Fissurina inabensis (Graphidaceae, Ascomycota) – новый вид для России с о. Шикотан
УДК 582.293.24:581.95(571.645)
Аннотация
В ходе изучения лихенобиоты о. Шикотан на основании морфологии и анатомии был выявлен новый для России вид – Fissurina inabensis (Vain.) M. Nakan. et Kashiw. Филогенетический анализ, основанный на последовательности ITS изученного образца, подтвердил его близкое родство с F. insidiosa C. Knight et Mitt. и принадлежность к подсемейству Fissurinoideae. Приведено подробное описание морфологии, анатомии и вторичных метаболитов изученных образцов. Ранее Fissurina inabensis был известен из Японии Тайваня и Тайланда, в настоящее время его ареал простирается до о. Шикотан, где находятся самые северные места обитания. Выявление стиктовой кислоты может быть затруднено из-за небольшого ее количества. В этом исследовании стиктовая кислота была обнаружена с помощью ВЭЖХ. Обсуждаются различия в числе и размерах спор у образцов с о. Шикотан и из Японии, описанные в литературе.
Скачивания
Metrics
Литература
Archer A. W. 2009. Graphidaceae. In: Flora of Australia. Vol. 57. Lichens 5. Melbourne: ABRS/ CSIRO. Pp. 84–194.
Darriba D., Posada D., Kozlov A. M., Stamatakis A., Morel B., Flouri T. 2020. ModelTest-NG: a new and scalable tool for the selection of DNA and protein evolutionary models. Molec. Biol. Evol. 37(1): 291–294. DOI: 10.1093/molbev/msz189
Ekanayaka A. H., Hyde K. D., Jones E. B. G., Zhao Q., Bulgakov T. S. 2019. New and known discolichens from Asia and eastern Europe. Asian J. Mycol. 2(1): 48–86. DOI: 10.5943/ajom/2/1/2
Eriksson O. E., Hawksworth D. L. 1998. Outline of the ascomycetes-1998. Syst. Ascomycetum 16: 83–296.
Fée A. L. 1824. Méthode Lichénographique et Genera. Paris: Firmin Didot. 178 pp.
Gardes M., Bruns T. D. 1993. ITS primers with enhanced specificity for basidiomycetes. Application for the identification of mycorrhizae and rust. Molec. Ecol. 2: 113–118. DOI: 10.1111/j.1365-294X.1993.tb00005.x
Херманссон Я., Пыстина Т. Н., Ове-Ларссон Б., Журбенко М. П. Лишайники и лихенофильные грибы Печеро-Илычского заповедника // Флора и фауна заповедников, 2006. Вып. 109. С. 1–79.
Joshi S., Nguyen T. T., Dunzg N. A., Jayalal U., S.-O. Oh, Hur J. S. 2013. Lichen genus Fissurina Fée (Graphidaceae) from Vietnam. Mycotaxon 124: 309–321. DOI: 10.5248/124.309
Joshi S., Upreti D. K., Nguyen T. T., Nguyen A. D., S.-O. Oh, Hur J. S. 2015. A new species of Fissurina and new records of Graphidaceae from Vietnam. Cryptogamie, Mycologie 36(4): 383–397. DOI: 10.7872/crym/v36.iss4.2015.383
Kantvilas G. 2010. The genus Fissurina Fée in Tasmania. Australasian Lichenology 66: 24–29.
Komposch H. 2016. Fissurina subcorallina (lichenized Ascomycota, Ostropales), another drop in the bucket. Herzogia 29: 473–478. DOI: 10.13158/heia.29.2.2016.473
Konoreva L., Chesnokov S., Stepanchikova I., Frolov I., Gagarina L., Tchabanenko S. 2018. Discovery of Coenogonium isidiatum (Coenogoniaceae, Ostropomycetidae) disjunct in northeastern Asia. Opuscula Philolichenum 17: 322–329.
Lücking R., Hodkinson B. P., Leavitt S. D. 2017. The 2016 classification of lichenized fungi in the Ascomycota and Basidiomycota–Approaching one thousand genera. The Bryologist 119(4): 361–416. DOI: 10.1639/0007-2745-119.4.361
Lumbsch H. T., Kraichak E., Parnmen S., Rivas Plata E., Aptroot A., Cáceres M. E. S., Ertz D., Feuerstein S. C., Mercado-Díaz J. A., Staiger B., van den Broeck D., Lücking R. 2014. New higher taxa in the lichen family Graphidaceae (lichenized Ascomycota: Ostropales) based on a three-gene skeleton phylogeny. Phytotaxa 189(1): 39–51. DOI: 10.11646/phytotaxa.189.1.5
Makhija U., Adawadkar B. 2007. Trans-septate species of Acanthothecis and Fissurina from India. Lichenologist 39: 165–185. DOI: 10.1017/S0024282907004756
Mangold A., Martin M. P., Lücking R., Lumbsch T. H. 2008. Molecular phylogeny suggests synonymy of Thelotremataceae within Graphidaceae (Ascomycota: Ostropales). Taxon 57: 476–486.
