Системы подсемейств Cryptogrammoideae, Onychioideae и Taenitidoideae семейства Pteridaceae
УДК 582.394.72:581.961+581.4
Аннотация
Проведена таксономическая и филогенетическая ревизия родов Cryptogramma, Coniogramme, Llavea, Onychium, Actiniopteris, Syngramma, Austrogramme и Taenitis семейства Pteridaceae. Молекулярно-генетический, микроморфологический (споровый) и макроморфологический (структура вай, сорусов и пр.) анализ исследуемых представителей подтвердил самостоятельность нового подсемейства Onychioideae, а также монофилетичность подсемейств Cryptogrammoideae и Taenitidoideae. Указанные подсемейства сформировали отдельные клады по последовательностям гена rbcL c высоким уровнем поддержки. Описаны две секции – Crispa и Fumariifoliae в составе подрода Cryptogramma; новая серия Quinataeae в секции Syngramma рода Syngramma; в роде Onychium в секции Cryptogrammopsis описаны три новые серии: Japonicae, Moupinenses и Tibeticae и новая секция Contigua.
Скачивания
Metrics
Литература
Chen C. W., Chao Y. S., Mustapeng A. M. A., Lindsay S., Huang Y. M., Kessler M., Luu H. T., Hsieh C. M. 2022. Insights into the systematics of Old World taenitidoid ferns (Pteridoideae; Pteridaceae): evidence from phylogeny and micromorphology. Bot. J. Linn. Soc. 20: 1–29. https://doi.org/10.1093/botlinnean/boac008
Christensen C. 1905. Index Filicum. Copenhagen: Hagerup. 1128 pp. https://doi.org/10.5962/bhl.title.402
Cochran A., Prado J., Schuettpelz E. 2014. Tryonia, a new Taenitidoid fern genus segregated from Jamesonia and Eriosorus (Pteridaceae). Phyto Keys 35: 23–43. https://doi.org/10.3897/phytokeys.35.6886
Dou P., Yang W.-L., Zhao R.-R., Zhang G.-M. 2015. Phylogenetic analysis of Onychium based on five chloroplast DNA sequences. Bull. Bot. Res. 35: 665–671. https://doi.org/10.7525/j.issn.1673-5102.2015.05.005
Ebihara A., Nitta J., Ito M. 2010. Molecular Species Identification with Rich Floristic Sampling: DNA Barcoding the Pteridophyte Flora of Japan. PloS ONE 5: e15136. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0015136
Gastony G. J., Johnson W. P. 2001. Phylogenetic placements of Loxoscaphe thecifera (Aspleniaceae) and Actiniopteris radiata (Pteridaceae) based on analysis of rbcL. Amer. Fern J. 91: 197–213. https://doi.org/10.1640/0002-8444(2001)091[0197:PPOLTA]2.0.CO;2
Gastony G. J., Rollo D. R. 1995. Phylogeny and generic circumscriptions of Cheilanthoid ferns (Pteridaceae: Cheilanthoideae) inferred from rbcL nucleotide sequences. Amer. Fern J. 85, 4: 341. https://doi.org/10.2307/1547814
GBIF [2024]. Global Biodiversity Information Facility. URL: https://www.gbif.org/ (Accessed 10 January 2024).
Grusz A. L., Windham M. D., Picard K.T., Pryer K. M., Schuettpelz E., Haufler C. H. 2021. A drought‐driven model for the evolution of obligate apomixis in ferns: evidence from pellaeids (Pteridaceae). Amer. J. Bot. 108(2): 263–283. https://doi.org/10.1002/ajb2.1611
Hennipman E. 1975. A redefinition of the gymnogrammoid genus Austrogramme Fournier. Fern Gaz. 11(2–3): 61–72.
Hirohara M., Nakane T., Terayama Y., Kobayashi A., Arai Y., Masuda K., Hamashima H., Shiojima K., Ageta H. 2000. Chemotaxonomy of Ferns: Triterpenoids and rbcL gene Sequences of Polypodium, Polypodiodes and Goniophlebium. Nat. Med. 54: 330–333.
