересов не существует или описать характер любого потенциального конфликта. Все источники финансовой поддержки для исследования также должны быть раскрыты в рукописи.
Автор (ы) рукописи соглашаются, что, если рукопись принята к публикации в "Turczaninowia", опубликованная статья будет характьеризоваться авторскими правами с использованием "Attribution-Unported" лицензии Creative Commons. Эта лицензия позволяет автору (ам) сохранить авторские права, но и позволяет другим свободно копировать, распространять и отображать произведение и производные работы, основанные на ней, при определенных заданных условиях.
Имена авторов должны быть перечислены на статье в порядке их вклада в статью, и все авторы берут на себя ответственность за свои собственные результаты. Только те люди, которые внесли существенный вклад, должны быть перечислены в качестве авторов; те, чьи вклады являются косвенными или маргинальными (например, коллег или руководителей, которые рассмотрели проекты работы или оказывали помощь в корректуре, и руководители научно-исследовательских институтов / центров / лабораторий) должны быть названы в разделе «Выражение признательности» в конце статьи, непосредственно предшествующему Списку литературы.
Автор, подающий статью, должен обеспечить, чтобы все соавторы былм включены в статью, и что все соавторы видели и одобрили окончательный вариант статьи и согласились на его публикацию.
Там, где автор обнаруживает существенную ошибку или неточность в статье, которая была уже опубликована в "Turczaninowia", он / она обязана незамедлительно уведомить редакцию и сотрудничать с ними, чтобы исправить статью или отозвать ее в случае необходимости.
ОБЯЗАННОСТИ РЕЦЕНЗЕНТОВ
В журнале "Turczaninowia" рецензенты выполняют работу для журнала на добровольной основе. Учитывая, что большинство из этих людей находятся в полной занятости, их рецензирование для "Turczaninowia" должна выолняться по мере необходимости, а не быть их главным приоритетом. Рецензенты могут свободно отклонять приглашения для рассмотрения конкретных рукописей по своему усмотрению, например, если их текущая нагрузка, занятость и / или другие обязательства могут сделать ее непомерно высокой для того, чтобы завершить обзор своевременно и уделить должное время рецензированию. Они также не должны принимать рукописи на рецензию, в тематике которых они не чувствуют себя подходящим специалистом.
Рецензенты, которые приняли рукописи, как правило, должны предоставить свои рецензии в течение трех недель. Они должны отказаться от рецензии, если становится очевидным для них на любой стадии, что они не обладают необходимыми знаниями для выполнения рецензии, или что они могут иметь потенциальный конфликт интересов при проведении рецензии (например, в результате конкурентных исследований, совместных или других отношений или связей с кем-либо из авторов, учреждений или компаний, связанных с рукописью).
Информация или идеи, полученные рецензентами в процессе рецензирования должны храниться в тайне и не используются для личной выгоды. Любые рукописи, полученные для рассмотрения, должны рассматриваться как конфиденциальные документы, и не должны быть показаны или обсуждены с другими, если только это не санкционировано редакторами "Turczaninowia".
При проведении своих рецензий, рецензентам необходимо сделать это как можно более объективно, воздерживаться от участия в личной критики автора (ов). Им предлагается высказать свое мнение четко, объясняя и оправдывая все рекомендации. Они всегда должны пытаться представить подробную и конструктивную обратную связь, чтобы помочь автору (ам) в повышении эффективности их работы, даже если рукопись, по их мнению, не подлежит опубликованию.
Рецензенты должны определить в своих рецензиях соответствующие опубликованные работы, которые не были названы автором (ами), вместе с любыми примерами, где не было сделано надлежащее цитирование источников. Они должны привлечь внимание ответственного редактора в отношении каких-либо серьезных сходств между рукописью, поданной на рассмотрение и других опубликованных статей, или статей, о которых им известно, а также предотвратить любые проблемы, которые могут иметь место по отношению к этической приемлемости исследований, представленных в рукописи.
ОБЯЗАННОСТИ РЕДАКЦИИ
Редактор журнала "Turczaninowia" несет полную ответственность за решение о публикации рукописи, которая представляется в "Turczaninowia", и при этом руководствуется политикой журнала, и в соответствии с определенными редакцией "Turczaninowia" юридическими требованиями в отношении клеветы, нарушения авторских прав и плагиата. Редактор может проконсультироваться с заместителями Редактора и другими членами редакционной коллегии, а также с рецензентами, для принятии решений о публикации.
Редакция будет оценивать рукописи с точки зрения ее интеллектуального содержания без учета расы, цвета кожи, пола, сексуальной ориентации, религиозных убеждений, этнического происхождения, гражданства или политической философии автора (ов). Они не будут никому разглашать какую-либо информацию о рукописи, кроме автора (ов), рецензентов и потенциальных рецензентов, а в некоторых случаях членов редакционной коллегии "Turczaninowia" и членов команды управления журналом, в зависимости от обстоятельств. Кроме того, редакция будет прилагать все усилия, чтобы обеспечить целостность процесса слепого рецензирования, не раскрывая личности автора (ов) рукописи для рецензентам этой рукописи, и наоборот.
При оценке рукописи для публикации, в дополнение к рассмотрению стандартных критериев, относящихся к строгости рукописи, качеству ее предоставления, а также ее вклад в область научных знаний, редакторы также будут руководствоваться тем, насколько этические нормы были соблюдены, и вред был сведен к минимуму при проведении исследования. Они также оценивают насколько полученные научные и практические выгоды перевешивают вред в случае конкретного исследования.
Так как "Turczaninowia" приветствует предоставление рукописей из любой страны, необходимо признать, что законы и нормативные акты, касающиеся этики научных исследований и этического утверждения, различаются во всем мире. Таким образом, редакторам, возможно, придется обратиться за разъяснениями в связи с этим к автору (ам) с просьбой о том, чтобы они представили письмо от соответствующего институционального комитета по этике или совета, который одобрил исследование.
Редакция будет руководствоваться Руководством CORE для изъятия статей при рассмотрении любых спорных вопросов, которые были опубликованы в AASRJ. Редакторы готовы работать в тесном сотрудничестве с научно-исследовательскими организациями и учреждениями в соответствии с рекомендациями CORE о сотрудничестве между научно-исследовательскими институтами и журналами в области публикационной этики и этики проведения исследований.
"Turczaninowia" является журналом открытого доступа, что означает, что все его содержимое свободно и доступно бесплатно для пользователя или его / ее учреждения. Пользователи могут читать, загружать, копировать, распространять, печатать, выполнять поиск, делать ссылки на полные тексты статей в этом журнале, не спрашивая предварительного разрешения от издателя или автора. Это легитимно в соответствии с определением BOAI об открытом доступе.
Наш сайт демонстрирует знак Creative Commons, и это исключительное право автора, если он / она хочет, чтобы его / ее статьи были в свободном доступе или нет. Но мы должны опубликовать Резюме и метаданные статьи в полном доступе в любом случае.
