Эколого-генетическая дифференциация ценопопуляций Quercus robur L. на территории Ростовской области с применением ISSR-маркеров
Аннотация
Изложены результаты изучения популяционных характеристик ценопопуляций дуба черешчатого (Quercus robur L.): абсолютное число аллелей (na), эффективное число аллелей (ne), ожидаемая гетерозиготность (He). В среднем по всем ценопопуляциям значение ожидаемой гетерозиготности составило 0,3848. Также изучено генетическое разнообразие экотопов на основании среднего уровня ожидаемой гетерозиготности. Показано, что в ряду экотопов «пойменный → аренный → байрачный» наблюдается взаимосвязь между величиной показателя средней ожидаемой гетерозиготности и почвенным гидрологическим режимом.
Скачивания
Metrics
Литература
Chokheli V., Kozlovsky B., Sereda M., Lysenko V., Fesenko I., Varduny T., Kapralova O., Bondarenko E. 2016. Preliminary comparative analysis of phenological varieties of Quercus robur by ISSR-markers. Journal of Botany 2016: Article ID 7910451. DOI: 10.1155/2016/7910451
Coutinho J. P., Carvalho J. A., Lima-Brito J. 2014. Fingerprinting of Fagaceae individuals using inter microsatellite markers. Journal of Genetics 93: 132–140. DOI: 10.1007/s12041-014-0460-2
Coutinho J. P., Carvalho A., Lima-Brito J. 2015. Taxonomic and ecological discrimination of Fagaceae species based on internal transcribed spacer polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism. AoB PLANTS 7: plu079. DOI: 10.1093/aobpla/plu079
Gabitova A. A., Boronnikova S. V., Yanbaev Yu. A. 2012. Ecological impact on genetic variation among populations of pendiculate oak in the Southern Urals. Vestnik BGAU [Bulletin of BSAU] 1: 63–65 [In Russian]. (Габитова А. А., Боронникова С. В., Янбаев Ю. А. Экологическая обусловленность межпопуляционной генетической дифференциации дуба черешчатого на Южном Урале // Вестник БГАУ, 2012. № 1. С. 63–65).
Grativol C., Lira-Medeiros C. F., Hemerly A. S., Ferreira P. C. G. 2011. High efficiency and reliability of inter-simple sequence repeats (ISSR) markers for evaluation of genetic diversity in Brazilian cultivated Jatropha curcas L. accessions. Mol. Biol. Rep. 38(7): 4245–4256. DOI: 10.1007/s11033-010-0547-7
Jankowski K., Truba M., Jankowska J., Czeluscinski W., Wisniewska-Kadzajan B., Malinowska E., Matsyura A. 2018. Effects of soil conditioners on lawn grass growth in different year seasons. Applied Ecology and Environmental Research, 16 (4): 3755-3765. doi:10.15666/aeer/1604_37553765
Kamalova I. I., Karpechenko N. A., Veprincev V. N. 2014. Experience of using RAPD-markers for identification of clones and families on seed plantations of English oak]. In: VI Syezd Vavilovskogo obshhestva genetikov i selektsionerov (VOGiS) i assotsciirovannyye geneticheskiye simpoziumy [VI Congress of Vavilov society of geneticists and breeders (VSGaB) and associated genetic symposia]. SO RAN, Rostov-on-Don, 172–173 pp. [In Russian]. (Камалова И. И., Карпеченко Н. А., Вепринцев В. Н. Опыт использования RAPD-маркеров для идентификации клонов и семей на семенных плантациях дуба черешчатого // VI Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров (ВОГиС) и ассоциированные генетические симпозиумы (Ростов-на-Дону, 15–20 июня 2014 г.): Тез. докл. Ростов-на-Дону: Изд-во СО РАН, 2014. С. 172–173).