Holttum R. E. 1975. A comparative account of the fern-genera Syngramma J. Sm. and Taenitis Willd., with discussion of their relationships to each other and to other genera. Kew Bull. 30(2): 327–343.
Huiet L., Li F.-W., Kao T.-T., Prado J., Smith A., Schuettpelz E., Pryer K. 2018. A worldwide phylogeny of Adiantum (Pteridaceae) reveals remarkable convergent evolution in leaf blade architecture. Taxon 67: 488–502. https://doi.org/10.12705/673.3
Korall P., Pryer K. M., Metzgar J. S., Schneider H., Conant D. S. 2006. Tree ferns: monophyletic groups and their relationships as revealed by four protein-coding plastid loci. Molec. Phylogen. Evol. 39, 3: 830–845. https://doi.org/10.1016/j.ympev.2006.01.001
Kumar S., Stecher G., Li M., Knyaz C., Tamura K. 2018. MEGA X: Molecular Evolutionary Genetics Analysis across computing platforms. Molec. Phylogen. Evol. 35: 1547–1549. https://doi.org/10.1093/molbev/msy096
Kummerle J. B. 1930. Has the genus Onychium any representative in South America. Amer. Fern J. 20(4): 129–138. https://doi.org/10.2307/1544758
Larkin M. A., Blackshields G., Brown N. P., Chenna R., McGettigan P. A., McWilliam H., Valentin F., Wallace I. M., Wilm A., Lopez R., Thompson J. D., Gibson T. J., Higgins D. G. 2007. Clustal W and Clustal X version 2.0. Bioinformatics 23: 2947–2948. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btm404
Li F.-W., Pryer K., Windham M. 2012. Gaga, a new Fern genus segregated from Cheilanthes (Pteridaceae). Syst. Bot. 37: 845–860. https://doi.org/10.1600/036364412X656626
Metzgar J. S., Alverson E. R., Chen S., Vaganov A. V., Ickert-Bond S. M. 2013. Diversification and reticulation in the circumboreal fern genus Cryptogramma. Molec. Phylogen. Evol. 67(3): 589–599. https://doi.org/10.1016/j.ympev.2013.02.020
Metzgar J., Stamey M., Ickert-Bond S. 2016. Genetic differentiation and polyploid formation within the Cryptogramma crispa complex (Polypodiales: Pteridaceae). Turk. J. Bot.: 10. https://doi.org/10.3906/bot-1501-54
Nakazato T., Gastony G. 2003. Molecular Phylogenetics of Anogramma Species and Related Genera (Pteridaceae: Taenitidoideae). Syst. Bot. 28. https://doi.org/10.1043/02-40.1
Pichi-Sermolli R. E. G. 1962. On the Fern Genus «Actiniopteris» Link. Webbia 17, 1: 1–32. https://doi.org/10.1080/00837792.1962.10669735
Pinson J., Schuettpelz E. 2016. Unraveling the origin of the Appalachian gametophyte, Vittaria appalachiana. Amer. J. Bot. 103: 668–676. https://doi.org/10.3732/ajb.1500522
PPG I. 2016. A community-derived classification for extant lycophytes and ferns. J. Syst. Evol. 54: 563–603. https://doi.org/10.1111/jse.12229
Prado J., Rodrigues C. D. N., Salatino A., Salatino M. L. F. 2007. Phylogenetic relationships among Pteridaceae, including Brazilian species, inferred from rbcL sequences. Taxon 56: 355–368. https://doi.org/10.1002/tax.562008
Presl K. B. 1836. Tentamen Pteridographiae, seu genera filicacearum praesertim juxta venarum decursum et distributionem exposita. Pragae: Typis Filiorum Theophili Haase. 290 pp. https://dx.doi.org/10.5962/bhl.title.47011
Sanchez-Baracaldo P. 2004. Phylogenetic Relationships of the Subfamily Taenitidoideae, Pteridaceae. Amer. Fern J. 94(3): 126–142. https://doi.org/10.1640/0002-8444(2004)094[0126:PROTST]2.0.CO;2
