Phylogeographic analysis of Pinus sylvestris in forest-steppe and steppe zones of the Orenburg Region
Keywords:
equilibrium populations, genetic reserve, ISSR-analysis, ITS2, polymorphic locus
Abstract
The formation of the Pinus sylvestris L. area at the junction of the European, Siberian and Turan floristic regions on the southern edge of the Ural mountain country was studied based on the ISSR-analysis. The study revealed that the Pinus sylvestris in the area is characterized by a high level of genetic diversity. The ISSR-analysis showed that the populations growing in geographically close habitats had the greatest genetic similarity. Based on the analysis of the main components, the sample of relict pines is divided into 2 groups: European and Asian, but one of the populations occupies an intermediate position between the two groups.
Downloads
Download data is not yet available.
Metrics
Metrics Loading ...
References
Чибилев А. А., Чибилев Ант. А. Природное районирование Урала с учетом широтной зональности, высотной поясности и вертикальной дифференциации ландшафтов // Известия Самарского научного центра РАН, 2012. Т. 14, вып. 1. С. 1660–1665.
Чибилев А. А. Физико-географическое районирование Южного Урала как основа для формирования экологического каркаса региона // Степи Северной Евразии: материалы VII междунар. симпозиума. Оренбург, 2015. С. 916–919.
Farjon A. 2001. Conifers. Royal Botanic Gardens Kew, London, 309 pp.
Ganopoulos J., Tsaballa A., Xanthopoulou A., Madesis P., Tsaftaris A. 2013. Cultivar Identification by High-Resolution-Melting (HRM) Analysis Using Gene-Based SNP Markers. Plant. Mol. Biol. Report. 31(3): 763–768. DOI: 10.1007/s11105-012-0538
Крутовский К. В. От популяционной генетике к популяционной геномике лесных древесных видов: интегрированный популяционно-геномный подход // Генетика, 2006. Т. 42(10). С. 1304–1318.
Kumar S., Stecher G., Tamura K. 2016. MEGA 7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 7.0 for bigger datasets. Mol. Biol. Evol. 33: 1870–1874. DOI: 10.1093/molbev/msw054
Kuzmina M. L., Braukmann T. W. A., Fazekas A. J., Catling P. M., Newmaster S. G., Percy D. M., Fenneman E., Lauron‐Moreau A., Ford B., Gillespie L., Subramanyam R., Whitton J., Jennings L., Metsger D., Warne C. P., Brown A., Sears E., Dewaard J. R., Zakharov E. V., Hebert P. D. N. 2017. Using herbarium-derived DNAs to assemble a large-scale DNA barcode library for the vascular plants of Canada. Appl. Plant. Sci. 5(12). (22 December 2017). DOI: 10.3732/apps.1700079
Милютин Л. И. Кузьмин С. Р., Кузьмина Н. А., Новикова Т. Н. О внутривидовой систематике Pinus sylvestris (Pinaceae) // Бот. журн., 2010. Т. 95, № 12. С. 1755–1762.
Милютин Л. И. Особенности краевых популяций древесных растений // Экология популяций: Сборник науч. ст. М.: Наука, 1991. С. 86–97.
Павлов Д. С., Стриганова Б. Р., Букварева Е. Н., Дгебуадзе Ю. Ю. Сохранение биологического разнообразия как условие устойчивого развития. М.: ООО «Типография ЛЕВКО», Институт устойчивого развития, 2009. 84 с.
Седельникова Т. С., Пименов А. Б. Анализ цитогенетических характеристик болотных и суходольных популяций видов Pinaceae // Факторы экспериментальной эволюции организмов: сборник научных трудов. Т. 8. Киев, 2010. С. 126–131.
Rogers S. O., Zhao L. MA Y., Catranis C. M., Starmer W. T., Castello J. D. 2005. Recommendations for elimination of contaminants and authentication of isolates from ancient ice cores. Princeton University Press, New Jersey, 5–21 pp.
Rogers By S. O., Kaya Z. 2006. DNA From Ancient Cedar Wood From King Midas’ Tomb, Turkey, and Al-Aksa Mosque, Israel. Silvae Genetica 55(2): 54–62. DOI: 10.1515/sg-2006-0009
Рябинина З. Н. Конспект флоры Оренбургской области. Екатеринбург: Ин-т степи УрО РАН, 1998. 163 c.
Рябинина З. Н., Князев М. С. Определитель сосудистых растений Оренбургской области. М.: Товарищество научных изданий КМК, 2009. 758 с.
Санников С. Н., Петрова И. В. Дифференциация популяций сосны обыкновенной. Екатеринбург: УрО РАН, 2003. 247 с.
Steinke D., De Vere N., Rich T. C. G., Ford C. R., Trinder S. A., Long Ch., Moore C. W., Satterthwaite D., Davies H., Allainguillaume J., Ronca S., Tatarinova T., Garbett H., Walker K., Wilkinson M. J. 2012. DNA Barcoding the Native Flowering Plants and Conifers of Wales. Plos One 7(6). DOI: 10.1371/journal.pone.0037945
Wachowiak W., Balk P. A., Savolainen O. 2009. Search for nucleotide diversity patterns of local adaptation in dehydrins and other cold-related candidate genes in Scots pine (Pinus sylvestris L.). Tree Genetics & Genomes 5(1): 117–132. DOI: 10.1007/s11295-008-0188-3
Чибилев А. А. Физико-географическое районирование Южного Урала как основа для формирования экологического каркаса региона // Степи Северной Евразии: материалы VII междунар. симпозиума. Оренбург, 2015. С. 916–919.