Karpechenko K. A., Semenova V. A., Zemlyanukhina O. A., Karpechenko N. A. 2011. PCR based molecular genetic method for analysis of specific forms of oak (Quercus robur). In: Sokhranenie lesnykh geneticheskikh resursov Sibiri [Conservation of forest genetic resources of Siberia: Proceedings of the 3rd International meeting]. SO RAN, Krasnoyarsk, 68 р. [In Russian]. (Карпеченко К. А., Семенова В. А., Землянухина О. А., Карпеченко Н. А. Использование молекулярно-генетического метода на основе ПЦР для формоспецифического анализа дуба (Quercus robur) // Сохранение лесных генетических ресурсов Сибири: Материалы 3-го Междунар. совещ. (Красноярск, 23–29 августа 2011 г.). Красноярск: Изд-во СО РАН, 2011. С. 68).
Kovalevich O. A., Kahan D. I., Padutov V. E. 2010. Genetic structure and gene genogeography of oak stands in South part of Belarus. Proceedings of the National Academy of sciences of Belarus. Biological series 4: 16–19 [In Russian]. (Ковалевич О. А., Каган Д. И., Падутов В. Е. Генетическая структура и геногеография дубрав юга Беларуси // Известия нац. Академии наук Белоруси. Сер. Биол. наук, 2010. № 4. С. 16–19).
Kozlovskiy B. L., Fedorinova O. I., Kuropyatnikov M. V. 2015. New and perspective sample of Quercus robur L. for green building and forestation in the Rostov region. Nauchny`j zhurnal Kubanskogo Gosudarstvennogo Agrarnogo Universiteta [The scientific journal of the KubSAU] 02(106): 580–591 [In Russian]. (Козловский Б. Л., Федоринова О. И., Куропятников М. В. Новый перспективный для зеленого строительства и лесоразведения в Ростовской области образец Quercus robur L. // Научный журнал КубГАУ, 2015. № 106(02). С. 580–591).
Lopez-Aljorna A., Bueno M. A., Aguinagalde I., Martґin J. P. 2007. Fingerprinting and genetic variability in cork oak (Quercus suber L.) elite trees using ISSR and SSR markers. Ann. For. Sci. 64: 773–779.
Talebi S.M., Nohooji M.G., Yarmohammadi M., Azizi N., Matsyura A. 2018. Trichomes morphology and density analysis in some «Nepeta» species of Iran. Mediterranean Botany, 39(1): 51-62. doi:10.5209/MBOT.59574
Melnikova M. N., Senchukova A. L., Pavlov S. D. 2014. Assessment of efficiency of ISSR markers application for genetic differentiation of the Kamchatka mykiss populations Parasalmo (Oncorhynchus) mykiss. In: Sokhranenie bioraznoobraziya Kamchatki i prilegayushchikh morey [Сonservation of biodiversity of Kamchatka and adjacent seas: XV International scientific conference]. Petropavlovsk-Kamchatsky, pp. 67–70 [In Russian]. (Мельникова М. Н., Сенчукова А. Л., Павлов С. Д. Оценка эффективности применения ISSR-маркеров для генетической дифференциации камчатских популяций микижи Parasalmo (Oncorhynchus) mykiss // Сохранение биоразнообразия Камчатки и прилегающих морей: тезисы докладов XV Междунар. науч. конф. (Петропавловск-Камчатский, 18–19 ноября 2014 г.). Петропавловск-Камчатский, 2014. С. 67–70).
Pogrebnyak P. S. 1968. Obshheye lesovodstvo [General forestry]. Kolos, Мoscow, 440 pp. [In Russian] (Погребняк П. С. Общее лесоводство. М.: Колос, 1968. 440 с.).
Postanovleniye Administratsii Rostovskoy oblasti № 418 o pamyatnikakh prirody ot 19 oktyabrya 2006. [Resolution of the administration of the Rostov region № 418 on nature monuments of October 19, 2006] [In Russian]. (Постановление Администрации Ростовской области № 418 о памятниках природы от 19 октября 2006).
Sheykina O. V., Gladkov Y. F., Krivorotov T. N. 2014. ISSR analysis of trees from Pinus sylvestris L. stands growing under contrast soil conditions. In: Problems of botany of South Siberia and Mongolia: Proceedings of the 13th International scientific and practical conference. Koncept, Barnaul, 263–265 pp. [In Russian]. (Шейкина О. В., Гладков Ю. Ф., Криворотова Т. Н. ISSR анализ выборок деревьев из насаждений сосны обыкновенной, произрастающих в контрастных почвенных условиях // Проблемы ботаники Южной Сибири и Монголии: сб. науч. статей по материалам Тринадцатой междунар. научн.-практ. конф. (Барнаул, 20–23 октября 2014 г). Барнаул, 2014. с. 263–265).
