Эколого-генетическая дифференциация ценопопуляций Quercus robur L. на территории Ростовской области с применением ISSR-маркеров

  • V.A. Chokheli Botanical garden of the Southern Federal University
  • D.I. Kagan Institute of forest NAS of Belarus
  • T.V. Varduny Botanical garden of the Southern Federal University
  • B.L. Kozlovsky Botanical garden of the Southern Federal University
  • M.M. Sereda Botanical garden of the Southern Federal University
  • O.A. Kapralova Botanical garden of the Southern Federal University
  • P.A. Dmitriev Botanical garden of the Southern Federal University
  • V.E. Padutov Institute of forest NAS of Belarus
Ключевые слова: генетическая изменчивость; дуб черешчатый; дубовые насаждения; ожидаемая гетерозиготность; экотоп

Аннотация

Изложены результаты изучения популяционных характеристик ценопопуляций дуба черешчатого (Quercus robur L.): абсолютное число аллелей (na), эффективное число аллелей (ne), ожидаемая гетерозиготность (He). В среднем по всем ценопопуляциям значение ожидаемой гетерозиготности составило 0,3848. Также изучено генетическое разнообразие экотопов на основании среднего уровня ожидаемой гетерозиготности. Показано, что в ряду экотопов «пойменный → аренный → байрачный» наблюдается взаимосвязь между величиной показателя средней ожидаемой гетерозиготности и почвенным гидрологическим режимом.

Скачивания

Данные скачивания пока не доступны.

