Первая находка Bacillicladium lobatum (Chaetothyriales) на Кавказе (вторая находка в мире)
УДК 582.282:581.95(479-924.73)
Аннотация
Bacillicladium lobatum выделен из криоконитов гор Кавказа и представлен штаммом CZ-25. Исследовали макро- и микроморфологию изолята, а также частичные последовательности внутреннего транскрибируемого спейсерного участка рДНК (ITS1-5.8S-ITS2). Изолят Bacillicladium lobatum CZ-25 имел ряд особенностей, которые отличали его от штамма Bacillicladium lobatum из биопленки образований, покрывающих голые гранитные стены на станции метро KungstraÈdgården в Стокгольме. Штамм c Кавказа имел более крупные конидии и широкие гифы, его максимальная температура роста была выше. В результате наших исследований мы впервые обнаружили микрогрибы Bacillicladium lobatum в горах Кавказа. Наше исследование показывает, что Bacillicladium lobatum является видом, встречающимся в городах Северной Европы и в горах Кавказа.
Скачивания
Metrics
Литература
Bagshaw E. A., Tranter M., Wadham J. L., Fountain A. G., Dubnick A., Fitzsimons S. 2016. Processes controlling carbon cycling in Antarctic glacier surface ecosystems. Geochem. Perspect. Lett. 2: 44–54. DOI: 10.7185/geochemlet.1605
Bardgett R. D., Richter A., Bol R., Garnett M. H., Baumler R., Xu X. L., LopezCapel E., Manning D. A. C., Hobbs P. J., Hartley I. R., Wanek W. 2007. Heterotrophic microbial communities use ancient carbon following glacial retreat. Biol. Lett. 5: 487–490.
Belozerov E., Rets E., Popovnin V. 2020. Mathematical simulation of melting mountain glaciers, EGU General Assembly. EGU2020-10440. DOI: 10.5194/egusphere-egu2020-10440
Ciccazzo S., Esposito A., Borruso L., Brusetti L. 2016. Microbial communities and primary succession in high altitude mountain environments. Ann. Microbiol. 66: 43–60. DOI: 10.1007/s13213-015-1130-1
Crous P. W., Schumacher R. K., Akulov A., Thangavel R., Hernández-Restrepo M., Carnegie A. J., Cheewangkoon R., Wingfield M. J., Summerell B. A., Quaedvlieg W., Coutinho T. A., Roux J., Wood A. R., Giraldo1 A., Groenewald J. Z. 2019. New and Interesting Fungi. 2 Fungal Systematics and Evolution 3: 57–134. DOI: 10.3114/fuse.2019.03.06
Darcy J. L., Schmidt S. K. 2016. Nutrient limitation of microbial phototrophson a debris-covered glacier. Soil. Biol. Biochem. 95: 156–63.
GenBank database (NCBI) by using BLAST instrument. URL: http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi (Accessed 08 May 2023).
Goldman E., Green L. H. 2015. Practical Handbook of Microbiology. 3rd Edition. Boca Raton, USA: CRCPress. 1055 pp.
Gueidan C., Ruibal C., de Hoog G. S., Gorbushina A. A., Untereiner W. A., Lutzoni F. 2008. A rock-inhabiting ancestor for mutualistic and pathogen-rich fungal lineages. Stud. Mycol. 61: 111–119. DOI: 10.3114/sim.2008.61.11 PMID: 19287533
Hodson A., Anesio A. M., Tranter M., Fountain A., Osborn M., Priscu J. 2008. Glacial ecosystems. Ecol. Monogr. 78: 41–67. DOI: 10.1890/07-0187.1
Index Fungorum [2023]. URL: http://www.indexfungorum.org (Accessed 08 May 2023).
Kelly K. L. 1964. Inter-Society Color Council – National Bureau of Standards Color Name Charts Illustrated with Centroid Color. Washington, DC: US Government Printing Office. 22 pp.