Slatkin M. 1987. Gene flow and the geographic structure of natural populations. Science 236: 787–792.
Sukachyov V. N., Dylis N. V. 1964. Osnovy lesnoy biogeotsenologii [Basics of forest biogeocenology]. Nauka, Moscow, 576 pp. [In Russian]. (Сукачёв В. Н., Дылис Н. В. Основы лесной биогеоценологии. М.: Наука, 1964. 576 c.).
Turchin T. Y., Korobova Y. V. 2014. Landscape basis of the study of the floodplain forests of the steppe Pridonye (the Don river area). Vestnik Altayskogo gosudarstvennogo agrarnogo universiteta [Bulletin of Altai state agrarian University] 7(117): 70–74 [In Russian]. (Турчин Т. Я., Коробова Я. В. Ландшафтные основы изучения пойменных лесов степного Придонья // Вестник Алтайского государственного аграрного университета, 2014. № 7(117). С. 70–74).
Wesolowski T., Rowinski P. 2008. Late leaf development in pedunculate oak (Quercus robur). Skandinavian Jornal of Forest Research 23 (5): 686–394.
Zozulin G. M. 1992. Lesa Nizhnego Dona [Forests of the Lower Don]. Izdatelstvo Rostovskogo universiteta, Rostov-na-Donu, 200 рp. [In Russian] (Зозулин Г. М. 1992. Леса Нижнего Дона. Ростов-на-Дону: Изд-во Ростовского ун-та, 1992. 200 с.).
Уведомление об авторских правах
Turczaninowiа является "золотым издателем", так как мы позволяем самоархивирование, но самое главное, мы полностью прозрачны в своих правах.
Авторы могут представить и обсудить свои выводы перед публикацией: в биологических или научных конференций, на допечатной серверах, в общедоступных базах данных, а также в блогах, вики, твиттерах и другие неформальных каналах связи.
Turczaninowiа позволяет авторам внести рукописи (находящуюся в настоящее время на рассмотрении или тех, которые предполагается предоставить в Turczaninowia) для архивирования в некоммерческих, допечатных серверах, таких как ArXiv.
Авторы, публикующиеся в этом журнале согласны со следующими условиями: авторы сохраняют свои авторские права и предоставляют журналу право первой публикации в связи с работой, которая одновременно распространяется по лицензии Creative Commons Attribution и позволяют другим иметь доступ к работе с признанием авторства этой работы и первоначальной публикацией в этом журнале. Авторы могут заключать отдельные, дополнительные договорные соглашения по неисключительному распространению опубликованной версии (например, разместить ее в институтском репозитории или опубликовать в книге), с признанием ее первоначальной публикации в этом журнале.
Авторам разрешается и рекомендуется размещать их работу в Интернете (например, в институциональных хранилищах или на их сайте) до и во время процесса подачи, так как это может привести к продуктивным обменам, а также увеличению цитирования опубликованных работ (см. Политика открытого доступа)
Политика открытого доступа.
Заявление о конфиденциальности
Имена и адреса электронной почты, поданные при публикации в этом журнале, сайт будет использоваться исключительно для заявленных целей данного журнала, и они не будут доступны для любых других целей или какой-либо другой стороне.
Наша публикационная этика журнала основана, в значительной степени, на руководящих принципах и стандартах, разработанных Комитетом по этике публикации (COPE). Соответствующие обязанности и права авторов, рецензентов и редакторов журнала изложены ниже.
ОБЯЗАННОСТИ АВТОРОВ
Отправляя рукопись "Turczaninowia", автор (ы) гарантирует, что они отправляют рукопись как свою собственную, оригинальную работу, и что она не имеет ни были опубликованы ранее, и в настоящее время не рассматривается для публикации в других изданиях. Они также гарантируют, что источники каких-либо идей и / или слов в рукописи, которые не являются их собственными, были должным образом приписаны с помощью соответствующего цитирования.