McDonald T. R., Gaya E., Lutzoni F. 2013. Twenty-five cultures of lichenizing fungi available for experimental studies on symbiotic systems. Symbiosis 59(3): 165–171. DOI: 10.1007/s13199-013-0228-0
Nakanishi M. 1966. Taxonomical studies on the family Graphidaceae of Japan. J. Sci. Hiroshima Univ., Ser. B 11(2): 51–126.
Nakanishi M., Kashiwadani H., Moon K. H. 2001. Notes on the genera Graphina and Graphis (Graphidaceae) in Thailand. Bull. Natl. Sci. Mus., Tokyo, Ser. B 27(2, 3): 47–55.
Nakanishi M., Kashiwadani H., Moon K. H. 2003. Taxonomical notes on Japanese Graphidaceae (Ascomycotina), including some new combinations. Bull. Natl. Sci. Mus., Tokyo, Ser. B 29(2): 83–93.
Ohmura Y., Sugimoto M., Aung M. M., Tanaka N. 2020. Contribution to the knowledge of the Lichen Mycota of Myanmar (I) twenty species newly recorded from Southern Myanmar. Taiwania 65: 548–558.
Okonechnikov K., Golosova O., Fursov M., Team U. 2012. Unipro UGENE: a unified bioinformatics toolkit. Bioinformatics 28(8): 1166–1167. DOI: 10.1093/bioinformatics/bts091
Порядина Л. Н. Лишайники // Разнообразие растительного мира Якутии. Новосибирск: СО РАН, 2005. С. 126–149.
Redinger K. 1935. Die Graphidineen der ersten Regnell’schen Expedition nach Brasilien 1892–1894. III. Graphis, Phaeographis, nebst einem Nachtrage zu Graphina. Arkiv för Botanik 27 A(3): 1–103.
Resl P., Schneider K., Westberg M., Printzen C., Palice Z., Thor G., Fryday A., Mayrhofer H., Spribille T. 2015. Diagnostics for a troubled backbone: testing topological hypotheses of trapelioid lichenized fungi in a large-scale phylogeny of Ostropomycetidae (Lecanoromycetes). Fungal Diversity 73: 239–258. DOI: 10.1007/s13225-015-0332-y
Rivas Plata E., Lücking R., Lumbsch H. T. 2008. When family matters: an analysis of Thelotremataceae (Lichenized Ascomycota: Ostropales) as bioindicators of ecological continuity in tropical forests. Biodivers. et Conservation 17: 1319–1351. DOI: 10.1007/s10531-007-9289-9
Rivas Plata E., Lücking R., Lumbsch H. T. 2012. A new classification for the family Graphidaceae (Ascomyctoa: Lecanoromycetes: Ostropales). Fungal Diversity 52: 107–121. DOI: 10.1007/s13225-011-0135-8
Rivas Plata E., Parnmen S., Staiger B., Mangold A., Frisch A., Weerakoon G., Hernández M. J. E., Cáceres M. E. S., Kalb K., Sipman H. J. M., Common R. S., Nelsen M. P., Lücking R., Lumbsch H. T. 2013. A molecular phylogeny of Graphidaceae (Ascomycota, Lecanoromycetes, Ostropales) including 428 species. MycoKeys 6: 55–94. DOI: 10.3897/mycokeys.6.3482
Schmull M., Miadlikowska J., Pelzer M., Stocker-Wörgötter E., Hofstetter V., Fraker E., Hodkinson B. P., Reeb V., Kukwa M., Lumbsch H. T., Kauff F., Lutzoni F. 2011. Phylogenetic affiliations of members of the heterogeneous lichen-forming fungi of the genus Lecidea sensu Zahlbruckner (Lecanoromycetes, Ascomycota). Mycologia 103(5): 983–1003. DOI: 10.3852/10-234
Sharma B. O., Khadilkar P., Makhija U. 2012. New species and new combinations in the lichen genera Fissurina and Hemithecium from India. Lichenologist 44(3): 339–362. DOI: 10.1017/S0024282911000752
Singh G., Kukwa M., Dal Grande F., Łubek A., Otte J., Schmitt I. 2019. A glimpse into genetic diversity and symbiont interaction patterns in lichen communities from areas with different disturbance histories in Białowieża forest, Poland. Microorganisms 7(9): e335. DOI: 10.3390/microorganisms7090335
Singh P., Singh K. P. 2017. A new species of Fissurina and additional records of Graphidaceae (Ascomycota: Ostropales) from the state of Karnataka, India. NeBIO 8: 21–24.