Литература

Chokheli V., Kagan D., Rajput Vishnu, Kozlovsky B., Sereda M., Shmaraeva A., Khibuhina T., Fedyaeva V., Shishlova Zh., Dmitriev P., Varduny T., Kapralova O., Usatov A. 2018. Genetic variability in cenopopulations of pedunculate oak (Quercus robur) in Rostov Region, Russia, with the use of ISSR-markers. International Journal of Agriculture and Biology 20(11): 2544–2548. DOI: 10.17957/IJAB/15.0802
Chokheli V., Kozlovsky B., Sereda M., Lysenko V., Fesenko I., Varduny T., Kapralova O., Bondarenko E. 2016. Preliminary comparative analysis of phenological varieties of Quercus robur by ISSR-markers. Journal of Botany 2016: Article ID 7910451. DOI: 10.1155/2016/7910451
Coutinho J. P., Carvalho J. A., Lima-Brito J. 2014. Fingerprinting of Fagaceae individuals using inter microsatellite markers. Journal of Genetics 93: 132–140. DOI: 10.1007/s12041-014-0460-2
Coutinho J. P., Carvalho A., Lima-Brito J. 2015. Taxonomic and ecological discrimination of Fagaceae species based on internal transcribed spacer polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism. AoB PLANTS 7: plu079. DOI: 10.1093/aobpla/plu079
Gabitova A. A., Boronnikova S. V., Yanbaev Yu. A. 2012. Ecological impact on genetic variation among populations of pendiculate oak in the Southern Urals. Vestnik BGAU [Bulletin of BSAU] 1: 63–65 [In Russian]. (Габитова А. А., Боронникова С. В., Янбаев Ю. А. Экологическая обусловленность межпопуляционной генетической дифференциации дуба черешчатого на Южном Урале // Вестник БГАУ, 2012. № 1. С. 63–65).
Grativol C., Lira-Medeiros C. F., Hemerly A. S., Ferreira P. C. G. 2011. High efficiency and reliability of inter-simple sequence repeats (ISSR) markers for evaluation of genetic diversity in Brazilian cultivated Jatropha curcas L. accessions. Mol. Biol. Rep. 38(7): 4245–4256. DOI: 10.1007/s11033-010-0547-7
Jankowski K., Truba M., Jankowska J., Czeluscinski W., Wisniewska-Kadzajan B., Malinowska E., Matsyura A. 2018. Effects of soil conditioners on lawn grass growth in different year seasons. Applied Ecology and Environmental Research, 16 (4): 3755-3765. doi:10.15666/aeer/1604_37553765
Kamalova I. I., Karpechenko N. A., Veprincev V. N. 2014. Experience of using RAPD-markers for identification of clones and families on seed plantations of English oak]. In: VI Syezd Vavilovskogo obshhestva genetikov i selektsionerov (VOGiS) i assotsciirovannyye geneticheskiye simpoziumy [VI Congress of Vavilov society of geneticists and breeders (VSGaB) and associated genetic symposia]. SO RAN, Rostov-on-Don, 172–173 pp. [In Russian]. (Камалова И. И., Карпеченко Н. А., Вепринцев В. Н. Опыт использования RAPD-маркеров для идентификации клонов и семей на семенных плантациях дуба черешчатого // VI Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров (ВОГиС) и ассоциированные генетические симпозиумы (Ростов-на-Дону, 15–20 июня 2014 г.): Тез. докл. Ростов-на-Дону: Изд-во СО РАН, 2014. С. 172–173).
Karpechenko K. A., Semenova V. A., Zemlyanukhina O. A., Karpechenko N. A. 2011. PCR based molecular genetic method for analysis of specific forms of oak (Quercus robur). In: Sokhranenie lesnykh geneticheskikh resursov Sibiri [Conservation of forest genetic resources of Siberia: Proceedings of the 3rd International meeting]. SO RAN, Krasnoyarsk, 68 р. [In Russian]. (Карпеченко К. А., Семенова В. А., Землянухина О. А., Карпеченко Н. А. Использование молекулярно-генетического метода на основе ПЦР для формоспецифического анализа дуба (Quercus robur) // Сохранение лесных генетических ресурсов Сибири: Материалы 3-го Междунар. совещ. (Красноярск, 23–29 августа 2011 г.). Красноярск: Изд-во СО РАН, 2011. С. 68).
Kovalevich O. A., Kahan D. I., Padutov V. E. 2010. Genetic structure and gene genogeography of oak stands in South part of Belarus. Proceedings of the National Academy of sciences of Belarus. Biological series 4: 16–19 [In Russian]. (Ковалевич О. А., Каган Д. И., Падутов В. Е. Генетическая структура и геногеография дубрав юга Беларуси // Известия нац. Академии наук Белоруси. Сер. Биол. наук, 2010. № 4. С. 16–19).