Автор обычно не должен издавать рукописи, описывающие по существу те же исследования, в нескольких журналах или прочих публикациях. Такая избыточная публикация обычно считается неэтичным поведением, и в случае обнаружения, может привести к отклонению рассматриваемой рукописи рассматриваемого отвергаются, или опубликованная статья будет изъята.
Авторы рукописей, освещающих оригинальные исследования должны представить точный отчет о выполненной работе, в сопровождении объективного обсуждения его значения. Основополагающие данные должны быть представлены точно и полно в рукописи. Рукопись должна содержать достаточно подробные данные и ссылки, чтобы позволять другим дублировать работу. Подтасовка результатов и изготовление поддельных или заведомо неточных утверждений является неэтичным поведением и может быть причиной для отклонения или изъятия рукописи или опубликованной статьи.
Там, где в статьях есть отчеты о использовании коммерческого программного обеспечения, аппаратных средств или других продуктов, авторы должны подать декларацию в начале рукописи, в которой они должны заявить, что никакого конфликта интересов не существует или описать характер любого потенциального конфликта. Все источники финансовой поддержки для исследования также должны быть раскрыты в рукописи.
Автор (ы) рукописи соглашаются, что, если рукопись принята к публикации в "Turczaninowia", опубликованная статья будет характьеризоваться авторскими правами с использованием "Attribution-Unported" лицензии Creative Commons. Эта лицензия позволяет автору (ам) сохранить авторские права, но и позволяет другим свободно копировать, распространять и отображать произведение и производные работы, основанные на ней, при определенных заданных условиях.
Имена авторов должны быть перечислены на статье в порядке их вклада в статью, и все авторы берут на себя ответственность за свои собственные результаты. Только те люди, которые внесли существенный вклад, должны быть перечислены в качестве авторов; те, чьи вклады являются косвенными или маргинальными (например, коллег или руководителей, которые рассмотрели проекты работы или оказывали помощь в корректуре, и руководители научно-исследовательских институтов / центров / лабораторий) должны быть названы в разделе «Выражение признательности» в конце статьи, непосредственно предшествующему Списку литературы.
Автор, подающий статью, должен обеспечить, чтобы все соавторы былм включены в статью, и что все соавторы видели и одобрили окончательный вариант статьи и согласились на его публикацию.
Там, где автор обнаруживает существенную ошибку или неточность в статье, которая была уже опубликована в "Turczaninowia", он / она обязана незамедлительно уведомить редакцию и сотрудничать с ними, чтобы исправить статью или отозвать ее в случае необходимости.
ОБЯЗАННОСТИ РЕЦЕНЗЕНТОВ
В журнале "Turczaninowia" рецензенты выполняют работу для журнала на добровольной основе. Учитывая, что большинство из этих людей находятся в полной занятости, их рецензирование для "Turczaninowia" должна выолняться по мере необходимости, а не быть их главным приоритетом. Рецензенты могут свободно отклонять приглашения для рассмотрения конкретных рукописей по своему усмотрению, например, если их текущая нагрузка, занятость и / или другие обязательства могут сделать ее непомерно высокой для того, чтобы завершить обзор своевременно и уделить должное время рецензированию. Они также не должны принимать рукописи на рецензию, в тематике которых они не чувствуют себя подходящим специалистом.
Рецензенты, которые приняли рукописи, как правило, должны предоставить свои рецензии в течение трех недель. Они должны отказаться от рецензии, если становится очевидным для них на любой стадии, что они не обладают необходимыми знаниями для выполнения рецензии, или что они могут иметь потенциальный конфликт интересов при проведении рецензии (например, в результате конкурентных исследований, совместных или других отношений или связей с кем-либо из авторов, учреждений или компаний, связанных с рукописью).
Информация или идеи, полученные рецензентами в процессе рецензирования должны храниться в тайне и не используются для личной выгоды. Любые рукописи, полученные для рассмотрения, должны рассматриваться как конфиденциальные документы, и не должны быть показаны или обсуждены с другими, если только это не санкционировано редакторами "Turczaninowia".
