МОБИЛЬНЫЕ ЭЛЕМЕНТЫ ГЕНОМА СОРТОВ TRITICUM. КОЛИЧЕСТВЕННЫЙ АНАЛИЗ С ПОМОЩЬЮ ПЦР «В РЕАЛЬНОМ ВРЕМЕНИ»

  • M. G. Kutsev Алтайский государственный университет, Барнаул, Россия
  • M. A. Kholodkova Алтайский государственный университет, Барнаул, Россия
  • M. S. Ivanova Алтайский государственный университет, Барнаул, Россия
  • D. V. Balabova Алтайский государственный университет, Барнаул, Россия
  • U. A. Boyarskikh Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, Новосибирск, Россия
  • E. A. Khrapov Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, Новосибирск, Россия
  • O. V. Uvarova Алтайский государственный университет, Барнаул, Россия
  • A. A. Kechaykin Алтайский государственный университет, Барнаул, Россия
  • T. A. Sinitsyna Алтайский государственный университет, Барнаул, Россия
  • M. V. Skaptsov Алтайский государственный университет, Барнаул, Россия
  • S. V. Smirnov Алтайский государственный университет, Барнаул, Россия
  • A. I. Shmakov Алтайский государственный университет, Барнаул, Россия

Аннотация

Исследовано относительное содержание ретротранспозонов Ty1/copia и 5.8S рДНК в геномах 9 сортов пшеницы. Разработана методика ПЦР с детекцией в режиме реального времени для выявления количества ретротранспозонов Ty1/copia и 5.8S рДНК. Выявлено повышенное относительное содержание ретротранспозонов в гексаплоидных сортах пшеницы по сравнению с тетраплоидными.

Скачивания

Данные скачивания пока не доступны.

Литература

Гончаров Н.П. Сравнительная генетика пшениц и их сородичей. – Новосибирск: Сиб. унив. изд-во, 2002. – 252 с.

Митрофанова О.П. Генетические ресурсы пшеницы в России: состояние и предселекционное изучение // Вавиловский журнал генетики и селекции, 2012. – Т. 16, № 1. – С. 10–20.

Кудрявцев А.М. Создание системы генетических маркеров твердой пшеницы (T. durum Desf.) и ее применение в научных исследованиях и практических разработках: Дисс. … д-ра биол. наук. – М., 2007. – 305 с.

Куцев М.Г., Холодкова М.А., Смирнов С.В., Фризен Н.В. Сравнительный анализ распределения ретротранспозона Ty1-copia в сортах пшеницы // Turczaninowia, 2012. – Т. 15, № 4. – С. 95–97.

Abd El-Twab M.H. Physical mapping of the 45S rDNA on the chromosomes of Triticum turgidum and T. aestivum using fluorescence in situ hybridization for chromosome ancestors // Arab Journal of Biotechnology, 2007. – Vol. 10, № 1. – P. 69–80.

Altschul S., Gish W., Miller W., Myers E., Lipman D. Basic local alignment search tool //Journal of Molecular Biology, 1990. –Vol. 215, № 3. – Р. 403–410.

Bennett M.D., Smith J.B. Nuclear DNA amounts in angiosperms // Philosophical Transactions of the Royal Society of London, Series B – Biological Sciences, 1976. – Vol. 274. – P. 227–274.

Boyko E.V., Badaev N.S., Maximov N.G., Zelenin A.V. Does DNA content change in the course of Triticale breeding // Cereal Research Communications, 1984. – № 12. – P. 99–100.

Carvalho A., Guedes-Pinto H., Lima-Brito J. Intergenic spacer length variants in Old Portuguese bread wheat cultivars // Journal of Genetics, 2011. – Vol. 90, № 2. – P. 203–208.

Crockett A.O., Wittwer C.T. Fluorescein-labeled oligonucleotides for real-time pcr: using the inherent quenching of deoxyguanosine nucleotides // Anal. Biochem., 2001. – Vol. 290. – P. 89–97.

Dubouzet J.G., Shinoda K. ITS DNA sequence relationships between Lilium concolor Salisb., L. dauricum Ker-Gawl. and their putative hybrid, L. maculatum Thunb // Theoretical and Applied Genetics, 1999. – Vol. 98, № 2. – P. 213–218.

Dvorak J., Tetizi P., Zhang H.B., Resta P. The evolution of polyploid wheats: identification of the a genome donor species // Genome, 1993. – Vol. 36, № 1. – P. 21–31.

Flavell R.B., O’Dell M. The genetic control of nucleolus formation in wheat // Chromosoma, 1979. – Vol. 71. – P. 135–152.