Smith C. W., Aptroot A., Coppins B. J., Fletcher A., Gilbert O. L., James P. W., Wolseley P. A. (eds.). 2009. The Lichens of Great Britain and Ireland. London: The British Lichen Society. 1046 pp.
Staiger B. 2002. Die Flechtenfamilie Graphidaceae: Studien in Richtung einer natürlicheren Gliederung. Bibliotheca Lichenologica 85: 1–526.
Staiger B., Kalb K. 1999. Acanthothecis and other graphidioid lichens with warty periphysoids or paraphysis-tips. Mycotaxon 73: 69–134.
Staiger B., Kalb K. 2004. Fissurina. In: Lichen Flora of the Greater Sonoran Desert Region. Vol. 2. Tempe, Arizona: Lichens Unlimited, Arizona State University. Pp. 109–110.
Staiger B., Kalb K., Grube M. 2006. Phylogeny and phenotypic variation in the lichen family Graphidaceae (Ostropomycetidea, Ascomycota). Mycol. Res. 110: 765–772. DOI: 10.1016/j.mycres.2006.05.003
Степанчикова И. С., Гагарина Л. В. Глава 8. Сбор, определение и хранение лихенологических коллекций // Флора лишайников России. Биология, экология, разнообразие, распространение и методы изучения лишайников. М.; СПб.: Тов-во науч. изд. КМК, 2014. С. 204–219.
Telfer A. C., Young M. R., Quinn J., Perez K., Sobel C. N., Sones J. E. et al. 2015. Biodiversity inventories in high gear: DNA barcoding facilitates a rapid biotic survey of a temperate nature reserve. Biodivers Data 3: e6313. DOI: 10.3897/BDJ.3.e6313
Урбанавичюс Г. П. Список лихенофлоры России. СПб.: Наука, 2010. 194 с.
Урбанавичюс Г. П. Глава 11. Систематическая классификация таксонов лихенофлоры России // Флора лишайников России. Биология, экология, разнообразие, распространение и методы изучения лишайников. М.; СПб.: Тов-во науч. изд. КМК. 2014. С. 260–291.
Urbanavichus G., Ahti T., Urbanavichene I. 2008. Catalogue of lichens and allied fungi of Murmansk Region, Russia. Norrlinia 17: 1–80.
Wainio E. A. 1918. Lichenes ab A. Yasuda in Japonia collecti. The Botanical Magazine [Tokyo] 32(379): 154–163. DOI: 10.15281/jplantres1887.32.379_154
White T. J., Bruns T. D., Lee S., Taylor J. 1990. Amplification and direct sequencing of fungal ribosomal DNA genes for phylogenies. In: PCR Protocols: A Guide to Methods and Applications. Academic Press, San Diego. Pp. 315–322. DOI: 10.1016/B978-0-12-372180-8.50042-1
Zahlbruckner A. 1923. Catalogus Lichenum Universalis 2(2–3): 145–452. New York: Leipzig. (Reprinted).
Журбенко М. П. Лишайники и лихенофильные грибы Путоранского заповедника // Флора и фауна заповедников, 2000. Вып. 89. С. 1–55.
Уведомление об авторских правах
Turczaninowiа является "золотым издателем", так как мы позволяем самоархивирование, но самое главное, мы полностью прозрачны в своих правах.
Авторы могут представить и обсудить свои выводы перед публикацией: в биологических или научных конференций, на допечатной серверах, в общедоступных базах данных, а также в блогах, вики, твиттерах и другие неформальных каналах связи.
Turczaninowiа позволяет авторам внести рукописи (находящуюся в настоящее время на рассмотрении или тех, которые предполагается предоставить в Turczaninowia) для архивирования в некоммерческих, допечатных серверах, таких как ArXiv.
Авторы, публикующиеся в этом журнале согласны со следующими условиями: авторы сохраняют свои авторские права и предоставляют журналу право первой публикации в связи с работой, которая одновременно распространяется по лицензии Creative Commons Attribution и позволяют другим иметь доступ к работе с признанием авторства этой работы и первоначальной публикацией в этом журнале. Авторы могут заключать отдельные, дополнительные договорные соглашения по неисключительному распространению опубликованной версии (например, разместить ее в институтском репозитории или опубликовать в книге), с признанием ее первоначальной публикации в этом журнале.