Nemergut D. R., Anderson S. P., Cleveland C. C., Martin A. P., Miller A. E., Seimon A., Schmidt S. K. 2007. Microbial community succession in an unvegetated recently deglaciated soil. Microb Ecol 53: 110–122.
Nicol G. W., Tscherko D., Embley T. M., Prosser J. I. 2005. Primary succession of soil crenarchaeota across a receding glacier foreland. Environ. Microbiol. 7: 337–347.
Novakova A., Hubka V., Sailz-Jimenez C., Kolarik M. 2012. Aspergillus baeticus sp. nov. and Aspergillus thesauricus sp. nov.: Two new species in section Usti originating from Spanish caves. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 62: 2778– 2785. DOI: 10.1099/ijs.0.041004-0
Poniecka E. A., Bagshaw E. A., Tranter M., Sass H., Williamson C. J., Anesio A. M. 2018. Rapid development of anoxic niches in supraglacial ecosystems. Arctic, Antarct. Alp. Res. 50: S100015. DOI: 10.1080/15230430.2017.1420859
Porazinska D. L., Fountain A. G., Nylen T. H., Tranter R. M., Virginia A., Wall D. H. 2004. The biodiversity and biogeochemistry of Cryoconite holes from McMurdo dry valley glaciers, Antarctica. Arctic, Antarct. Alp. Res. 36(1): 84–91.
Raper K. B., Thom C. 1949. A manual of the Penicillia. Baltimore: The Williams & Wilkins Company. 878 pp.
ReÂblova Â. M., Hubka V., Thureborn O., Lundberg J., Sallstedt T., Wedin M. 2016. From the Tunnels into the Treetops: New Lineages of Black Yeasts from Biofilm in the Stockholm Metro System and Their Relatives among Ant-Associated Fungi in the Chaetothyriales. PLoS ONE 11(10): e0163396. DOI: 10.1371/journal.pone.0163396
Ruibal C., Platas G., Bills G. F. 2008. High diversity and morphological convergence among melanised fungi from rock formations in the Central Mountain System of Spain. Persoonia 21: 93–110. DOI: 10.3767/003158508X371379 PMID: 20396580
Samson R. A., Houbraken J., Thrane U., Frisvad J. C., Andersen B. 2010. Food and Indoor Fungi [CBS Laboratory Manual series no. 2.], Utrecht: CBS-KNAW. Fungal Biodiversity Centre. 390 pp.
Samson R. A., Visagie C., Houbraken J., Hong S. -B., Hubka V., Klaassen C. H. W., Perrone G., Seiffert K. A., Susca A., Tanney J. B., Varga J., Kocsube S., Szigeti G., Yaguchi T., Frisvard J. C. 2014. Phylogeny, identification and nomenclature of the genus Aspergillus. Studies in Mycology 78: 141–173. DOI: 10.1016/j.simyco.2014.07.004
Scher C., Steiner N. C., Kyle C., McDonald. 2020. Mapping seasonal glacier melt across the Hindu Kush Himalaya with time series SAR. The cryosphere 15: 4465–4482. DOI: 10.5194/tc-2020-181
Schmidt S. K., Naff C. S., Lynch R. C. 2012. Fungal communities at the edge: ecological lesson from high alpine fungi. Fungal. Ecol. 5: 443–452.
Schmidt S. K., Reed S. C., Nemergut D. R., Grandy A. S., Cleveland C. C., Weintraub M. N., Hill A. W., Costello E. K., Meyer A. F., Neff J. C., Martin A. M. 2008. The earliest stages of ecosystem succession in high elevation (5000 meters above sea level) recently deglaciated soils. Proc. R. Soc. B. 275: 2793–2802.
Selbmann L., de Hoog G. S., Mazzaglia A., Friedmann E. I., Onofri S. 2005. Fungi at the edge of life: cryptoendolithic black fungi from Antarctic desert. Stud. Mycol. 51: 1–32.
Sigler W. V., Crivii S., Zeyer J. 2002. Bacterial succession in glacial forefield soils characterized by community structure activity and opportunistic growth dynamics. Microb. Ecol. 44: 306–316.