Flavell R.B., Smith D.B. Variation in nucleolar organiser rRNA gene multiplicity in wheat and rye // Chromosoma, 1974. – Vol. 47. – P. 327–334.

Goncharov N.P., Golovnina K.A., Kilian B., Glushkov S., Blinov A., Shumny V.K. Evolutionary history of wheats – the main cereal of mankind // Biosphere origin and evolution / Eds. N. Dobretsov et al. – Springer, 2008. – P. 407–419.

Greilhuber J., Dolezel J., Lysak M.A., Bennett M.D. The origin, evolution and proposed stabilization of the terms “Genome Size” and “C-Value” to describe nuclear DNA contents // Annals of Botany, 2005. – Vol. 95. – P. 255–260.

Higgins D.G., Bleasby A.J., Fuchs R. CLUSTAL V: improved software for multiple sequence alignment // Comput. Appl. Biosci., 1992. – Vol. 8. – P. 189–191.

Higgins D.G., Sharp P.M. CLUSTAL: a package for performing multiple sequence alignment on a microcomputer // Gene, 1988. – Vol. 73. – P. 237–244.

Higgins D.G., Sharp P.M. Fast and sensitive multiple sequence alignments on a microcomputer // Comput. Appl. Biosci., 1989. – Vol. 5. – P. 151–153.

Li W., Zhang P., Fellers J.P., Friebe B., Gill B.S. Sequence composition, organization, and evolution of the core Triticeae genome // Plant Journal, 2004. – Vol. 40, № 4. – Р. 500–511.

Liu K., Somerville S. Cloning and characterization of a highly repeated DNA sequence in Hordeum vulgare L. // Genome, 1996, Dec. – Vol. 39, № 6. – P. 1159–1168.

Luo M.-C., Yang Z.-L., Dvorak J. Position effects of ribosomal RNA multigene loci on meiotic recombination in wheat // Genetics, 1998. – Vol. 149. – P. 1105–1113.

Matsuoka Y., Tsunewaki K. Evolutionary dynamics of Ty1-copia group retrotransposons in grass shown by reverse transcriptase domain analysis // Molecular Biology and Evolution, 1999. – Vol. 16, № 2. – P. 208–217.

Nazarenko I., Pires R., Lowe B., Obaidy M., Rashtchian A. Effect of primary and secondary structure of oligodeoxyribonucleotides on the fluorescent properties of conjugated dyes // Nucleic Acids Research, 2002. – Vol. 30. – P. 2089–2195.

Nazarenko I.A., Bhatnager S.K., Hohman R.J. A closed tube format for amplification and detection of DNA based on energy transfer // Nucleic Acids Research, 1997. – Vol. 25. – P. 2516–2521.

Paux E., Roger D., Badaeva E., Gay G., Bernard M., Sourdille P., Feuillet C. Characterizing the composition and evolution of homoeologous genomes in hexaploid wheat through BAC-end sequencing on chromosome 3B // Plant Journal, 2006. – Vol. 48, № 3. – P. 463–474.

Rozen S., Skaletsky H.J. Primer 3 on the WWW for general users and for biologist programmers / Eds. S. Krawetz, S. Misener. – Bioinformatics methods and protocols: methods in molecular biology. – Totowa: Humana Press, 2000. – P. 365–386.

Swift H. The constancy of deoxyribose nucleic acid in plant nuclei // Proceedings of the National Academy of Sciences, 1950. – Vol. 36. – P. 643–654.

Tamura K., Peterson D., Peterson N., Stecher G., Nei M., Kumar S. MEGA5: Molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods // Molecular Biology and Evolution, 2011. – Vol. 28. – P. 2731–2739.
Как цитировать
Kutsev, M., Kholodkova, M., Ivanova, M., Balabova, D., Boyarskikh, U., Khrapov, E., Uvarova, O., Kechaykin, A., Sinitsyna, T., Skaptsov, M., Smirnov, S., & Shmakov, A. (1). МОБИЛЬНЫЕ ЭЛЕМЕНТЫ ГЕНОМА СОРТОВ TRITICUM. КОЛИЧЕСТВЕННЫЙ АНАЛИЗ С ПОМОЩЬЮ ПЦР «В РЕАЛЬНОМ ВРЕМЕНИ». Turczaninowia, 16(4), 72–78. извлечено от http://turczaninowia.asu.ru/article/view/677
Раздел
Научные статьи

Наиболее читаемые статьи этого автора (авторов)

1 2 > >>