Schneider H., He L., Hennequin S., Zhang X.-Ch. 2013. Towards a natural classification of Pteridaceae: inferring the relationships of enigmatic pteridoid fern species occurring in the Sino-Himalaya and Afro-Madagascar. Phytotaxa 77(4): 49–60. https://doi.org/10.11646/phytotaxa.77.4.1
Schuettpelz E., Chen Ch.-W., Kessler M., Pinson J. B., Johnson G., Davila A., Cochran A. T., Huiet L., Pryer K. M. 2016. A revised generic classification of vittarioid ferns (Pteridaceae) sased on molecular, micromorphological, and geographic data. Taxon 65(4): 708–722. https://doi.org/10.12705/654.2
Schuettpelz E., Schneider H., Huiet L., Windham M. D., Pryer K. M. 2007. A molecular phylogeny of the fern family Pteridaceae: аssessing overall relationships and the affinities of previously unsampled genera. Molec. Phylogen. Evol. 44: 1172–1185. https://doi.org/10.1016/j.ympev.2007.04.011
Smith J. 1875. Historia filicum. London: Macmillan. 429 pp. https://doi.org/10.5962/bhl.title.54787
Shing K. H. 1981. New taxa of the genus Coniogramme Fée from China». Acta Bot. Yunnan. 3: 217–238.
Vaganov A. V., Gureyeva I. I., Shmakov A. I., Kuznetsov A. A., Romanets R. S. 2018. Spore morphology of Taenitis, Syngramma and Austrogramme species (Pteridoideae, Pteridaceae) from South-Eastern Asia. Turczaninowia 21, 3: 5–11. https://doi.org/10.14258/turczaninowia.21.3.1
Vaganov A. V., Gureyeva I. I., Shmakov A. I., Kuznetsov A. A., Romanets R. S. 2021. Spore morphology of Taenitis, Syngramma, and Austrogramme species (Pteridoideae, Pteridaceae) from South-Eastern Asia and Oceania. II. Turczaninowia 24, 3: 36–51. https://doi.org/10.14258/turczaninowia.24.3.3
Vaganov A. V., Gureyeva I. I., Skaptsov M. V., Kuznetsov A. A., Romanets R. S., Salokhin A. V., Kutsev M. G., Shmakov A. I. 2023. Comprehensive analysis of relationships of the representatives of subfamily Cryptogrammoideae (Pteridaceae). Turczaninowia 26, 2: 5–38. https://doi.org/10.14258/turczaninowia.26.2.1
Vaganov A. V., Metzgar J. S., Sinitsyna T. A., Shmakov A. I. 2020. Comprehensive analysis of Actiniopteris Link and Onychium Kaulf. (Pteridophyta) relationships according to their phylogeography, phylogeny and spore morphology. Phytotaxa 441(1): 1–18. https://doi.org/10.11646/phytotaxa.441.1.1
Walker T. G. 1968. The anatomy of some ferns of the Taenitis alliance». Proc. Linn. Soc. London 179(2): 279–286. https://doi.org/10.1111/j.1095-8312.1968.tb00988.x
Wang C.-H., Yang W.-L., Zhang D.-K., Zhang G.-M. 2020. Insight of phylogeny and the number of sporangium annulus cells in Coniogramme ser. Coniogramme. Phytotaxa 456(2): 166–174. https://doi.org/10.11646/phytotaxa.456.2.4
Wen J., Nie Z.-L., Ickert-Bond S. M. 2016. Intercontinental disjunctions between Eastern Asia and Western North America in vascular plants highlight the biogeographic importance of the bering land bridge from late cretaceous to neogene: eastern asian-western North American disjunctions. J. Syst. Evol. 54(5): 469–490. https://doi.org/10.1111/jse.12222
Zhang G. M., Dong S. Y., Zhang X. C. 2015. A taxonomic revision of Coniogramme Fée from Hainan Province, China. Bull. Bot. Res. 35: 647–651. https://doi.org/10.7525/j.issn.1673-5102.2015.05.002
Zhang G. M., Zhang X. C., Chen Z. D. 2005. Phylogeny of cryptogrammoid ferns and related taxa based on rbcL sequences. Nordic J. Bot. 23: 485–493. https://doi.org/10.1111/j.1756-1051.2003.tb00421.x