Kozlovskiy B. L., Fedorinova O. I., Kuropyatnikov M. V. 2015. New and perspective sample of Quercus robur L. for green building and forestation in the Rostov region. Nauchny`j zhurnal Kubanskogo Gosudarstvennogo Agrarnogo Universiteta [The scientific journal of the KubSAU] 02(106): 580–591 [In Russian]. (Козловский Б. Л., Федоринова О. И., Куропятников М. В. Новый перспективный для зеленого строительства и лесоразведения в Ростовской области образец Quercus robur L. // Научный журнал КубГАУ, 2015. № 106(02). С. 580–591).
Lopez-Aljorna A., Bueno M. A., Aguinagalde I., Martґin J. P. 2007. Fingerprinting and genetic variability in cork oak (Quercus suber L.) elite trees using ISSR and SSR markers. Ann. For. Sci. 64: 773–779.
Talebi S.M., Nohooji M.G., Yarmohammadi M., Azizi N., Matsyura A. 2018. Trichomes morphology and density analysis in some «Nepeta» species of Iran. Mediterranean Botany, 39(1): 51-62. doi:10.5209/MBOT.59574
Melnikova M. N., Senchukova A. L., Pavlov S. D. 2014. Assessment of efficiency of ISSR markers application for genetic differentiation of the Kamchatka mykiss populations Parasalmo (Oncorhynchus) mykiss. In: Sokhranenie bioraznoobraziya Kamchatki i prilegayushchikh morey [Сonservation of biodiversity of Kamchatka and adjacent seas: XV International scientific conference]. Petropavlovsk-Kamchatsky, pp. 67–70 [In Russian]. (Мельникова М. Н., Сенчукова А. Л., Павлов С. Д. Оценка эффективности применения ISSR-маркеров для генетической дифференциации камчатских популяций микижи Parasalmo (Oncorhynchus) mykiss // Сохранение биоразнообразия Камчатки и прилегающих морей: тезисы докладов XV Междунар. науч. конф. (Петропавловск-Камчатский, 18–19 ноября 2014 г.). Петропавловск-Камчатский, 2014. С. 67–70).
Pogrebnyak P. S. 1968. Obshheye lesovodstvo [General forestry]. Kolos, Мoscow, 440 pp. [In Russian] (Погребняк П. С. Общее лесоводство. М.: Колос, 1968. 440 с.).
Postanovleniye Administratsii Rostovskoy oblasti № 418 o pamyatnikakh prirody ot 19 oktyabrya 2006. [Resolution of the administration of the Rostov region № 418 on nature monuments of October 19, 2006] [In Russian]. (Постановление Администрации Ростовской области № 418 о памятниках природы от 19 октября 2006).
Sheykina O. V., Gladkov Y. F., Krivorotov T. N. 2014. ISSR analysis of trees from Pinus sylvestris L. stands growing under contrast soil conditions. In: Problems of botany of South Siberia and Mongolia: Proceedings of the 13th International scientific and practical conference. Koncept, Barnaul, 263–265 pp. [In Russian]. (Шейкина О. В., Гладков Ю. Ф., Криворотова Т. Н. ISSR анализ выборок деревьев из насаждений сосны обыкновенной, произрастающих в контрастных почвенных условиях // Проблемы ботаники Южной Сибири и Монголии: сб. науч. статей по материалам Тринадцатой междунар. научн.-практ. конф. (Барнаул, 20–23 октября 2014 г). Барнаул, 2014. с. 263–265).
Slatkin M. 1987. Gene flow and the geographic structure of natural populations. Science 236: 787–792.
Sukachyov V. N., Dylis N. V. 1964. Osnovy lesnoy biogeotsenologii [Basics of forest biogeocenology]. Nauka, Moscow, 576 pp. [In Russian]. (Сукачёв В. Н., Дылис Н. В. Основы лесной биогеоценологии. М.: Наука, 1964. 576 c.).
Turchin T. Y., Korobova Y. V. 2014. Landscape basis of the study of the floodplain forests of the steppe Pridonye (the Don river area). Vestnik Altayskogo gosudarstvennogo agrarnogo universiteta [Bulletin of Altai state agrarian University] 7(117): 70–74 [In Russian]. (Турчин Т. Я., Коробова Я. В. Ландшафтные основы изучения пойменных лесов степного Придонья // Вестник Алтайского государственного аграрного университета, 2014. № 7(117). С. 70–74).
Wesolowski T., Rowinski P. 2008. Late leaf development in pedunculate oak (Quercus robur). Skandinavian Jornal of Forest Research 23 (5): 686–394.
Zozulin G. M. 1992. Lesa Nizhnego Dona [Forests of the Lower Don]. Izdatelstvo Rostovskogo universiteta, Rostov-na-Donu, 200 рp. [In Russian] (Зозулин Г. М. 1992. Леса Нижнего Дона. Ростов-на-Дону: Изд-во Ростовского ун-та, 1992. 200 с.).
Опубликован
2018-12-11
Как цитировать
Chokheli, V., Kagan, D., Varduny, T., Kozlovsky, B., Sereda, M., Kapralova, O., Dmitriev, P., & Padutov, V. (2018). Эколого-генетическая дифференциация ценопопуляций Quercus robur L. на территории Ростовской области с применением ISSR-маркеров. Turczaninowia, 21(4), 161-167. https://doi.org/https://doi.org/10.14258/turczaninowia.21.4.16
Раздел
Научные статьи

Наиболее читаемые статьи этого автора (авторов)