Sigler W. V., Zeyer J. 2002. Microbial diversity and activity along the forefields of two receding glaciers. Microb. Ecol. 45: 397–407.
Sigler W. V., Zeyer J. 2004. Colony-forming analysis of bacterial community succession in deglaciated soils indicates pioneer stress-tolerant opportunists. Microb. Ecol. 48: 316–323.
Sterflinger K., Krumbein W. E. 1995. Multiple stress factors affecting growth of rock inhabiting black fungi. Bot. Acta 108: 467–538.
Takeuchi O., Sakaki A., Uetake J., Nagatsuka N., Shimada R., Niwano M., Aoki T. 2018. Temporal variations of cryoconite holes and cryoconite coverage on the ablation ice surface of Qaanaaq Glacier innorthwest Greenland. Annals of Glaciology 59(77): 1–10. DOI: 10.1017/aog.2018.19
White T. J., Bruns T., Lee S., Taylor J. 1990. Amplification and direct sequencing of fungal ribosomal RNA genes for phylogenetics. In: M. Innis, D. Gelfand, J. Sninsky, T. White (eds.). PCR Protocols: A Guide to Methods and Applications. San Diego, California: Academic Press. Pp. 315–322.
Zawierucha K., Ostrowska M., Kolicka M. 2017. Applicability of cryoconite consortia of microorganisms and glacier-dwelling animals in astrobiological studies. Contemp. Trends. Geosci. 6(1): 1–10. DOI: 10.1515/ctg-2017-0001
Уведомление об авторских правах
Turczaninowiа является "золотым издателем", так как мы позволяем самоархивирование, но самое главное, мы полностью прозрачны в своих правах.
Авторы могут представить и обсудить свои выводы перед публикацией: в биологических или научных конференций, на допечатной серверах, в общедоступных базах данных, а также в блогах, вики, твиттерах и другие неформальных каналах связи.
Turczaninowiа позволяет авторам внести рукописи (находящуюся в настоящее время на рассмотрении или тех, которые предполагается предоставить в Turczaninowia) для архивирования в некоммерческих, допечатных серверах, таких как ArXiv.
Авторы, публикующиеся в этом журнале согласны со следующими условиями: авторы сохраняют свои авторские права и предоставляют журналу право первой публикации в связи с работой, которая одновременно распространяется по лицензии Creative Commons Attribution и позволяют другим иметь доступ к работе с признанием авторства этой работы и первоначальной публикацией в этом журнале. Авторы могут заключать отдельные, дополнительные договорные соглашения по неисключительному распространению опубликованной версии (например, разместить ее в институтском репозитории или опубликовать в книге), с признанием ее первоначальной публикации в этом журнале.
Авторам разрешается и рекомендуется размещать их работу в Интернете (например, в институциональных хранилищах или на их сайте) до и во время процесса подачи, так как это может привести к продуктивным обменам, а также увеличению цитирования опубликованных работ (см. Политика открытого доступа)
Политика открытого доступа.
Заявление о конфиденциальности
Имена и адреса электронной почты, поданные при публикации в этом журнале, сайт будет использоваться исключительно для заявленных целей данного журнала, и они не будут доступны для любых других целей или какой-либо другой стороне.
Наша публикационная этика журнала основана, в значительной степени, на руководящих принципах и стандартах, разработанных Комитетом по этике публикации (COPE). Соответствующие обязанности и права авторов, рецензентов и редакторов журнала изложены ниже.
ОБЯЗАННОСТИ АВТОРОВ
Отправляя рукопись "Turczaninowia", автор (ы) гарантирует, что они отправляют рукопись как свою собственную, оригинальную работу, и что она не имеет ни были опубликованы ранее, и в настоящее время не рассматривается для публикации в других изданиях. Они также гарантируют, что источники каких-либо идей и / или слов в рукописи, которые не являются их собственными, были должным образом приписаны с помощью соответствующего цитирования.