Авторам разрешается и рекомендуется размещать их работу в Интернете (например, в институциональных хранилищах или на их сайте) до и во время процесса подачи, так как это может привести к продуктивным обменам, а также увеличению цитирования опубликованных работ (см. Политика открытого доступа)
Политика открытого доступа.
Заявление о конфиденциальности
Имена и адреса электронной почты, поданные при публикации в этом журнале, сайт будет использоваться исключительно для заявленных целей данного журнала, и они не будут доступны для любых других целей или какой-либо другой стороне.
Наша публикационная этика журнала основана, в значительной степени, на руководящих принципах и стандартах, разработанных Комитетом по этике публикации (COPE). Соответствующие обязанности и права авторов, рецензентов и редакторов журнала изложены ниже.
ОБЯЗАННОСТИ АВТОРОВ
Отправляя рукопись "Turczaninowia", автор (ы) гарантирует, что они отправляют рукопись как свою собственную, оригинальную работу, и что она не имеет ни были опубликованы ранее, и в настоящее время не рассматривается для публикации в других изданиях. Они также гарантируют, что источники каких-либо идей и / или слов в рукописи, которые не являются их собственными, были должным образом приписаны с помощью соответствующего цитирования.
Автор обычно не должен издавать рукописи, описывающие по существу те же исследования, в нескольких журналах или прочих публикациях. Такая избыточная публикация обычно считается неэтичным поведением, и в случае обнаружения, может привести к отклонению рассматриваемой рукописи рассматриваемого отвергаются, или опубликованная статья будет изъята.
Авторы рукописей, освещающих оригинальные исследования должны представить точный отчет о выполненной работе, в сопровождении объективного обсуждения его значения. Основополагающие данные должны быть представлены точно и полно в рукописи. Рукопись должна содержать достаточно подробные данные и ссылки, чтобы позволять другим дублировать работу. Подтасовка результатов и изготовление поддельных или заведомо неточных утверждений является неэтичным поведением и может быть причиной для отклонения или изъятия рукописи или опубликованной статьи.
Там, где в статьях есть отчеты о использовании коммерческого программного обеспечения, аппаратных средств или других продуктов, авторы должны подать декларацию в начале рукописи, в которой они должны заявить, что никакого конфликта интересов не существует или описать характер любого потенциального конфликта. Все источники финансовой поддержки для исследования также должны быть раскрыты в рукописи.
Автор (ы) рукописи соглашаются, что, если рукопись принята к публикации в "Turczaninowia", опубликованная статья будет характьеризоваться авторскими правами с использованием "Attribution-Unported" лицензии Creative Commons. Эта лицензия позволяет автору (ам) сохранить авторские права, но и позволяет другим свободно копировать, распространять и отображать произведение и производные работы, основанные на ней, при определенных заданных условиях.
Имена авторов должны быть перечислены на статье в порядке их вклада в статью, и все авторы берут на себя ответственность за свои собственные результаты. Только те люди, которые внесли существенный вклад, должны быть перечислены в качестве авторов; те, чьи вклады являются косвенными или маргинальными (например, коллег или руководителей, которые рассмотрели проекты работы или оказывали помощь в корректуре, и руководители научно-исследовательских институтов / центров / лабораторий) должны быть названы в разделе «Выражение признательности» в конце статьи, непосредственно предшествующему Списку литературы.
Автор, подающий статью, должен обеспечить, чтобы все соавторы былм включены в статью, и что все соавторы видели и одобрили окончательный вариант статьи и согласились на его публикацию.
Там, где автор обнаруживает существенную ошибку или неточность в статье, которая была уже опубликована в "Turczaninowia", он / она обязана незамедлительно уведомить редакцию и сотрудничать с ними, чтобы исправить статью или отозвать ее в случае необходимости.
ОБЯЗАННОСТИ РЕЦЕНЗЕНТОВ
В журнале "Turczaninowia" рецензенты выполняют работу для журнала на добровольной основе. Учитывая, что большинство из этих людей находятся в полной занятости, их рецензирование для "Turczaninowia" должна выолняться по мере необходимости, а не быть их главным приоритетом. Рецензенты могут свободно отклонять приглашения для рассмотрения конкретных рукописей по своему усмотрению, например, если их текущая нагрузка, занятость и / или другие обязательства могут сделать ее непомерно высокой для того, чтобы завершить обзор своевременно и уделить должное время рецензированию. Они также не должны принимать рукописи на рецензию, в тематике которых они не чувствуют себя подходящим специалистом.