Farjon A. 2001. Conifers. Royal Botanic Gardens Kew, London, 309 pp.
Ganopoulos J., Tsaballa A., Xanthopoulou A., Madesis P., Tsaftaris A. 2013. Cultivar Identification by High-Resolution-Melting (HRM) Analysis Using Gene-Based SNP Markers. Plant. Mol. Biol. Report. 31(3): 763–768. DOI: 10.1007/s11105-012-0538
Крутовский К. В. От популяционной генетике к популяционной геномике лесных древесных видов: интегрированный популяционно-геномный подход // Генетика, 2006. Т. 42(10). С. 1304–1318.
Kumar S., Stecher G., Tamura K. 2016. MEGA 7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 7.0 for bigger datasets. Mol. Biol. Evol. 33: 1870–1874. DOI: 10.1093/molbev/msw054
Kuzmina M. L., Braukmann T. W. A., Fazekas A. J., Catling P. M., Newmaster S. G., Percy D. M., Fenneman E., Lauron‐Moreau A., Ford B., Gillespie L., Subramanyam R., Whitton J., Jennings L., Metsger D., Warne C. P., Brown A., Sears E., Dewaard J. R., Zakharov E. V., Hebert P. D. N. 2017. Using herbarium-derived DNAs to assemble a large-scale DNA barcode library for the vascular plants of Canada. Appl. Plant. Sci. 5(12). (22 December 2017). DOI: 10.3732/apps.1700079
Милютин Л. И. Кузьмин С. Р., Кузьмина Н. А., Новикова Т. Н. О внутривидовой систематике Pinus sylvestris (Pinaceae) // Бот. журн., 2010. Т. 95, № 12. С. 1755–1762.
Милютин Л. И. Особенности краевых популяций древесных растений // Экология популяций: Сборник науч. ст. М.: Наука, 1991. С. 86–97.
Павлов Д. С., Стриганова Б. Р., Букварева Е. Н., Дгебуадзе Ю. Ю. Сохранение биологического разнообразия как условие устойчивого развития. М.: ООО «Типография ЛЕВКО», Институт устойчивого развития, 2009. 84 с.
Седельникова Т. С., Пименов А. Б. Анализ цитогенетических характеристик болотных и суходольных популяций видов Pinaceae // Факторы экспериментальной эволюции организмов: сборник научных трудов. Т. 8. Киев, 2010. С. 126–131.
Rogers S. O., Zhao L. MA Y., Catranis C. M., Starmer W. T., Castello J. D. 2005. Recommendations for elimination of contaminants and authentication of isolates from ancient ice cores. Princeton University Press, New Jersey, 5–21 pp.
Rogers By S. O., Kaya Z. 2006. DNA From Ancient Cedar Wood From King Midas’ Tomb, Turkey, and Al-Aksa Mosque, Israel. Silvae Genetica 55(2): 54–62. DOI: 10.1515/sg-2006-0009
Рябинина З. Н. Конспект флоры Оренбургской области. Екатеринбург: Ин-т степи УрО РАН, 1998. 163 c.
Рябинина З. Н., Князев М. С. Определитель сосудистых растений Оренбургской области. М.: Товарищество научных изданий КМК, 2009. 758 с.
Санников С. Н., Петрова И. В. Дифференциация популяций сосны обыкновенной. Екатеринбург: УрО РАН, 2003. 247 с.
Steinke D., De Vere N., Rich T. C. G., Ford C. R., Trinder S. A., Long Ch., Moore C. W., Satterthwaite D., Davies H., Allainguillaume J., Ronca S., Tatarinova T., Garbett H., Walker K., Wilkinson M. J. 2012. DNA Barcoding the Native Flowering Plants and Conifers of Wales. Plos One 7(6). DOI: 10.1371/journal.pone.0037945
Wachowiak W., Balk P. A., Savolainen O. 2009. Search for nucleotide diversity patterns of local adaptation in dehydrins and other cold-related candidate genes in Scots pine (Pinus sylvestris L.). Tree Genetics & Genomes 5(1): 117–132. DOI: 10.1007/s11295-008-0188-3
Published
2019-06-17
How to Cite
Rjabuchina M. V., Kalyakina R. G., Friesen N. V. Phylogeographic analysis of Pinus sylvestris in forest-steppe and steppe zones of the Orenburg Region // Turczaninowia, 2019. Vol. 22, № 2. P. 110-120 DOI: 10.14258/turczaninowia.22.2.6. URL: http://turczaninowia.asu.ru/article/view/5786.
Section
Science articles
Turczaninowia is a golden publisher, as we allow self-archiving, but most importantly we are fully transparent about your rights.
Authors may present and discuss their findings ahead of publication: at biological or scientific conferences, on preprint servers, in public databases, and in blogs, wikis, tweets, and other informal communication channels.
Turczaninowia allows authors to deposit manuscripts (currently under review or those for intended submission to Turczaninowia) in non-commercial, pre-print servers such as ArXiv.
Authors who publish with this journal agree to the following terms:
- Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.
- Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.
- Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access).