Автор обычно не должен издавать рукописи, описывающие по существу те же исследования, в нескольких журналах или прочих публикациях. Такая избыточная публикация обычно считается неэтичным поведением, и в случае обнаружения, может привести к отклонению рассматриваемой рукописи рассматриваемого отвергаются, или опубликованная статья будет изъята.
Авторы рукописей, освещающих оригинальные исследования должны представить точный отчет о выполненной работе, в сопровождении объективного обсуждения его значения. Основополагающие данные должны быть представлены точно и полно в рукописи. Рукопись должна содержать достаточно подробные данные и ссылки, чтобы позволять другим дублировать работу. Подтасовка результатов и изготовление поддельных или заведомо неточных утверждений является неэтичным поведением и может быть причиной для отклонения или изъятия рукописи или опубликованной статьи.
Там, где в статьях есть отчеты о использовании коммерческого программного обеспечения, аппаратных средств или других продуктов, авторы должны подать декларацию в начале рукописи, в которой они должны заявить, что никакого конфликта интересов не существует или описать характер любого потенциального конфликта. Все источники финансовой поддержки для исследования также должны быть раскрыты в рукописи.
Автор (ы) рукописи соглашаются, что, если рукопись принята к публикации в "Turczaninowia", опубликованная статья будет характьеризоваться авторскими правами с использованием "Attribution-Unported" лицензии Creative Commons. Эта лицензия позволяет автору (ам) сохранить авторские права, но и позволяет другим свободно копировать, распространять и отображать произведение и производные работы, основанные на ней, при определенных заданных условиях.
Имена авторов должны быть перечислены на статье в порядке их вклада в статью, и все авторы берут на себя ответственность за свои собственные результаты. Только те люди, которые внесли существенный вклад, должны быть перечислены в качестве авторов; те, чьи вклады являются косвенными или маргинальными (например, коллег или руководителей, которые рассмотрели проекты работы или оказывали помощь в корректуре, и руководители научно-исследовательских институтов / центров / лабораторий) должны быть названы в разделе «Выражение признательности» в конце статьи, непосредственно предшествующему Списку литературы.
Автор, подающий статью, должен обеспечить, чтобы все соавторы былм включены в статью, и что все соавторы видели и одобрили окончательный вариант статьи и согласились на его публикацию.
Там, где автор обнаруживает существенную ошибку или неточность в статье, которая была уже опубликована в "Turczaninowia", он / она обязана незамедлительно уведомить редакцию и сотрудничать с ними, чтобы исправить статью или отозвать ее в случае необходимости.
ОБЯЗАННОСТИ РЕЦЕНЗЕНТОВ
В журнале "Turczaninowia" рецензенты выполняют работу для журнала на добровольной основе. Учитывая, что большинство из этих людей находятся в полной занятости, их рецензирование для "Turczaninowia" должна выолняться по мере необходимости, а не быть их главным приоритетом. Рецензенты могут свободно отклонять приглашения для рассмотрения конкретных рукописей по своему усмотрению, например, если их текущая нагрузка, занятость и / или другие обязательства могут сделать ее непомерно высокой для того, чтобы завершить обзор своевременно и уделить должное время рецензированию. Они также не должны принимать рукописи на рецензию, в тематике которых они не чувствуют себя подходящим специалистом.
Рецензенты, которые приняли рукописи, как правило, должны предоставить свои рецензии в течение трех недель. Они должны отказаться от рецензии, если становится очевидным для них на любой стадии, что они не обладают необходимыми знаниями для выполнения рецензии, или что они могут иметь потенциальный конфликт интересов при проведении рецензии (например, в результате конкурентных исследований, совместных или других отношений или связей с кем-либо из авторов, учреждений или компаний, связанных с рукописью).
Информация или идеи, полученные рецензентами в процессе рецензирования должны храниться в тайне и не используются для личной выгоды. Любые рукописи, полученные для рассмотрения, должны рассматриваться как конфиденциальные документы, и не должны быть показаны или обсуждены с другими, если только это не санкционировано редакторами "Turczaninowia".