Zhang L., Zhou X.-M., Lu N. T., Zhang L.-B. 2017. Phylogeny of the fern subfamily Pteridoideae (Pteridaceae; Pteridophyta), with the description of a new genus: Gastoniella. Molec. Phylogen. Evol. 109: 59–72. https://doi.org/10.1016/j.ympev.2016.12.037
Zumkeller S. M., Knoop V., Knie N. 2016. Convergent Evolution of Fern-Specific Mitochondrial Group II Intron atp1i361g2 and ITS Ancient Source Paralogue rps3i249g2 and Independent Losses of Intron and RNA Editing among Pteridaceae. Genome Biol. Evol. 8(8): evw173. https://doi.org/10.1093/gbe/evw173
Уведомление об авторских правах
Turczaninowiа является "золотым издателем", так как мы позволяем самоархивирование, но самое главное, мы полностью прозрачны в своих правах.
Авторы могут представить и обсудить свои выводы перед публикацией: в биологических или научных конференций, на допечатной серверах, в общедоступных базах данных, а также в блогах, вики, твиттерах и другие неформальных каналах связи.
Turczaninowiа позволяет авторам внести рукописи (находящуюся в настоящее время на рассмотрении или тех, которые предполагается предоставить в Turczaninowia) для архивирования в некоммерческих, допечатных серверах, таких как ArXiv.
Авторы, публикующиеся в этом журнале согласны со следующими условиями: авторы сохраняют свои авторские права и предоставляют журналу право первой публикации в связи с работой, которая одновременно распространяется по лицензии Creative Commons Attribution и позволяют другим иметь доступ к работе с признанием авторства этой работы и первоначальной публикацией в этом журнале. Авторы могут заключать отдельные, дополнительные договорные соглашения по неисключительному распространению опубликованной версии (например, разместить ее в институтском репозитории или опубликовать в книге), с признанием ее первоначальной публикации в этом журнале.
Авторам разрешается и рекомендуется размещать их работу в Интернете (например, в институциональных хранилищах или на их сайте) до и во время процесса подачи, так как это может привести к продуктивным обменам, а также увеличению цитирования опубликованных работ (см. Политика открытого доступа)
Политика открытого доступа.
Заявление о конфиденциальности
Имена и адреса электронной почты, поданные при публикации в этом журнале, сайт будет использоваться исключительно для заявленных целей данного журнала, и они не будут доступны для любых других целей или какой-либо другой стороне.
Наша публикационная этика журнала основана, в значительной степени, на руководящих принципах и стандартах, разработанных Комитетом по этике публикации (COPE). Соответствующие обязанности и права авторов, рецензентов и редакторов журнала изложены ниже.
ОБЯЗАННОСТИ АВТОРОВ
Отправляя рукопись "Turczaninowia", автор (ы) гарантирует, что они отправляют рукопись как свою собственную, оригинальную работу, и что она не имеет ни были опубликованы ранее, и в настоящее время не рассматривается для публикации в других изданиях. Они также гарантируют, что источники каких-либо идей и / или слов в рукописи, которые не являются их собственными, были должным образом приписаны с помощью соответствующего цитирования.
Автор обычно не должен издавать рукописи, описывающие по существу те же исследования, в нескольких журналах или прочих публикациях. Такая избыточная публикация обычно считается неэтичным поведением, и в случае обнаружения, может привести к отклонению рассматриваемой рукописи рассматриваемого отвергаются, или опубликованная статья будет изъята.
