О секционной принадлежности видов Corydalis gorinensis, Corydalis gorodkovii и Corydalis magadanica, произрастающих на Дальнем Востоке

УДК 581.95(571.54)

  • Ксения Константиновна Рябова Сибирский федеральный университет https://orcid.org/0009-0008-0896-4249 Email: ryabova.kseniya.k@mail.ru
  • Ирина Евгеньевна Ямских Сибирский федеральный университет https://orcid.org/0000-0003-1424-9547 Email: iyamskikh@mail.ru
  • Мария Геннадьевна Хорева Институт биологических проблем Севера ДВО РАН https://orcid.org/0000-0003-2290-3043 Email: mkhoreva@ibpn.ru
  • Ирина Павловна Щеглова Федеральное государственное бюджетное учреждение «Заповедное Приамурье» Комсомольский филиал https://orcid.org/0009-0009-4727-0319 Email: sh.mishka@mail.ru
  • Ольга Александровна Мочалова Институт биологических проблем Севера ДВО РАН https://orcid.org/0000-0002-1325-112X Email: mochalova@inbox.ru
  • Максим Геннадьевич Куцев Алтайский государственный университет https://orcid.org/0000-0003-2284-6851 Email: m_kucev@mail.ru
Ключевые слова: генетический анализ, филогения, Corydalis arctica, Corydalis gorinensis, Corydalis gorodkovii, Corydalis magadanica, ISSR-PCR-анализ, matK, rbcL, rpoB-trnC, trnL-trnF

Аннотация

Статья посвящена определению секционной принадлежности клубневых хохлаток – Corydalis magadanica, C. gorinensis, C. gorodkovii, произрастающих на Дальнем Востоке, с использованием ISSR-PCR и хлоропластных маркеров. Corydalis является одним из наиболее крупных родов растений. У ученых нет единого мнения о секционной принадлежности некоторых видов хохлаток, что обусловлено высокой изменчивостью их вегетативных и генеративных признаков. Исследований родства на основе анализа генетических маркеров для данных видов ранее не проводилось. С помощью ISSR-анализа установлено, что уровень генетического разнообразия в популяциях дальневосточных хохлаток и сибирского вида C. bracteata варьирует от 36,94 до 57,66 % и имеет минимальные показатели у произрастающей обособленно популяции редкого вида C. gorinensis. Изученные популяции характеризуются высоким уровнем генетической дифференциации (Gst = 0,5462) и достоверно относятся к разным видам. На UPGMA-дендрограмме особи данных видов формируют четко обособленные группы. Генетическое сходство наблюдается между C. magadanica и C. gorinensis. Анализ последовательностей с использованием хлоропластных молекулярных маркеров matK, rbcL, а также межгенного спейсера trnL-trnF не показал различий между C. gorinensis, C. gorodkovii и C. magadanica, что свидетельствует об их близком родстве. Маркер rpoB-trnC оказался более информативным и выявил у C. gorinensis точечную мутацию и 6-нуклеотидную делецию. Топология филогенетических деревьев была идентичной для отдельных маркеров. Изучаемые нами дальневосточные виды входят в секцию Corydalis, наиболее тесно объединяясь с европейскими видами: Corydalis intermedia, Corydalis solida и сибирским C. bracteata. Морфологическая характеристика дальневосточных видов также соответствует описанию видов секции Corydalis, приведенному во «Флоре Китая». Изучение последовательностей ДНК указало на принадлежность впервые секвенированного вида Corydalis arctica к секции Dactylotuber.

Скачивания

Данные скачивания пока недоступны.

Metrics

Загрузка метрик ...