При проведении своих рецензий, рецензентам необходимо сделать это как можно более объективно, воздерживаться от участия в личной критики автора (ов). Им предлагается высказать свое мнение четко, объясняя и оправдывая все рекомендации. Они всегда должны пытаться представить подробную и конструктивную обратную связь, чтобы помочь автору (ам) в повышении эффективности их работы, даже если рукопись, по их мнению, не подлежит опубликованию.
Рецензенты должны определить в своих рецензиях соответствующие опубликованные работы, которые не были названы автором (ами), вместе с любыми примерами, где не было сделано надлежащее цитирование источников. Они должны привлечь внимание ответственного редактора в отношении каких-либо серьезных сходств между рукописью, поданной на рассмотрение и других опубликованных статей, или статей, о которых им известно, а также предотвратить любые проблемы, которые могут иметь место по отношению к этической приемлемости исследований, представленных в рукописи.
ОБЯЗАННОСТИ РЕДАКЦИИ
Редактор журнала "Turczaninowia" несет полную ответственность за решение о публикации рукописи, которая представляется в "Turczaninowia", и при этом руководствуется политикой журнала, и в соответствии с определенными редакцией "Turczaninowia" юридическими требованиями в отношении клеветы, нарушения авторских прав и плагиата. Редактор может проконсультироваться с заместителями Редактора и другими членами редакционной коллегии, а также с рецензентами, для принятии решений о публикации.
Редакция будет оценивать рукописи с точки зрения ее интеллектуального содержания без учета расы, цвета кожи, пола, сексуальной ориентации, религиозных убеждений, этнического происхождения, гражданства или политической философии автора (ов). Они не будут никому разглашать какую-либо информацию о рукописи, кроме автора (ов), рецензентов и потенциальных рецензентов, а в некоторых случаях членов редакционной коллегии "Turczaninowia" и членов команды управления журналом, в зависимости от обстоятельств. Кроме того, редакция будет прилагать все усилия, чтобы обеспечить целостность процесса слепого рецензирования, не раскрывая личности автора (ов) рукописи для рецензентам этой рукописи, и наоборот.
При оценке рукописи для публикации, в дополнение к рассмотрению стандартных критериев, относящихся к строгости рукописи, качеству ее предоставления, а также ее вклад в область научных знаний, редакторы также будут руководствоваться тем, насколько этические нормы были соблюдены, и вред был сведен к минимуму при проведении исследования. Они также оценивают насколько полученные научные и практические выгоды перевешивают вред в случае конкретного исследования.
Так как "Turczaninowia" приветствует предоставление рукописей из любой страны, необходимо признать, что законы и нормативные акты, касающиеся этики научных исследований и этического утверждения, различаются во всем мире. Таким образом, редакторам, возможно, придется обратиться за разъяснениями в связи с этим к автору (ам) с просьбой о том, чтобы они представили письмо от соответствующего институционального комитета по этике или совета, который одобрил исследование.
Редакция будет руководствоваться Руководством CORE для изъятия статей при рассмотрении любых спорных вопросов, которые были опубликованы в AASRJ. Редакторы готовы работать в тесном сотрудничестве с научно-исследовательскими организациями и учреждениями в соответствии с рекомендациями CORE о сотрудничестве между научно-исследовательскими институтами и журналами в области публикационной этики и этики проведения исследований.
"Turczaninowia" является журналом открытого доступа, что означает, что все его содержимое свободно и доступно бесплатно для пользователя или его / ее учреждения. Пользователи могут читать, загружать, копировать, распространять, печатать, выполнять поиск, делать ссылки на полные тексты статей в этом журнале, не спрашивая предварительного разрешения от издателя или автора. Это легитимно в соответствии с определением BOAI об открытом доступе.
Наш сайт демонстрирует знак Creative Commons, и это исключительное право автора, если он / она хочет, чтобы его / ее статьи были в свободном доступе или нет. Но мы должны опубликовать Резюме и метаданные статьи в полном доступе в любом случае.