Авторы рукописей, освещающих оригинальные исследования должны представить точный отчет о выполненной работе, в сопровождении объективного обсуждения его значения. Основополагающие данные должны быть представлены точно и полно в рукописи. Рукопись должна содержать достаточно подробные данные и ссылки, чтобы позволять другим дублировать работу. Подтасовка результатов и изготовление поддельных или заведомо неточных утверждений является неэтичным поведением и может быть причиной для отклонения или изъятия рукописи или опубликованной статьи.
Там, где в статьях есть отчеты о использовании коммерческого программного обеспечения, аппаратных средств или других продуктов, авторы должны подать декларацию в начале рукописи, в которой они должны заявить, что никакого конфликта интересов не существует или описать характер любого потенциального конфликта. Все источники финансовой поддержки для исследования также должны быть раскрыты в рукописи.
Автор (ы) рукописи соглашаются, что, если рукопись принята к публикации в "Turczaninowia", опубликованная статья будет характьеризоваться авторскими правами с использованием "Attribution-Unported" лицензии Creative Commons. Эта лицензия позволяет автору (ам) сохранить авторские права, но и позволяет другим свободно копировать, распространять и отображать произведение и производные работы, основанные на ней, при определенных заданных условиях.
Имена авторов должны быть перечислены на статье в порядке их вклада в статью, и все авторы берут на себя ответственность за свои собственные результаты. Только те люди, которые внесли существенный вклад, должны быть перечислены в качестве авторов; те, чьи вклады являются косвенными или маргинальными (например, коллег или руководителей, которые рассмотрели проекты работы или оказывали помощь в корректуре, и руководители научно-исследовательских институтов / центров / лабораторий) должны быть названы в разделе «Выражение признательности» в конце статьи, непосредственно предшествующему Списку литературы.
Автор, подающий статью, должен обеспечить, чтобы все соавторы былм включены в статью, и что все соавторы видели и одобрили окончательный вариант статьи и согласились на его публикацию.
Там, где автор обнаруживает существенную ошибку или неточность в статье, которая была уже опубликована в "Turczaninowia", он / она обязана незамедлительно уведомить редакцию и сотрудничать с ними, чтобы исправить статью или отозвать ее в случае необходимости.
ОБЯЗАННОСТИ РЕЦЕНЗЕНТОВ
В журнале "Turczaninowia" рецензенты выполняют работу для журнала на добровольной основе. Учитывая, что большинство из этих людей находятся в полной занятости, их рецензирование для "Turczaninowia" должна выолняться по мере необходимости, а не быть их главным приоритетом. Рецензенты могут свободно отклонять приглашения для рассмотрения конкретных рукописей по своему усмотрению, например, если их текущая нагрузка, занятость и / или другие обязательства могут сделать ее непомерно высокой для того, чтобы завершить обзор своевременно и уделить должное время рецензированию. Они также не должны принимать рукописи на рецензию, в тематике которых они не чувствуют себя подходящим специалистом.
Рецензенты, которые приняли рукописи, как правило, должны предоставить свои рецензии в течение трех недель. Они должны отказаться от рецензии, если становится очевидным для них на любой стадии, что они не обладают необходимыми знаниями для выполнения рецензии, или что они могут иметь потенциальный конфликт интересов при проведении рецензии (например, в результате конкурентных исследований, совместных или других отношений или связей с кем-либо из авторов, учреждений или компаний, связанных с рукописью).
Информация или идеи, полученные рецензентами в процессе рецензирования должны храниться в тайне и не используются для личной выгоды. Любые рукописи, полученные для рассмотрения, должны рассматриваться как конфиденциальные документы, и не должны быть показаны или обсуждены с другими, если только это не санкционировано редакторами "Turczaninowia".