Литература

Безделева Т. А., Качура Н. Н. Род Corydalis Vent. на советском Дальнем Востоке // Комаровские чтения, 1988. Т. 35. С. 123–146.
Chen J. T., Liden M., Huang X. H., Zhang L., Zhang X. J., Kuang T. H., Sun H. 2023. An updated classification for the hyper‐diverse genus Corydalis (Papaveraceae: Fumarioideae) based on phylogenomic and morphological evidence. Journal of Integrative Plant Biology 65(9): 2138–2156. DOI: 10.1111/jipb.13499
Конспект флоры Азиатской России: Сосудистые растения.Под ред. К. С. Байкова. Новосибирск: Изд-во СО РАН, 2012. 640 с.
Fay M. F., Swensen S. M., Chase M. W. 1997. Taxonomic affinities of Medusagyne oppositifolia (Medusagynaceae). Kew Bull. 52: 111–120.
Edgar R. C. 2004. MUSCLE: multiple sequence alignment with high accuracy and high throughput. Nucleic Acids Res. 32(5): 1792–1797. DOI: 10.1093/nar/gkh340
Kim K.-J. 2010. Broad‐scale amplification of matK for DNA barcoding plants, a technical note. Bot. J. Linn. Soc. 164:1–9. DOI: 10.1111/j.1095-8339.2010.01071.x
Kumar S., Stecher G., Li M., Knyaz C., Tamura K. 2018. MEGA X: Molecular Evolutionary Genetics Analysis across computing platforms. Mol. Biol. Evol. 35: 1547–1549. DOI: 10.1093/molbev/msy096
Miikeda O., Kita K., Handa T., Yukawa T. 2006. Phylogenetic relationships of Clematis (Ranunculaceae) based on chloroplast and nuclear DNA sequences. Bot. J. Linn. Soc. 152: 153–168. DOI: 10.1111/j.1095-8339.2006.00551.x
Михайлова М. А. 2018. Род Corydalis (Fumariaceae) в Якутии // Новости сист. высш. раст., 2018. Т. 49. С. 56–70. DOI: 10.31111/novitates/2018.49.56
Nei M. 1972. Genetic distance between populations. The American Naturalist 106: 283–292. DOI: 10.1086/282771
Olmstead R. G., Michaels H. J., Scotts K. M., Palmer J. D. 1992. Monophyly of the Asteridae and identification of their major lineages inferred from DNA sequences of rbcL. Ann. Missouri Bot. Gard. 79: 249–265.
Рябова К. К., Ямских И. Е., Степанов Н. В. 2021. Полиморфизм популяций Corydalis subjenisseensis s. l. (Papaveraceae) на юге Приенисейской Сибири // Проблемы ботаники Южной Сибири и Монголии, 2021. Т. 20, № 1. С. 393–396. DOI: 10.14258/pbssm.2021078
Щеглова И. П. Новые сведения о распространении и экологии Corydalis gorinensis (Fumariaceae) // Известия Иркутского государственного университета. Серия Биология. Экология, 2023. Т. 45. С. 70–74. DOI: 10.26516/2073-3372.2023.45.70
Taberlet P., Gielly L., Pautou G., Bouvet J. 1991. Universal primers for amplification of three non-coding regions of chloroplast DNA. Plant Mol. Biol. 17: 1105–1109. DOI: 10.1007/BF00037152
Ван В. М. Новый вид рода Corydalis (Papaveraceae) из Хабаровского края // Бот. журн., 1984. Т. 69, № 4. С. 544–547.
Ван В. М., Антонова Л. А. Хохлатка горинская – Corydalis gorinensis Van. // Красная книга Хабаровского края. Редкие и находящиеся под угрозой исчезновения виды растений, грибов и животных; под ред. Б. А. Воронов. Воронеж: «МИР», 2019. C. 96.
WFO [2023]. World Flora Online. URL: http://www.worldfloraonline.org/ (Accessed 1 March 2023).
Yeh F., Yang R., Boyle T. 1999. POPGENE version 1.32. Microsoft Window-based freeware for population genetic analysis. University of Alberta; Canada: Molecular Biology and Biotechnology Center. 29 pp.
Ермошкин А. В. Флористические находки сосудистых растений в бассейне Нижнего Амура // Бот. журн., 2004. Т. 89, № 6. С. 1020–1022.
Zhang M., Su Z., Lidén M. 2008. Corydalis DC. In: Z.-Y. Wu, P. H. Raven, D.-Y. Hong (eds.). Flora of China. Vol. 7. Beijing: Science Press; St. Louis: Missouri Botanical Garden Press. Pp. 295–428.
Опубликован
2024-11-10
Как цитировать
Рябова К. К., Ямских И. Е., Хорева М. Г., Щеглова И. П., Мочалова О. А., Куцев М. Г. О секционной принадлежности видов Corydalis gorinensis, Corydalis gorodkovii и Corydalis magadanica, произрастающих на Дальнем Востоке // Turczaninowia, 2024. Т. 27, № 3. С. 15-24 DOI: 10.14258/turczaninowia.27.3.2. URL: http://turczaninowia.asu.ru/article/view/16083.
Раздел
Научные статьи

Наиболее читаемые статьи этого автора (авторов)

<< < 1 2