Рецензенты, которые приняли рукописи, как правило, должны предоставить свои рецензии в течение трех недель. Они должны отказаться от рецензии, если становится очевидным для них на любой стадии, что они не обладают необходимыми знаниями для выполнения рецензии, или что они могут иметь потенциальный конфликт интересов при проведении рецензии (например, в результате конкурентных исследований, совместных или других отношений или связей с кем-либо из авторов, учреждений или компаний, связанных с рукописью).
Информация или идеи, полученные рецензентами в процессе рецензирования должны храниться в тайне и не используются для личной выгоды. Любые рукописи, полученные для рассмотрения, должны рассматриваться как конфиденциальные документы, и не должны быть показаны или обсуждены с другими, если только это не санкционировано редакторами "Turczaninowia".
При проведении своих рецензий, рецензентам необходимо сделать это как можно более объективно, воздерживаться от участия в личной критики автора (ов). Им предлагается высказать свое мнение четко, объясняя и оправдывая все рекомендации. Они всегда должны пытаться представить подробную и конструктивную обратную связь, чтобы помочь автору (ам) в повышении эффективности их работы, даже если рукопись, по их мнению, не подлежит опубликованию.
Рецензенты должны определить в своих рецензиях соответствующие опубликованные работы, которые не были названы автором (ами), вместе с любыми примерами, где не было сделано надлежащее цитирование источников. Они должны привлечь внимание ответственного редактора в отношении каких-либо серьезных сходств между рукописью, поданной на рассмотрение и других опубликованных статей, или статей, о которых им известно, а также предотвратить любые проблемы, которые могут иметь место по отношению к этической приемлемости исследований, представленных в рукописи.
ОБЯЗАННОСТИ РЕДАКЦИИ
Редактор журнала "Turczaninowia" несет полную ответственность за решение о публикации рукописи, которая представляется в "Turczaninowia", и при этом руководствуется политикой журнала, и в соответствии с определенными редакцией "Turczaninowia" юридическими требованиями в отношении клеветы, нарушения авторских прав и плагиата. Редактор может проконсультироваться с заместителями Редактора и другими членами редакционной коллегии, а также с рецензентами, для принятии решений о публикации.
Редакция будет оценивать рукописи с точки зрения ее интеллектуального содержания без учета расы, цвета кожи, пола, сексуальной ориентации, религиозных убеждений, этнического происхождения, гражданства или политической философии автора (ов). Они не будут никому разглашать какую-либо информацию о рукописи, кроме автора (ов), рецензентов и потенциальных рецензентов, а в некоторых случаях членов редакционной коллегии "Turczaninowia" и членов команды управления журналом, в зависимости от обстоятельств. Кроме того, редакция будет прилагать все усилия, чтобы обеспечить целостность процесса слепого рецензирования, не раскрывая личности автора (ов) рукописи для рецензентам этой рукописи, и наоборот.
При оценке рукописи для публикации, в дополнение к рассмотрению стандартных критериев, относящихся к строгости рукописи, качеству ее предоставления, а также ее вклад в область научных знаний, редакторы также будут руководствоваться тем, насколько этические нормы были соблюдены, и вред был сведен к минимуму при проведении исследования. Они также оценивают насколько полученные научные и практические выгоды перевешивают вред в случае конкретного исследования.
Так как "Turczaninowia" приветствует предоставление рукописей из любой страны, необходимо признать, что законы и нормативные акты, касающиеся этики научных исследований и этического утверждения, различаются во всем мире. Таким образом, редакторам, возможно, придется обратиться за разъяснениями в связи с этим к автору (ам) с просьбой о том, чтобы они представили письмо от соответствующего институционального комитета по этике или совета, который одобрил исследование.
Редакция будет руководствоваться Руководством CORE для изъятия статей при рассмотрении любых спорных вопросов, которые были опубликованы в AASRJ. Редакторы готовы работать в тесном сотрудничестве с научно-исследовательскими организациями и учреждениями в соответствии с рекомендациями CORE о сотрудничестве между научно-исследовательскими институтами и журналами в области публикационной этики и этики проведения исследований.
"Turczaninowia" является журналом открытого доступа, что означает, что все его содержимое свободно и доступно бесплатно для пользователя или его / ее учреждения. Пользователи могут читать, загружать, копировать, распространять, печатать, выполнять поиск, делать ссылки на полные тексты статей в этом журнале, не спрашивая предварительного разрешения от издателя или автора. Это легитимно в соответствии с определением BOAI об открытом доступе.
Наш сайт демонстрирует знак Creative Commons, и это исключительное право автора, если он / она хочет, чтобы его / ее статьи были в свободном доступе или нет. Но мы должны опубликовать Резюме и метаданные статьи в полном доступе в любом случае.