При проведении своих рецензий, рецензентам необходимо сделать это как можно более объективно, воздерживаться от участия в личной критики автора (ов). Им предлагается высказать свое мнение четко, объясняя и оправдывая все рекомендации. Они всегда должны пытаться представить подробную и конструктивную обратную связь, чтобы помочь автору (ам) в повышении эффективности их работы, даже если рукопись, по их мнению, не подлежит опубликованию.
Рецензенты должны определить в своих рецензиях соответствующие опубликованные работы, которые не были названы автором (ами), вместе с любыми примерами, где не было сделано надлежащее цитирование источников. Они должны привлечь внимание ответственного редактора в отношении каких-либо серьезных сходств между рукописью, поданной на рассмотрение и других опубликованных статей, или статей, о которых им известно, а также предотвратить любые проблемы, которые могут иметь место по отношению к этической приемлемости исследований, представленных в рукописи.
ОБЯЗАННОСТИ РЕДАКЦИИ
Редактор журнала "Turczaninowia" несет полную ответственность за решение о публикации рукописи, которая представляется в "Turczaninowia", и при этом руководствуется политикой журнала, и в соответствии с определенными редакцией "Turczaninowia" юридическими требованиями в отношении клеветы, нарушения авторских прав и плагиата. Редактор может проконсультироваться с заместителями Редактора и другими членами редакционной коллегии, а также с рецензентами, для принятии решений о публикации.
Редакция будет оценивать рукописи с точки зрения ее интеллектуального содержания без учета расы, цвета кожи, пола, сексуальной ориентации, религиозных убеждений, этнического происхождения, гражданства или политической философии автора (ов). Они не будут никому разглашать какую-либо информацию о рукописи, кроме автора (ов), рецензентов и потенциальных рецензентов, а в некоторых случаях членов редакционной коллегии "Turczaninowia" и членов команды управления журналом, в зависимости от обстоятельств. Кроме того, редакция будет прилагать все усилия, чтобы обеспечить целостность процесса слепого рецензирования, не раскрывая личности автора (ов) рукописи для рецензентам этой рукописи, и наоборот.
При оценке рукописи для публикации, в дополнение к рассмотрению стандартных критериев, относящихся к строгости рукописи, качеству ее предоставления, а также ее вклад в область научных знаний, редакторы также будут руководствоваться тем, насколько этические нормы были соблюдены, и вред был сведен к минимуму при проведении исследования. Они также оценивают насколько полученные научные и практические выгоды перевешивают вред в случае конкретного исследования.
Так как "Turczaninowia" приветствует предоставление рукописей из любой страны, необходимо признать, что законы и нормативные акты, касающиеся этики научных исследований и этического утверждения, различаются во всем мире. Таким образом, редакторам, возможно, придется обратиться за разъяснениями в связи с этим к автору (ам) с просьбой о том, чтобы они представили письмо от соответствующего институционального комитета по этике или совета, который одобрил исследование.
Редакция будет руководствоваться Руководством CORE для изъятия статей при рассмотрении любых спорных вопросов, которые были опубликованы в AASRJ. Редакторы готовы работать в тесном сотрудничестве с научно-исследовательскими организациями и учреждениями в соответствии с рекомендациями CORE о сотрудничестве между научно-исследовательскими институтами и журналами в области публикационной этики и этики проведения исследований.
"Turczaninowia" является журналом открытого доступа, что означает, что все его содержимое свободно и доступно бесплатно для пользователя или его / ее учреждения. Пользователи могут читать, загружать, копировать, распространять, печатать, выполнять поиск, делать ссылки на полные тексты статей в этом журнале, не спрашивая предварительного разрешения от издателя или автора. Это легитимно в соответствии с определением BOAI об открытом доступе.
Наш сайт демонстрирует знак Creative Commons, и это исключительное право автора, если он / она хочет, чтобы его / ее статьи были в свободном доступе или нет. Но мы должны опубликовать Резюме и метаданные статьи в полном доступе в любом случае.