При проведении своих рецензий, рецензентам необходимо сделать это как можно более объективно, воздерживаться от участия в личной критики автора (ов). Им предлагается высказать свое мнение четко, объясняя и оправдывая все рекомендации. Они всегда должны пытаться представить подробную и конструктивную обратную связь, чтобы помочь автору (ам) в повышении эффективности их работы, даже если рукопись, по их мнению, не подлежит опубликованию.
Рецензенты должны определить в своих рецензиях соответствующие опубликованные работы, которые не были названы автором (ами), вместе с любыми примерами, где не было сделано надлежащее цитирование источников. Они должны привлечь внимание ответственного редактора в отношении каких-либо серьезных сходств между рукописью, поданной на рассмотрение и других опубликованных статей, или статей, о которых им известно, а также предотвратить любые проблемы, которые могут иметь место по отношению к этической приемлемости исследований, представленных в рукописи.
ОБЯЗАННОСТИ РЕДАКЦИИ
Редактор журнала "Turczaninowia" несет полную ответственность за решение о публикации рукописи, которая представляется в "Turczaninowia", и при этом руководствуется политикой журнала, и в соответствии с определенными редакцией "Turczaninowia" юридическими требованиями в отношении клеветы, нарушения авторских прав и плагиата. Редактор может проконсультироваться с заместителями Редактора и другими членами редакционной коллегии, а также с рецензентами, для принятии решений о публикации.
Редакция будет оценивать рукописи с точки зрения ее интеллектуального содержания без учета расы, цвета кожи, пола, сексуальной ориентации, религиозных убеждений, этнического происхождения, гражданства или политической философии автора (ов). Они не будут никому разглашать какую-либо информацию о рукописи, кроме автора (ов), рецензентов и потенциальных рецензентов, а в некоторых случаях членов редакционной коллегии "Turczaninowia" и членов команды управления журналом, в зависимости от обстоятельств. Кроме того, редакция будет прилагать все усилия, чтобы обеспечить целостность процесса слепого рецензирования, не раскрывая личности автора (ов) рукописи для рецензентам этой рукописи, и наоборот.
При оценке рукописи для публикации, в дополнение к рассмотрению стандартных критериев, относящихся к строгости рукописи, качеству ее предоставления, а также ее вклад в область научных знаний, редакторы также будут руководствоваться тем, насколько этические нормы были соблюдены, и вред был сведен к минимуму при проведении исследования. Они также оценивают насколько полученные научные и практические выгоды перевешивают вред в случае конкретного исследования.
Так как "Turczaninowia" приветствует предоставление рукописей из любой страны, необходимо признать, что законы и нормативные акты, касающиеся этики научных исследований и этического утверждения, различаются во всем мире. Таким образом, редакторам, возможно, придется обратиться за разъяснениями в связи с этим к автору (ам) с просьбой о том, чтобы они представили письмо от соответствующего институционального комитета по этике или совета, который одобрил исследование.
Редакция будет руководствоваться Руководством CORE для изъятия статей при рассмотрении любых спорных вопросов, которые были опубликованы в AASRJ. Редакторы готовы работать в тесном сотрудничестве с научно-исследовательскими организациями и учреждениями в соответствии с рекомендациями CORE о сотрудничестве между научно-исследовательскими институтами и журналами в области публикационной этики и этики проведения исследований.
"Turczaninowia" является журналом открытого доступа, что означает, что все его содержимое свободно и доступно бесплатно для пользователя или его / ее учреждения. Пользователи могут читать, загружать, копировать, распространять, печатать, выполнять поиск, делать ссылки на полные тексты статей в этом журнале, не спрашивая предварительного разрешения от издателя или автора. Это легитимно в соответствии с определением BOAI об открытом доступе.
Наш сайт демонстрирует знак Creative Commons, и это исключительное право автора, если он / она хочет, чтобы его / ее статьи были в свободном доступе или нет. Но мы должны опубликовать Резюме и метаданные статьи в полном доступе в любом случае.
